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(一)單卵雙胞胎的DNA甲基化特征與多發性硬化症臨床不一致
DNA methylation signatures of monozygotic twins clinically discordant for multiple sclerosis
期刊: Nature Communications
影響因子:12.353
發表單位：薩爾布呂肯大學、慕尼黑大學
发表时间: 2019年
研究背景
多发性硬化症（Multiple SclerosisK8·凯发【体育中国】集团旗舰厅官网登录入口mk体育(mksport集团)股份公司熊猫体育「中国Panda」App下载官方网站，MS）在年轻人中是一种主要的神经性系统疾病kg体育·(中国China)官方网站，也是一种自身免疫疾瞜g体育·(中国China)官方网站意昂体育·[官方网]有限公司官网。桓眉膊≡诘ヂ阉蟹⒉÷式系虴ON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」，这有力地证明了表观遗传因 素的参与作用login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台kg体育·(中国China)官方网站熊猫体育「中国Panda」App下载官方网站。DNA 甲基化的改变可以引起转录的改变EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」，在人类的许多疾病中已经观察到异常的 DNA 甲基化DB娱乐官网入口(中国大陆)有限公司官网，并且一些环境因素（吸烟、维生素 D 缺乏等）可能与 MS 相关DB娱乐官网入口(中国大陆)有限公司官网熊猫体育「中国Panda」App下载官方网站。为了 进一步揭露MS 致病机理mk体育(mksport集团)股份公司EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」意昂体育·[官方网]有限公司官网，作者选择了45对 MS 临床表现不一致的单卵双胞胎进行甲基化相关的研究login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台熊猫体育「中国Panda」App下载官方网站CQ9电子·(china)唯一官方网站。
方法流程
45對MS不和諧的單卵雙胞胎的PBMC樣本
1.Infinium Methylation EPIC BeadChip(45对样本)
2.TDBS驗證(45對樣本)
3.WGBS檢測(4对女性样本)
1.EPIC檢測：DMP、DMR、DVP、CNV分析；EWAS分析
2.WGBS檢測：DMR、部分甲基化区域分析
研究結論
本研究确定了新的候选表观遗传标记（cg27037608、cg25345365）意昂体育·[官方网]有限公司官网熊猫体育「中国Panda」App下载官方网站login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台，并强调治疗效果和遗传背景是主要的混杂因素PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMEEON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」熊猫体育「中国Panda」App下载官方网站，为表观 MS 研究提供了重要参考mk体育(mksport集团)股份公司login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台。
研究方法
16例AK樣本、19例cSCC樣本、12例健康control表皮樣本
1.Infinium Methylation EPIC BeadChip(16例AK、18例cSCC、12例健康control表皮样本)
2.IHC(分別11例AK、cSCC、健康表皮樣本)
3.全外顯子測序(分別10例AK、cSCC樣本)
1.甲基化譜分析
2.CPG位點與TCGA癌症數據層次聚類分析
3.增強子甲基化差異甲基化分析
4.通路分析
三、研究結果
1. AK 与 cSCC 表现出类似的异常甲基化模式
850K 甲基化芯片檢測12例正常表皮样本、16例 AK 表皮样本、18例 cSCC 表皮样本mk体育(mksport集团)股份公司，主成分分析和散点图显示 AK 和 cSCC 之间存在高度重叠kg体育·(中国China)官方网站K8·凯发【体育中国】集团旗舰厅官网登录入口login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台，且都与正常表皮之间存在显著差 异甲基化kg体育·(中国China)官方网站，但两者没有檢測到显著差异的甲基化熊猫体育「中国Panda」App下载官方网站。
图4 AK 和 cSCC 表现出类似的异常甲基化模式
2. AK 和 cSCC 表现出典型的干细胞甲基化特征
通过对 non-CpG 甲基化水平分析CQ9电子·(china)唯一官方网站kg体育·(中国China)官方网站，发现 AK 和 cSCC 样品中 DNA 甲基转移酶的表达显著增加意昂体育·[官方网]有限公司官网，表现出典型的干细胞甲基化特征；通过对一组独立样本（11例健康皮肤、11例 AK 和11例 cSCC ）的免疫组化分析意昂体育·[官方网]有限公司官网，证实了 AK 和 cSCC 的干细胞特征EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」。
图5 AK 和 cSCC 表现出典型的干细胞甲基化特征
3. AK/cSCC 存在的两种亚型
角蛋白基因簇的差异甲基化分析显示熊猫体育「中国Panda」App下载官方网站，在 AK 和 cSCC 样品中存在两种不同的角蛋白甲基化模式；增强子甲基化谱的无监督层次聚类与全外显子测序（10例 AK 和 cSCC）显示CQ9电子·(china)唯一官方网站， AK/cSCC 亚类分别与未分化的表皮干细胞和分化程度更高的角质形成细胞有关PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME熊猫体育「中国Panda」App下载官方网站，而且两个亚群的 DNA 甲基化模式之间没有相关性kg体育·(中国China)官方网站DB娱乐官网入口(中国大陆)有限公司官网。结果表明 AK 和 cSCC 的两种亚型分别源自不同的角 化细胞分化阶段K8·凯发【体育中国】集团旗舰厅官网登录入口EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」，并且独立于突变谱login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台。
图6 增强子甲基化的层次聚类
研究結論
该研究结果有力地说明了 AK/cSCC 亚群的细胞来源有两种不同的类型mk体育(mksport集团)股份公司EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」，而且支持 AK 和 cSCC 来自表皮干细胞的两个（或多个）分化阶段的模型EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」CQ9电子·(china)唯一官方网站意昂体育·[官方网]有限公司官网，这些细胞类型的详细表征及其临床意义 的分析将是未来研究的重要方面kg体育·(中国China)官方网站。
參考文獻
[1] Souren NY, Gerdes L A, Lutsik P, et al. DNA methylation signatures of monozygotic twins clinically discordant for multiple sclerosis[J]. Nature Communications,
2019(10):1-12.
(原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41467-019-09984-3)
[2] Rodriguez-Paredes M, Bormann F, Raddatz G, et al. Methylation profiling identifies two subclasses of squamous cell carcinoma related to distinct cells of origin
[J]. Nature Communications, 2018, 9(1).
（原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41467-018-03025-1）
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