基因組測序>
建庫測序>
人类基因組測序>
动植物基因組測序>
微生物基因組測序>
轉錄調控測序>
表觀組測序>
單細胞測序>
空間轉錄組>
基因分型>
質譜分析>
蛋白組學分析>
代謝組學分析>
免疫定量>
轉化醫學>
轉化醫學及临床试验服务>
伴隨診斷一站式解決方案>
多組學聯合分析>
數據質控
对下机数据进行數據質控以及标准化官网- 杏宇注册| 一站式娱乐平台- 会员登陆中心,通过样本 beta 值密度曲线图、PCA、箱线图等展示样本间、组间的甲基化情况以及相互关系PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMEMG不朽情缘·(中国版区)官方网站PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站,能够对项目样本的整体情况有个直观了解意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐官网- 杏宇注册| 一站式娱乐平台- 会员登陆中心PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME,初步分析样本情况是否满足预期的实验设计官网- 杏宇注册| 一站式娱乐平台- 会员登陆中心PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站MG不朽情缘·(中国版区)官方网站。
差異甲基化位點分析
差异甲基化位点(differentially methylated CpG positions意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」,DMP)是甲基化研究的主要环节意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐,对于寻找后续 biomarker 有重要意义熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台。DMP 分析通过比对 case 组与 control 组的 β 值获得Δβ值PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站,从而得到 case 组差异甲基化位点;DMP的展示可以通过绘制火山图、散点图、热图等来反应组间整体差异情况B·体育【中国官】B-sports登录入口杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网。
图3 DMP 火山示例图
差異性甲基化區域
在基因组中差异甲基化位 点经常会成 簇出现PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站,形成一段差異性甲基化區域(Differentially Methylated Region熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」,DMR)意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」官网- 杏宇注册| 一站式娱乐平台- 会员登陆中心杏耀平台|杏耀注册|杏耀登录|杏耀官网,区段的范围小至数百 bp意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站,大到Mb 级别PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME杏耀平台|杏耀注册|杏耀登录|杏耀官网,DMR被认为在基因印记调节中起重要作用意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网MG不朽情缘·(中国版区)官方网站。
图4 DMR 长度密度分布示例图
Gene Ontology
Gene Ontology(简称 GO)是基因功能国际标准分类体系PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网。作为基因本体联合会(Gene Onotology Consortium)所建立的数据库PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站,它旨在建立一个适用于各种物种的熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME,对基因和蛋白质功能进行限定和描述的意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」,并能随着研究不断深入而更新的语言词汇标准官网- 杏宇注册| 一站式娱乐平台- 会员登陆中心B·体育【中国官】B-sports登录入口PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站。GO 分为分子功能(Molecular Function)、生物过程(Biological Process)、和细胞组成(Cellular Component)三个部分B·体育【中国官】B-sports登录入口。基因或蛋白质可以通过 ID 对应用于对应到 TermPG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站,即功能类别或者细胞定位MG不朽情缘·(中国版区)官方网站官网- 杏宇注册| 一站式娱乐平台- 会员登陆中心杏耀平台|杏耀注册|杏耀登录|杏耀官网。
图5 显著富集GO term示例图
KEGG pathway
KEGG 可利用分子水平信息杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台,尤其是大型分子数据集生成的基因組測序数据和其他高通量实验技术的实用程序数据库资源官网- 杏宇注册| 一站式娱乐平台- 会员登陆中心,把从得到的基因目录与更高级别的细胞、物种和生态系统水平的系统功能关联起来官网- 杏宇注册| 一站式娱乐平台- 会员登陆中心意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐,用以了解高级功能和生物系统(如细胞、生物和生态系统)PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMEB·体育【中国官】B-sports登录入口。
图6 显著富集 KEGG pathway 示例图
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