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數據質控

对下机数据进行數據質控以及标准化官网- 杏宇注册| 一站式娱乐平台- 会员登陆中心,通过样本 beta 值密度曲线图、PCA、箱线图等展示样本间、组间的甲基化情况以及相互关系PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMEMG不朽情缘·(中国版区)官方网站PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站,能够对项目样本的整体情况有个直观了解意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐官网- 杏宇注册| 一站式娱乐平台- 会员登陆中心PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME,初步分析样本情况是否满足预期的实验设计官网- 杏宇注册| 一站式娱乐平台- 会员登陆中心PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站MG不朽情缘·(中国版区)官方网站。

差異甲基化位點分析

差异甲基化位点(differentially methylated CpG positions意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」,DMP)是甲基化研究的主要环节意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐,对于寻找后续 biomarker 有重要意义熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台。DMP 分析通过比对 case 组与 control 组的 β 值获得Δβ值PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站,从而得到 case 组差异甲基化位点;DMP的展示可以通过绘制火山图、散点图、热图等来反应组间整体差异情况B·体育【中国官】B-sports登录入口杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网。 图3 DMP 火山示例图

差異性甲基化區域

在基因组中差异甲基化位 点经常会成 簇出现PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站,形成一段差異性甲基化區域(Differentially Methylated Region熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」,DMR)意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」官网- 杏宇注册| 一站式娱乐平台- 会员登陆中心杏耀平台|杏耀注册|杏耀登录|杏耀官网,区段的范围小至数百 bp意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站,大到Mb 级别PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME杏耀平台|杏耀注册|杏耀登录|杏耀官网,DMR被认为在基因印记调节中起重要作用意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网MG不朽情缘·(中国版区)官方网站。 图4 DMR 长度密度分布示例图

Gene Ontology

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KEGG pathway

KEGG 可利用分子水平信息杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台,尤其是大型分子数据集生成的基因組測序数据和其他高通量实验技术的实用程序数据库资源官网- 杏宇注册| 一站式娱乐平台- 会员登陆中心,把从得到的基因目录与更高级别的细胞、物种和生态系统水平的系统功能关联起来官网- 杏宇注册| 一站式娱乐平台- 会员登陆中心意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐,用以了解高级功能和生物系统(如细胞、生物和生态系统)PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMEB·体育【中国官】B-sports登录入口。 图6 显著富集 KEGG pathway 示例图

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