杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口·(中国区)杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口-翻譯組Ribo-seq-結果展示-諾禾致源

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期刊：Nature; IF 64.8
樣本類型：哺乳動物細胞樣本
分组：对照组 vs 脂多糖处理；对照组 vs 细菌感染组

主要結果：

1.核糖體結合片段中約90%爲蛋白編碼基因熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站熊猫体育「中国Panda」直播官方网站，約10%爲非編碼轉錄本;
2.结合轉錄組測序计算翻译效率（TE）乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户XC-sports(中国区)-体育官方网站入口熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站，得到lncRNA翻译的直接证据；
3.細菌感染過程中高表達的lncRNA中約35%具有核糖體印記；
4.在对照组vs脂多糖处理组中：通过RibORF、RiboCode、ORFfinder分别预测具有核糖体印记的lncRNA的小ORF（长度小于300nt的 sORF)星空·全站体育APP(集团)官方版OG视讯·(中国区)官方平台网站，总结起始密码子分布规律：ATG 45%意昂体育·[官方网]有限公司官网，CTG 20%球友会-qy球友会-（中国）千亿球友会beat·365(中文)-唯一官方认证网站OG视讯·(中国区)官方平台网站，GTG 19%乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户球友会-qy球友会-（中国）千亿球友会，TTG 16%星空·全站体育APP(集团)官方版OG视讯·(中国区)官方平台网站。
5.通過RibORF和RiboCode對非經典ORF進行分析球友会-qy球友会-（中国）千亿球友会，鑒定了96個與已知蛋白質編碼基因組的RRS和TE值相同的lncRNA；
6.脂多糖處理顯著提高aw112010的表達熊猫体育「中国Panda」直播官方网站OG视讯·(中国区)官方平台网站XC-sports(中国区)-体育官方网站入口，且預測其含有sORF熊猫体育「中国Panda」直播官方网站球友直播-球友直播app下载_球友直播app熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站，質譜及蛋白産物檢測發現該sORF可得到穩定的蛋白産物OG视讯·(中国区)官方平台网站球友会-qy球友会-（中国）千亿球友会意昂体育·[官方网]有限公司官网，且在細菌感染過程中會顯著積累球友会-qy球友会-（中国）千亿球友会熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站XC-sports(中国区)-体育官方网站入口。基因敲除實驗進一步驗證了該蛋白的功能熊猫体育「中国Panda」直播官方网站。

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Ribo-seq揭示哺乳動物熱激響應機制

期刊：Nature;IF 64.8
樣本類型：哺乳動物細胞
样本分组：对照组 vs 热激处理

主要結果：

1. 热激选择性提高上调mRNA的5’UTR甲基化水平原理在于抑制了去甲基化酶FTO的作用;
2. 热激不仅导致转录本5‘UTR甲基化水平和转录水平提高球友会-qy球友会-（中国）千亿球友会，通常也会增加翻译水平（核糖体印记）乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户星空·全站体育APP(集团)官方版，尤其是热休克蛋白；
3.选择热休克蛋白Hsp70进一步研究：敲除YTHDF2以后星空·全站体育APP(集团)官方版，Hsp70 mRNA的5’UTR甲基化下降球友会-qy球友会-（中国）千亿球友会熊猫体育「中国Panda」直播官方网站，mRNA水平不变熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户，但Hsp70蛋白合成量下降熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站星空·全站体育APP(集团)官方版，原因在于甲基化水平降低抑制了不依赖帽结构的翻译水平意昂体育·[官方网]有限公司官网熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站。

結論： 選擇性翻譯與甲基化的關系：用蟲熒光素做標記beat·365(中文)-唯一官方认证网站星空·全站体育APP(集团)官方版，將m6A轉染乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户beat·365(中文)-唯一官方认证网站球友直播-球友直播app下载_球友直播app。如果基因有5’UTR熒光信號就會增強beat·365(中文)-唯一官方认证网站意昂体育·[官方网]有限公司官网。並以ApppG代替m7Gm帽子XC-sports(中国区)-体育官方网站入口星空·全站体育APP(集团)官方版。發現只有5’UTR存在的時候才會有甲基化選擇性翻譯的現象乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户意昂体育·[官方网]有限公司官网XC-sports(中国区)-体育官方网站入口，表明這是一種促進了不依賴帽結構的翻譯過程球友直播-球友直播app下载_球友直播app球友会-qy球友会-（中国）千亿球友会。通過Ribo-seq的motif分析星空·全站体育APP(集团)官方版，發現熱休克蛋白的5’UTR中103A甲基化對翻譯起始起關鍵作用XC-sports(中国区)-体育官方网站入口。

Ribo-seq：Ribo-seq：揭示食管鱗狀細胞癌的發生機制

期刊：Signal Transduction and Targeted Therapy; IF 39.3
樣本類型：人食管組織
分組：人食管癌症組織VS癌旁組織

主要結果：

1.確定關鍵分子：核糖體蛋白RPS15在體外和體內均能促進ESCC細胞的轉移和增殖OG视讯·(中国区)官方平台网站球友会-qy球友会-（中国）千亿球友会beat·365(中文)-唯一官方认证网站。
2.確定目標分子功能：RPS15與IGF2BP1相互作用XC-sports(中国区)-体育官方网站入口球友会-qy球友会-（中国）千亿球友会熊猫体育「中国Panda」直播官方网站，以m6A依賴的方式識別並直接結合MKK6和MAPK14mRNA的3′UTRXC-sports(中国区)-体育官方网站入口，促進核心p38MAPK通路蛋白的翻譯（Ribo-seq）意昂体育·[官方网]有限公司官网熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站。
3.下遊機制探究：葉酸通過靶向RPS15對ESCC具有治療作用熊猫体育「中国Panda」直播官方网站球友会-qy球友会-（中国）千亿球友会，並與順氯氨鉑聯合增強了這種作用球友会-qy球友会-（中国）千亿球友会意昂体育·[官方网]有限公司官网OG视讯·(中国区)官方平台网站。

結論： 本研究確定了核糖體蛋白RPS15促進食管癌細胞的轉移和增殖beat·365(中文)-唯一官方认证网站球友会-qy球友会-（中国）千亿球友会，RPS15通過p38MAPK途徑促進ESCC的進展OG视讯·(中国区)官方平台网站乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户，RPS15抑制劑可能作爲潛在的抗ESCC藥物beat·365(中文)-唯一官方认证网站星空·全站体育APP(集团)官方版熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站。RPS15的功能和機制研究不僅有助于了解ESCC的發病機制熊猫体育「中国Panda」直播官方网站XC-sports(中国区)-体育官方网站入口乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户，而且爲更好地了解蛋白質翻譯在癌細胞轉移中如何發揮關鍵作用提供了機會乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户。

References：
[1] Jackson R, Kroehling L, Khitun A, et al. The translation of non-canonical open reading frames controls mucosal immunity [J]. 2018. Nature.
[2] Zhou J, Wan J, Gao XW, et al. Dynamic m6A mRNA methylation directs translational control of heat shock response[J]. 2015.Nature.
[3] Zhao Y, Li Y, Zhu R, et al. RPS15 interacted with IGF2BP1 to promote esophageal squamous cell carcinoma development via recognizing m6A modification[I]. Signal Transduct Target Ther. 2023 Jun 2; 8(1):224.