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目標區域測序

病毒靶向捕獲測序

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技術參數

樣品要求

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測序平台

樣本類型:組織樣本
样本总量:组织10-20mg ,血
液2-3ml ,细胞系≥107个细胞

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信息分析

基本分析	個性化分析
1. 人基因组和病毒基因组比对 2. 病毒亚型鉴定 3. 病毒基因组突变检测 4. 病毒整合位点检测 5. 高频整合位点分析 6. 病毒整合位点分布展示	1. 病毒进化分析 2. 病毒整合的临床关联分析 3. 病毒整合与基因表达关联分析

病毒捕獲測序研究肝癌HBV整合及致癌偏好性

Genomic and oncogenic preference of HBV integration in hepatocellular carcinoma

發表期刊：Nature Genetics
影響因子：12.123
发表单位：中國人民解放军第二军医大学
發表年份：2016年10月

研究背景

肝癌在所有癌症發病率中位列第五位意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!九游会·J9-中国官方网站|真人游戏第一品牌，致死率居第三意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!九游会·J9-中国官方网站|真人游戏第一品牌。乙肝病毒（HBV）或丙肝病毒（HCV）慢性感染是誘發肝癌的主要因素bsports(中国区)B—sports体育登录入口九游会·J9-中国官方网站|真人游戏第一品牌。其中意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!意昂凯捷4（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」bsports(中国区)B—sports体育登录入口，HBV基因組經常會整合到宿主基因組中K8凯发就来凯发集团【China官网】天生赢家一触即发尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版，引起宿主基因組的損傷和染色體不穩定K8凯发就来凯发集团【China官网】天生赢家一触即发尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版，促進肝癌的發生K8凯发就来凯发集团【China官网】天生赢家一触即发。

方法流程

取材

測序

分析

426位HBV相關肝癌患者的腫瘤組織和瘤旁組織

1. 捕获探针：针对HBV的8种亚型设计探针
2. 測序平台：HiSeq 2000 PE100

1. 与人和病毒参考基因组进行比对
2. 病毒整合位点检测
3. 临床数据关联分析

研究結果

1. HBV整合与染色体不稳定性
在所有樣本中共發現4225個HBV整合位點意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光，大多整合位點在人基因組上隨機分布意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光意昂凯捷4（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」，40%的斷點分布于HBV基因組1400~1900bp區域意昂凯捷4（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」杏宇娱乐-杏宇注册登录平台尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版。腫瘤組織中整合位點數高于癌旁組織九游会·J9-中国官方网站|真人游戏第一品牌，對應分別有826個、303個基因發生病毒整合尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版K8凯发就来凯发集团【China官网】天生赢家一触即发，僅64個基因爲二者共有杏宇娱乐-杏宇注册登录平台九游会·J9-中国官方网站|真人游戏第一品牌，說明腫瘤和癌旁的病毒整合模式不同九游会·J9-中国官方网站|真人游戏第一品牌。同時發現斷點顯著富集于腫瘤的CpG島及端粒附近意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!，表明HBV偏向整合到維持染色體穩定性的功能區DB旗舰·(中国区)官方app网站有限公司官网杏宇娱乐-杏宇注册登录平台。
2. HBV整合影响靶基因表达
在腫瘤組織和正常組織中分別發現88個、17個HBV高頻整合的基因意昂凯捷4（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」K8凯发就来凯发集团【China官网】天生赢家一触即发，除已知基因意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!九游会·J9-中国官方网站|真人游戏第一品牌，還發現新的整合基因意昂凯捷4（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」，這些基因在轉錄水平和蛋白表達水平均發生改變bsports(中国区)B—sports体育登录入口意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!，如發生HBV整合的TERT表達上調意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!九游会·J9-中国官方网站|真人游戏第一品牌，且患者生存期明顯縮短bsports(中国区)B—sports体育登录入口。
3. HBV整合与临床数据关联
研究發現男性肝癌患者HBV整合發生率明顯高于女性患者bsports(中国区)B—sports体育登录入口意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!DB旗舰·(中国区)官方app网站有限公司官网，且偏向整合于第2、17號染色體的大量區域以及核蛋白區域K8凯发就来凯发集团【China官网】天生赢家一触即发九游会·J9-中国官方网站|真人游戏第一品牌意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!。

研究結論

本研究全面描繪了肝癌中的HBV整合圖譜bsports(中国区)B—sports体育登录入口K8凯发就来凯发集团【China官网】天生赢家一触即发尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版，揭示了HBV傾向整合到發生DNA突變或重排的區域尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版九游会·J9-中国官方网站|真人游戏第一品牌DB旗舰·(中国区)官方app网站有限公司官网，同時新發現了一些HBV高頻整合的靶基因九游会·J9-中国官方网站|真人游戏第一品牌。HBV整合可以促進慢性病毒感染患者向肝癌的致癌轉化K8凯发就来凯发集团【China官网】天生赢家一触即发杏宇娱乐-杏宇注册登录平台。