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基因組測序>
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建庫測序>
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人类基因組測序>
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动植物基因組測序>
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微生物基因組測序>
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轉錄調控測序>
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表觀組測序>
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單細胞測序>
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空間轉錄組>
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基因分型>
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質譜分析>
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蛋白組學分析>
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分子育種>
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基因合成>
意昂体育app下载安装官网 RFX6 蛋白截断突变与 MODY 型糖尿病的外显率降低有关
Heterozygous RFX6 protein truncating variants are associated with MODY with reduced penetrance [1]
期 刊：Nature Communications
影響因子：11.878
发表单位：University of Exeter Medical School, UK
發表時間：2017.10
研究背景
心房颤动（Atrial Fibrillationlogin_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台，AF）是最常见的持续性心律失常熊猫体育「中国Panda」直播官方网站login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台。发病率随年龄增长而增加意昂凯捷4（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台，75岁人群患病率约为10%澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站，全年龄段人群患病率约为1%MK(体育科技有限公司)体育·官方网站澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台。发生房颤时熊猫体育「中国Panda」直播官方网站杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88，心房会丧失收缩功能意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS，血液在心房内瘀滞从而形成血栓fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88意昂凯捷4（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS，易造成脑梗塞、心力衰竭、脑卒中等严重后果意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTSfun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88，但病因仍未完全了解意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTSU8国际·[集团]有限公司官网。
在较为年轻（＜66岁）的AF患者中意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS意昂凯捷4（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」，遗传性因素往往在致病因素中占据了更为主导的地位fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88，因此在早发性 AF 患者中进行了大规模、深度覆盖的全基因組測序澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88MK(体育科技有限公司)体育·官方网站。
研究結果
首先对38名表现出强 MODY 表型的歐洲（不包含芬兰人）先证者进行了 TRS 測序（含有29种已知单基因型糖尿病的 Panel）login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台星空·体育(中国集团)官方网站。发现RTX6 基因发生了杂合无义突变MK(体育科技有限公司)体育·官方网站login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台，也称为蛋白截断突变（PTV）U8国际·[集团]有限公司官网意昂凯捷4（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS，这种突变会导致肽链合成提前终止澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站。与 ExAC 数据库中的大量样本进行对比星空·体育(中国集团)官方网站意昂凯捷4（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」，结果表明熊猫体育「中国Panda」直播官方网站fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88，在 MODY 的发现队列（38人）中星空·体育(中国集团)官方网站，
RFX6 PTV的杂合突变频率显著较高（5.5% vs 0.045％）杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载。在348个样本组成的 MODY 重复队列中意昂凯捷4（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」U8国际·[集团]有限公司官网意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS，
RFX6 PTV的杂合突变频率也显著高于gnomAD 数据库中的频率（1.15% vs 0.045％）星空·体育(中国集团)官方网站熊猫体育「中国Panda」直播官方网站MK(体育科技有限公司)体育·官方网站。这种突变在芬兰人中的频率更高杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台，约为普通歐洲人群的10倍U8国际·[集团]有限公司官网澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站，并且均为 p.His293Leufs 型变异（第293位氨基酸由 His 转变为 Leu）意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载星空·体育(中国集团)官方网站。
之後的研究發現星空·体育(中国集团)官方网站澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站，當
RFX6 发生 PTV 突变时星空·体育(中国集团)官方网站杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载，人群在25岁时的患病率为27％login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台U8国际·[集团]有限公司官网，51岁时的患病率为78％澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站，显著低于HNF1A（25歲爲70%意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTSU8国际·[集团]有限公司官网，50歲爲97%）和 HNF4A（25歲爲55%澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站熊猫体育「中国Panda」直播官方网站，50歲91％）突變login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台，這暗示了 RFX6 雜合突變可以減少糖尿病的外顯率U8国际·[集团]有限公司官网。
研究結論
在该研究中fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88，通过对未知病因的 MODY 病例进行目标区域靶向測序星空·体育(中国集团)官方网站MK(体育科技有限公司)体育·官方网站，并将 PTV 的频率与大型数据库进行了比较杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88，从而确定了一种新的杂合 RFX6 PTV 突变与 MODY 发生相关意昂凯捷4（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」。
參考文獻
Patel K A, Kettunen J, Laakso M, et al. Heterozygous RFX6 protein truncating variants are associated with MODY with reduced penetrance[J]. Nature communications, 2017, 8(1): 888.
案例二 早期乳腺癌多区取样研究亚克隆多样性
Subclonal diversification of primary breast cancer revealed bymultiregion sequencing
期刊：Nature Medicine
影響因子：27.363
合作单位：Cancer Genome Project, Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, UK.
發表時間：2015年6月
研究背景
癌症基因組學研究可以爲由潛在生物學異常而導致的特有腫瘤提供具有針對性的治療策略MK(体育科技有限公司)体育·官方网站。腫瘤的異質性和亞克隆突變使得乳腺癌治療困難重重杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载，目前針對于早期乳腺癌進化模式知之甚少澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站。
方法流程
50個早期乳腺癌患者U8国际·[集团]有限公司官网澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88，呈現3個亞型ER+HER2-、ER+HER2+和ER-pgR-HER2-login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88，共303個樣本
1.Illumina HiSeq,PE75/PE100 2.全基因組測序：tumor:40x; normal:31x 目標區域測試：160x
1.与人类参考基因组NCBI build 37进行比对 2.检测somatic mutation 3.高頻突變基因篩選 4.克隆進化分析
研究結果
1. 乳腺癌多区取样及亚克隆发展
采用全基因組測序和目標區域測序相结合的測序策略杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载意昂凯捷4（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」，目標區域測序包含了360个文献报道与乳腺癌相关的基因澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站。8个样本显示出点突变在不同部位上显著的异质性星空·体育(中国集团)官方网站U8国际·[集团]有限公司官网。也有证据显示亚克隆并不会严格的分开意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS星空·体育(中国集团)官方网站，会有部分重叠的情况fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88星空·体育(中国集团)官方网站。
2. 亚克隆的异质性和耐药性
數據顯示亞克隆異質水平跟組織學沒有相關性MK(体育科技有限公司)体育·官方网站。來自于同一塊腫瘤組織亞克隆分支時間和異質性水平成很好的相關性杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载熊猫体育「中国Panda」直播官方网站。治療前後U8国际·[集团]有限公司官网星空·体育(中国集团)官方网站意昂凯捷4（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」，亞克隆分支長度相似U8国际·[集团]有限公司官网意昂凯捷4（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」，說明化療藥物引導的突變只占極小的部分意昂凯捷4（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」。
3. 亚克隆SV的多样性
分析全基因組的數據得到亞克隆SV的比例與亞克隆點突變比例相匹配login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台，發生在癌症早期的SV會繼續到癌症的晚期星空·体育(中国集团)官方网站fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88，複雜的染色體變異是一個常見特征U8国际·[集团]有限公司官网MK(体育科技有限公司)体育·官方网站，在一些樣本中複雜事件會發生在腫瘤形成前後login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台，有些會導致癌基因的亞克隆擴增login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载，同時也會改變腫瘤後期的進化及提供表型的多樣性意昂凯捷4（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88。
研究結論
該文發現原發性乳腺癌亞克隆多樣性會存在于不同個體之間及不同部位的組織上login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台。沒有明顯證據證明澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载，大多數乳腺癌相關基因的點突變和重排會發生到乳腺癌的早期或晚期fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88星空·体育(中国集团)官方网站杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载。而在其中13個患者中發現可能成爲潛在靶向突變是亞克隆U8国际·[集团]有限公司官网，這些亞克隆與化療産生抗性和轉移可能性相關意昂凯捷4（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载MK(体育科技有限公司)体育·官方网站。該文章揭示了在原發性乳腺癌的臨床治療上亞克隆和腫瘤進化研究的重要性熊猫体育「中国Panda」直播官方网站U8国际·[集团]有限公司官网。
