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多組學聯合分析>
完美基因組—抵達探索生物奧秘的終點
T2T（Telomere-to-telomere）基因组：是指组装的无gap的端粒到端粒的基因组 （在rDNA区域、性染色体、着丝粒中可能允许少量gaps）；具有非常高的Q值（准 确性）和BUSCO值（完整性）；在原始数据与组装之间具有最小的结构性错误球友(官方)App下载-球友直播意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台。-
1.策略推薦
60X HiFi + 100X Ultra-long ONT（N50 > 100K）+ 50X 二代 + 100X Hic
（1）60X HiFi数据使用Hifiasm进行组装杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载意昂体育·(China)体育官方网站-EON SPORTS，得到HiFi contigHOME-杏鑫平台-杏鑫娱乐共创美好未来，较常规组装（30X）深度更高意昂体育·(China)体育官方网站-EON SPORTSEON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」，可得到完整性、连续性更高的contig骨架基因组HOME-杏鑫平台-杏鑫娱乐共创美好未来球友(官方)App下载-球友直播，同时还可为单体型-T2T提供深度支持意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台，进行单体型-T2T组装；
（2）100X Ultra-long ONT（N50 > 100K）数据使用Nextdenovo进行组装意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台，并使用50X Illumina数据进行纠错J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌，得到ONT contigZ6尊龙旗舰厅官网入口·凯时(中国区)官方网站J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台，使用Ultra-long ONT组装目的是得到片段超长的contig基因组；
（3）100X Hic数据经Hicup质控Z6尊龙旗舰厅官网入口·凯时(中国区)官方网站，对Hifi contig及ONT contig两版基因组进行Allhic挂载得到基因组染色体版本；
以HiFi 染色体级别基因组作为Reference意昂体育·(China)体育官方网站-EON SPORTS，将Ultra-long ONT染色体级别基因组与其进行相互MergeJ9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载意昂体育·(China)体育官方网站-EON SPORTS，最终得到T2T级别基因组杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载LOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」。 -
2.T2T基因組質量評估
T2T基因組組裝完成後EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」Z6尊龙旗舰厅官网入口·凯时(中国区)官方网站，需要進行以下評估內容：
1）基因組評估：包含BUSCO評估（>95%）、序列一致性評估(>98%)、QV評估（>45）等HOME-杏鑫平台-杏鑫娱乐共创美好未来J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌。
2）與該物種發表最佳版本基因組進行共線性評估：Mummer球友(官方)App下载-球友直播EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」。
3）著絲粒、端粒鑒定：對著絲粒、端粒進行預測EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」意昂体育·(China)体育官方网站-EON SPORTS，若研究較成熟物種（序列已知）杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载球友(官方)App下载-球友直播，將其與基因組直接比對查驗球友(官方)App下载-球友直播意昂体育·(China)体育官方网站-EON SPORTS。例如：人類端粒（TTAGGG）、擬南芥端粒（TTTAGGG）意昂体育·(China)体育官方网站-EON SPORTS。
4）著絲粒也可使用Chip-seq、FISH等實驗進行驗證MG不朽情缘·(中国版区)官方网站杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台。
5）填補Gap區域可使用PCR實驗進行驗證Z6尊龙旗舰厅官网入口·凯时(中国区)官方网站。
諾禾致源端粒、着丝粒鉴定及已发表基因组比对
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3.適用物種推薦
動物：哺乳動物、淡水魚類（詳細評估）EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」。
植物：1G以內常規物種EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台Z6尊龙旗舰厅官网入口·凯时(中国区)官方网站，及玉米、大豆、擬南芥等EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台Z6尊龙旗舰厅官网入口·凯时(中国区)官方网站。
特殊物種：部分異源多倍體可承諾（僅限棉花、油菜等）球友(官方)App下载-球友直播LOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」。 -
4.應用方向
更多內容MG不朽情缘·(中国版区)官方网站HOME-杏鑫平台-杏鑫娱乐共创美好未来，可掃描側邊欄"一對一業務咨詢"二維碼添加科研服務經理咨詢MG不朽情缘·(中国版区)官方网站。
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