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原核轉錄組測序

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The genome and transcriptome of Trichormus sp. NMC-1: insights into adaptation to
extreme environments on the Qinghai-Tibet Plateau

期刊： Scientific Reports
影響因子：4.259
發表單位：上海生物多樣性和生態工程教育部重點實驗室；中科院昆明植物研究所
發表年份：2016年7月

一、研究背景

青藏高原不仅是世界上最高且规模最大的高原在线娱乐_用户注册(中国)娱乐中心首页大厅，同时具有包括极大的温差、低氧浓度、低压、强紫外线辐射以及狂风等在内的极端环境熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站，且有许多独特的环境球友会-qy球友会-（中国）千亿球友会杏XC彩sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版mk体育(mksport集团)股份公司，包括雪山、盐水湖泊及干旱沙漠等杏XC彩sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版mk体育(mksport集团)股份公司熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站，具有极高的生物多样性在线娱乐_用户注册(中国)娱乐中心首页大厅杏XC彩sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口，为研究适应性进化提供了一个理想的天然实验室球友会-qy球友会-（中国）千亿球友会在线娱乐_用户注册(中国)娱乐中心首页大厅尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版。蓝藻是最早的光合放氧生物球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台，几乎可以将所有纬度范围的地区作为栖息地mk体育(mksport集团)股份公司尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口，对于全球生态具有相当大的重要性；蓝藻可以适应可变渗透压、持续低温及强烈的紫外线辐射等环境OG视讯·(中国区)官方平台网站mk体育(mksport集团)股份公司球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台。

二、方法流程

取材

建庫

測序

分析

培养 Trichormus sp. NMC-1 的菌落在线娱乐_用户注册(中国)娱乐中心首页大厅尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版，选择 10℃（与湖水温度相近）为实验组球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台，28℃为对照组杏XC彩sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版。实验组设 3 个生物学重复尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce，对照组设 2 个生物学重复mk体育(mksport集团)股份公司球友会-qy球友会-（中国）千亿球友会。

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HiSeq X 測序策略：PE150

基于直系同源基因的進化分析
差异基因的 COG 及 KEGG 富集分析

三、研究結果

1.青藏高原蓝藻基因组序列是 5.9 Mbmk体育(mksport集团)股份公司PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版，具有 39.2%的 G+C 含量杏XC彩sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口，总共包括5362 个 CDSOG视讯·(中国区)官方平台网站。系统进化树表明球友会-qy球友会-（中国）千亿球友会熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站，这一菌株属于 Trichormus 和 Anabaena 集群在线娱乐_用户注册(中国)娱乐中心首页大厅球友会-qy球友会-（中国）千亿球友会。T. sp. NMC-1 和6个近缘种之间的基因组对比显示杏XC彩sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站，在 T. sp. NMC-1 基因组中尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口杏XC彩sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版，功能未知的基因占据了更高的比例(28.12%)mk体育(mksport集团)股份公司球友会-qy球友会-（中国）千亿球友会。
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四、研究結論

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