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轉錄調控測序

數據質控

测序得到的原始测序序列(Sequenced Reads)或者 raw readsPA视讯(中国区)官网 - PlayAceCQ9(电子中国)在线官方网站,里面含有带接头的、低质量的readsVSport -(CHINA) 胜利因您更精彩尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录意昂体育·(China)体育官方网站-EON SPORTS,为了保证信息分析质量PG(官方电子平台)有限公司-China直营官方网站,必须对raw reads过滤球客岛-足球篮球赛事直播平台VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩,得到clean readsB体育(China)中国官方网站-B SPORTSVSport -(CHINA) 胜利因您更精彩,后续分析都基于clean readsPG(官方电子平台)有限公司-China直营官方网站B体育(China)中国官方网站-B SPORTS球客岛-足球篮球赛事直播平台。在测序过程中会存在一定的错误率CQ9(电子中国)在线官方网站,测序错误率分布检查可以反映测序数据的质量球客岛-足球篮球赛事直播平台HOME-沐鸣娱乐「强保障平台,更省心注册」PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰。

參考序列比對

將比對到基因組上的reads分布情況進行統計PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰,定位區域分爲Exon(外顯子)、
Intron(內含子)和Intergenic(基因間區)尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录。reads與參考基因組比對率B体育(China)中国官方网站-B SPORTS,
指比對到參考基因組上的reads數目除以有效測序數據的reads數據B体育(China)中国官方网站-B SPORTS,可反映樣本的基因組拼接注釋水平CQ9(电子中国)在线官方网站。

基因表達水平分析

一個基因表達水平的直接體現就是其轉錄本的豐度情況CQ9(电子中国)在线官方网站,轉錄本豐度越高B体育(China)中国官方网站-B SPORTSPG(官方电子平台)有限公司-China直营官方网站HOME-沐鸣娱乐「强保障平台,更省心注册」,則基因表達水平越高PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰。我們通過所有基因的FPKM密度圖以及小提琴圖對不同實驗條件下的基因表達水平進行比較B体育(China)中国官方网站-B SPORTSHOME-沐鸣娱乐「强保障平台,更省心注册」,可以直觀的獲得不同實驗條件下基因表達水平的情況球客岛-足球篮球赛事直播平台PA视讯(中国区)官网 - PlayAceCQ9(电子中国)在线官方网站。

差異基因表達分析

用火山圖可以直觀展示不同實驗條件下差異基因的分布情況球客岛-足球篮球赛事直播平台B体育(China)中国官方网站-B SPORTS意昂体育·(China)体育官方网站-EON SPORTS。差異表達基因以火山圖、韋恩圖及聚類熱圖等豐富的形式展示樣本間差異基因表達的情況意昂体育·(China)体育官方网站-EON SPORTSCQ9(电子中国)在线官方网站VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩。

融合基因分析

融合基因可能會導致具有新的或不同功能的基因産物生成PG(官方电子平台)有限公司-China直营官方网站B体育(China)中国官方网站-B SPORTS,這些異常活性的蛋白質會發揮癌基因的作用HOME-沐鸣娱乐「强保障平台,更省心注册」VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩球客岛-足球篮球赛事直播平台。此外,某些原癌基因還可能與一個新的啓動子發生融合,從而激活下遊癌基因的表達球客岛-足球篮球赛事直播平台。

差異基因GO富集分析

差异基因GO富集柱状图尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录,直观的反映出在生物过程(biological process)、细胞组分(cellular component)
和分子功能(molecular function)尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰,富集的GOterm上差异基因的个数分布情况VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩。
可挖掘差異基因的功能及所在的信號通路尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录,縮小基因篩選的範圍PA视讯(中国区)官网 - PlayAce球客岛-足球篮球赛事直播平台CQ9(电子中国)在线官方网站。

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