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2024年1月3日    编辑:諾禾致源

肌痛性腦脊髓炎/慢性疲勞綜合征(ME/CFS)是一种终生严重衰弱性疾瞝ehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88。挥幸恍〔糠秩俗钪胀耆蹈碖8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口,患者会出现多种使人衰弱的症状lehu国际乐虎(China)-官方平台网站,包括严重乏力、劳累后不适以及认知、睡眠和直立功能障碍lehu国际乐虎(China)-官方平台网站。这些症状的严重程度各不相同K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发,因此约25%的患者在整个疾病期间都在家中甚至卧床不起杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网球友直播,球友体育,球友足球直播,球友体育直播。近年来bsports(中国区)B—sports体育登录入口,DNA甲基化测序技术已被应用于研究ME/CFS患者的疾病状态lehu国际乐虎(China)-官方平台网站,许多研究发现患者与對照组之间存在重要差异杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网。2022年10月K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司,International Journal of Molecular Sciences杂志上发表了一篇题为Dynamic Epigenetic Changes during a Relapse and Recovery Cycle in Myalgic Encephalomyelitis/Chronic Fatigue Syndrome[1]的研究論文lehu国际乐虎(China)-官方平台网站杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站,該研究利用簡化基因組甲基化測序(RRBS)等技术揭示了DNA甲基化可以作为肌痛性腦脊髓炎/慢性疲勞綜合征(ME/CFS)疾病變異的表觀標記物XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版,表明ME/CFS在複發-恢複周期中的動態表觀遺傳變化杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88。接下来小编带大家一起学习下这篇高分文章:

 

 

Dynamic Epigenetic Changes during a Relapse and Recovery Cycle in Myalgic Encephalomyelitis/Chronic Fatigue Syndrome[1]

肌痛性腦脊髓炎/慢性疲勞綜合征複發和恢複周期期間的動態表觀遺傳變化

發表雜志:International Journal of Molecular Sciences

影響因子:6.208

發表時間:2022.10.06

本文亮點:該研究利用簡化基因組甲基化測序(RRBS)等技術並結合精准醫學來繪制兩名選定的ME / CFS患者的基因組變化K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口,揭示了DNA甲基化可以作为肌痛性腦脊髓炎/慢性疲勞綜合征(ME/CFS)疾病變異的表觀標記物lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司lehu国际乐虎(China)-官方平台网站杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网,表明ME/CFS在複發-恢複周期中的動態表觀遺傳變化K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站。


研究內容

 

1 DNA甲基化變化的動態分析

從兩名ME/CFS患者和健康年龄匹配的對照组在11个月内的5个间隔时间点采集血液K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口,这5个时间点绘制了ME / CFS患者复发的健康状态(圖1A)K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口。使用差异甲基化分析包(DMAP)平台分析来自三个受试者的5个样品中每个样品的代表性亚硫酸氢盐测序(RRBS)的数据K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发球友直播,球友体育,球友足球直播,球友体育直播lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司,为每个患者和對照(圖1B)-命名为 ME-iVMFXC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版球友直播,球友体育,球友足球直播,球友体育直播。通过比较每个CpG位点的变异性来研究每个个体内时间点甲基组的变化K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口。进一步分析表明球友直播,球友体育,球友足球直播,球友体育直播lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司,患者比對照组更具可变性K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发bsports(中国区)B—sports体育登录入口球友直播,球友体育,球友足球直播,球友体育直播,尽管不像单个CpG位点甲基化比较那样明显K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司。与两名患者相比杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站,對照组显示变异性评分较低K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88bsports(中国区)B—sports体育登录入口。和以前一样杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版,与P1相比fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88球友直播,球友体育,球友足球直播,球友体育直播lehu国际乐虎(China)-官方平台网站,患有更衰弱的ME / CFS的P2在分析的特征中表现出更高水平的变异性杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网。

 

1 研究设计

2 每个个体计算的变异性的线圖

 

患者常見的ME-iVMF甲基化模式

ME-iVMF的持续分析仅包括存在于三个个体的所有15个样本中的片段杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网,总共产生了577个常见片段lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司。對这577个常见片段的初步研究涉及在差异甲基化分析中将两名患者与匹配的對照单独进行比较lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版。观察患者和對照组在这些片段处的平均甲基化差异球友直播,球友体育,球友足球直播,球友体育直播。为了进一步分析患者与基因体内對照组的差异甲基化片段的数据lehu国际乐虎(China)-官方平台网站lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网,进行富集分析bsports(中国区)B—sports体育登录入口K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口,在P1与C相比含有差异甲基化片段的26个基因中杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版,确定了两种途径;尼古丁成瘾和吗啡成瘾XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版,由于基因GNASbsports(中国区)B—sports体育登录入口,CACNA1AGABRD的存在bsports(中国区)B—sports体育登录入口K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口,與C相比杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发,P2中含有差異甲基化片段的23個基因顯示出兩種蛋白質結構域的途徑;轉化生長因子-β(TGF-β)家族和免疫球蛋白C-2型杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站,從基因中鑒定IGSF9B、OPCML、GDF7、CERS1和LINGO3XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88lehu国际乐虎(China)-官方平台网站。

 

3 ME-iVMFs的甲基化变化热圖

 

識別與複發條件相關的甲基化模式

爲了找到與患者複發相關的變化片段lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口,來自整個577个ME-iVMF的数据与患者自我报告的健康评分相关lehu国际乐虎(China)-官方平台网站。皮尔逊相关系数是使用每个片段的甲基化百分比与个体自我报告的健康评分之间的关联来计算的lehu国际乐虎(China)-官方平台网站。两名患者的片段显示出与基因组元件的许多相互作用XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版lehu国际乐虎(China)-官方平台网站,包括与基因体的直接重叠以及GeneHancer中记录的调控元件杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发,USCS基因组浏览器记录了调控元件和基因体之间的调控相互作用集群lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版。由于这些片段在其复发和恢复状态中显示出个体甲基化状态的明显变化bsports(中国区)B—sports体育登录入口K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口,因此對许多相关基因的调节行为具有重要意义杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司。

 

 

与對照组相比杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站,复发相关甲基化特征表现出显着的变化

在複發条件下球友直播,球友体育,球友足球直播,球友体育直播K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口,两名患者体内的甲基化有明显的变化fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88。如前所述lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发,所有这些片段在P1的复发状态下被祱D谆疿C sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司,如圖4A球友直播,球友体育,球友足球直播,球友体育直播K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发,表明相应的调控特征可能對相关基因有下游上调lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口。

 

4 动态DNA甲基化变异与自我报告的患者健康状况相关


本文結論

從兩名患者中分离出DNAK8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网,并定期与健康年龄/性别匹配對照K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口,捕获每种情况下的患者复发情况fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88bsports(中国区)B—sports体育登录入口。在複發恢复周期中获得代表性降低的DNA甲基化测序圖谱bsports(中国区)B—sports体育登录入口杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版。与對照组相比K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司球友直播,球友体育,球友足球直播,球友体育直播,两名患者在采样期间表现出显着更大的甲基组变异性(10-20倍)杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站。在複發期间球友直播,球友体育,球友足球直播,球友体育直播lehu国际乐虎(China)-官方平台网站K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口,在基因组的调节活性区域中检测到两名患者的甲基组圖谱的变化K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发,这些区域分别与157和127个下游基因相关球友直播,球友体育,球友足球直播,球友体育直播lehu国际乐虎(China)-官方平台网站,表明代谢lehu国际乐虎(China)-官方平台网站,免疫和炎症功能紊乱K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88。ME / CFS患者的健康后复发导致其DNA甲基化组的功能重要变化fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发,虽然两名患者之间存在差异K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发,但导致非常相似的生理受损杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88。DNA甲基化作为正在进行的ME/CFS中疾病变异性的标志lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司球友直播,球友体育,球友足球直播,球友体育直播,對降低复发频率的策略具有实际应用bsports(中国区)B—sports体育登录入口lehu国际乐虎(China)-官方平台网站XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版。

 

參考文獻

[1] Helliwell AM, Stockwell PA, Edgar CD, Chatterjee A, Tate WP. Dynamic Epigenetic Changes during a Relapse and Recovery Cycle in Myalgic Encephalomyelitis/Chronic Fatigue Syndrome. Int J Mol Sci. 2022 Oct 6;23(19):11852. doi: 10.3390/ijms231911852. PMID: 36233152; PMCID: PMC9570248.




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