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2024年1月4日    编辑:諾禾致源

DNA甲基化是最常見的表觀遺傳修飾之一PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMElehu国际乐虎(China)-官方平台网站,研究人員很早就在癌症中發現DNA甲基化異常球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台。研究發現其對基因表達、基因組穩定性和腫瘤發生發展具有重要的作用球友(官方)App下载-球友直播。DNA甲基化標志物檢測具有簡單、經濟和組織特異性的特征PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMElehu国际乐虎(China)-官方平台网站球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台,可用于腫瘤早期診斷、預後評估和療效監測等MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长DB真人旗舰·(中国官方)集团有限公司官网,具有很高的臨床應用價值CQ9电子·(china)唯一官方网站。

細胞遊離DNA( cell-free DNAPA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME,cfDNA) 是在细胞凋亡、坏死等过程释放到血液中的核酸混合物意昂4体育(中国)数字娱乐技术创新平台,其组分中包含循环肿瘤DNA( circulating tumor DNACQ9电子·(china)唯一官方网站PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME球友(官方)App下载-球友直播,ctDNA)MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长熊猫体育app官方入口(中国官方)认证体育赛事直播平台球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台,近年来被广泛应用于肿瘤诊疗、无创产前诊断、免疫系统疾病诊疗等领域[1]PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME意昂4体育(中国)数字娱乐技术创新平台。小編整理了兩篇相關高分文獻PA视讯(中国区)官网 - PlayAce,看看大佬們如何開展cfDNA甲基化的應用研究MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长。

 

惡性周圍神經鞘瘤(MPNST)預後預測

原名:Genomic Patterns of Malignant Peripheral Nerve Sheath Tumor (MPNST) Evolution Correlate with Clinical Outcome and Are Detectable in Cell-Free DNA

中文:惡性周圍神經鞘瘤(MPNST)進化的基因組模式與臨床結果相關PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMECQ9电子·(china)唯一官方网站熊猫体育app官方入口(中国官方)认证体育赛事直播平台,並可在cfDNA檢測到

期刊:Cancer Discovery

影響因子:38.272

 

研究背景

惡性周圍神經鞘瘤(MPNST)是一种侵袭性软组织肉瘤CQ9电子·(china)唯一官方网站,多发于Ⅰ型神经纤维瘤(NF1)患者MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长熊猫体育app官方入口(中国官方)认证体育赛事直播平台DB真人旗舰·(中国官方)集团有限公司官网。研究人员对95个肿瘤样本的全基因组和多区域外顯子組測序、转录组和甲基化分析意昂4体育(中国)数字娱乐技术创新平台DB真人旗舰·(中国官方)集团有限公司官网MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长,揭示了肿瘤进化中的基因组变化情况PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME。在NF1的双等位基因失活后lehu国际乐虎(China)-官方平台网站熊猫体育app官方入口(中国官方)认证体育赛事直播平台DB真人旗舰·(中国官方)集团有限公司官网,无论是否伴随多梳抑制复合体2(PRC2)激活CDKN2A或TP53的缺失都会导致体细胞拷贝数变异(SCNA)CQ9电子·(china)唯一官方网站PA视讯(中国区)官网 - PlayAce。肿瘤演化的不同途径与PRC2基因的失活和H3K27三甲基化(H3K27me3)状态有关lehu国际乐虎(China)-官方平台网站熊猫体育app官方入口(中国官方)认证体育赛事直播平台。H3K27me3缺失的肿瘤会有大量染色体丢失伴随全基因组加倍和8号染色体扩增DB真人旗舰·(中国官方)集团有限公司官网球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台熊猫体育app官方入口(中国官方)认证体育赛事直播平台,并表现出较低水平的免疫细胞浸润意昂4体育(中国)数字娱乐技术创新平台。在肿瘤样本和細胞遊離DNA (cfDNA)中检测到的特异性SCNAs可作为H3K27me3缺失和免疫浸润的替代意昂4体育(中国)数字娱乐技术创新平台DB真人旗舰·(中国官方)集团有限公司官网,并进行预后预测MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长熊猫体育app官方入口(中国官方)认证体育赛事直播平台球友(官方)App下载-球友直播。

 

MPNSTs的基因組和病理分類[2]

 

研究路線

 

解決的問題

MPNST是NF1患者最常見的死亡和發病原因PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME,是一種相對常見的腫瘤易感性綜合征熊猫体育app官方入口(中国官方)认证体育赛事直播平台PA视讯(中国区)官网 - PlayAce。研究結果表明球友(官方)App下载-球友直播,腫瘤或cfDNA的體細胞拷貝數和甲基化譜可以作爲早期診斷的生物標志物球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台熊猫体育app官方入口(中国官方)认证体育赛事直播平台,並將患者分爲預後和治療相關的亞組球友(官方)App下载-球友直播意昂4体育(中国)数字娱乐技术创新平台。該研究內容將有助于幫助MPNST患者在早期發現相關病症MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长意昂4体育(中国)数字娱乐技术创新平台球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台,並通過相關手術切除進行治療從而提升患者生存率lehu国际乐虎(China)-官方平台网站MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长CQ9电子·(china)唯一官方网站。

 

小細胞肺癌的檢測和分型

原名:cfDNA methylome profiling for detection and subtyping of small cell lung cancers

中文:cfDNA甲基组分析用于小細胞肺癌的檢測和分型

期刊:Nature Cancer

影響因子:23.177

 

研究背景

小細胞肺癌(SCLC常)被认为是一种同质性疾病PA视讯(中国区)官网 - PlayAcePA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMEDB真人旗舰·(中国官方)集团有限公司官网,但最近研究显示DB真人旗舰·(中国官方)集团有限公司官网,基于主要转录因子(TF)的表达熊猫体育app官方入口(中国官方)认证体育赛事直播平台lehu国际乐虎(China)-官方平台网站PA视讯(中国区)官网 - PlayAce,SCLC的几个亚型在形态学和转录组上都存在异质性球友(官方)App下载-球友直播意昂4体育(中国)数字娱乐技术创新平台DB真人旗舰·(中国官方)集团有限公司官网。临床前研究表明意昂4体育(中国)数字娱乐技术创新平台,SCLC亚型表现出动态可塑性DB真人旗舰·(中国官方)集团有限公司官网,并具有不同的治疗脆弱性意昂4体育(中国)数字娱乐技术创新平台PA视讯(中国区)官网 - PlayAce球友(官方)App下载-球友直播。为评估SCLC全基因组DNA的甲基化模式球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台PA视讯(中国区)官网 - PlayAce熊猫体育app官方入口(中国官方)认证体育赛事直播平台,研究團隊采用了不含亚硫酸氢盐的、基于富集的二代测序(NGS)方法熊猫体育app官方入口(中国官方)认证体育赛事直播平台,结合了内部文库制备方法球友(官方)App下载-球友直播,允许在富集前进行样品多重检测(T7-MBD-seq)意昂4体育(中国)数字娱乐技术创新平台球友(官方)App下载-球友直播。该研究描述了一个强大的全基因组游离DNA(cfDNA)甲基化分析方法PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME,能够实现对SCLC的灵敏检测、疾病进展的监测以及主要亚型分型MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长。结果展示了cfDNA甲基化分析作为一种普遍适用的液体活检方法在临床实践中具有潜在的应用价值DB真人旗舰·(中国官方)集团有限公司官网。

 

CDX/PDX模型和cfDNA樣本中准確檢測SCLC甲基化模式的流程[3]

 

研究路線

解決的問題

研究提供的高靈敏度方法開辟了新途徑DB真人旗舰·(中国官方)集团有限公司官网MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长,其中cfDNA甲基化分析以及其他技術可以納入大規模肺癌早期檢測計劃具有改善SCLC臨床結果和早期檢測化療後疾病進展的潛力CQ9电子·(china)唯一官方网站,可以更快地部署進一步的治療線PA视讯(中国区)官网 - PlayAcelehu国际乐虎(China)-官方平台网站球友(官方)App下载-球友直播。未來基于cfDNA甲基化測序的方法可以用于小細胞肺癌的診斷、分子分型和預後的檢測lehu国际乐虎(China)-官方平台网站意昂4体育(中国)数字娱乐技术创新平台,爲後續臨床大規模應用奠定重要基礎DB真人旗舰·(中国官方)集团有限公司官网意昂4体育(中国)数字娱乐技术创新平台。

 

DNA甲基化與mRNA關聯分析

諾禾致源WGBS基于全基因组水平PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMECQ9电子·(china)唯一官方网站MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长,实现单碱基分辨率的甲基化位点准确定位球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台熊猫体育app官方入口(中国官方)认证体育赛事直播平台,快速准确找到差异位点DB真人旗舰·(中国官方)集团有限公司官网意昂4体育(中国)数字娱乐技术创新平台,实现高效分析DMR及相关基因的功能分析DB真人旗舰·(中国官方)集团有限公司官网。(1) 整体上的关联:主要从染色体层面基因甲基化水平与表达水平分布DB真人旗舰·(中国官方)集团有限公司官网,基因上下游层面甲基化水平与表达水平分布两个方面来展示DNA甲基化修饰与基因表达的关系(2) DMR相关基因表达与甲基化修饰:以甲基化分析得到的DMR相关基因为主体球友(官方)App下载-球友直播,以不同形式展示其表达与甲基化修饰的关系(3) DMR相关基因与差异基因联合分析:将DMR相关基因与转录组分析得到的差异基因取交集熊猫体育app官方入口(中国官方)认证体育赛事直播平台DB真人旗舰·(中国官方)集团有限公司官网,以不同的形式展示交集基因的甲基化水平和表达量及其注释信息(4) DMR相关基因与差异基因功能分析:主要是基于基因集合间求交集并进行GO和KEGG富集分析

 




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