DNA甲基化是表觀遺傳學的重要組成部分MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports球客岛-足球比分直播平台娱乐中心首页大厅,娱乐中心-大厅welcome，在維持正常細胞功能、遺傳印記、胚胎發育以及人類腫瘤發生發展中起著重要作用MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站。近年來MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站，許多研究發現db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网，DNA甲基化異常與多種癌症密切相關意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台zoty中欧·(中国集团公司)官方网站db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网。癌症在DNA甲基化水平上有兩個主要變化特征zoty中欧·(中国集团公司)官方网站娱乐中心首页大厅,娱乐中心-大厅welcome，CpG島(CGIs)的局部高甲基化導致基因沈默zoty中欧·(中国集团公司)官方网站db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站，這是腫瘤抑制基因失活的一種成熟機制db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站，但低甲基化相關基因沈默的功能後果和形成這些結構域的潛在選擇壓力尚不明確MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports。

2023年6月15日球客岛-足球比分直播平台，哈佛医学院/麻省总医院癌症研究中心Daniel A.Haber團隊联合Shyamala Maheswaran和David Miyamoto團隊球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站，在Cell上發表了題爲：“DNA hypomethylation silences anti-tumor immune genes in early prostate cancer and CTCs”的论文db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网，本研究利用全基因組甲基化（WGBS）、ChIP-seq、單細胞多組學等多種測序技術MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站，結合小鼠腫瘤模型杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站球客岛-足球比分直播平台，揭示了DNA去甲基化在前列腺癌中的全新功能db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站zoty中欧·(中国集团公司)官方网站，即抑制前列腺癌抗原呈遞基因的表達MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站球客岛-足球比分直播平台，從而誘導早期前列腺癌的免疫逃逸娱乐中心首页大厅,娱乐中心-大厅welcome，爲腫瘤的免疫治療提供了全新的思路杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站。本文中二代测序技术均由諾禾致源完成db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站。

文章簡介

爲了表征單個轉移性前列腺癌細胞的全基因組DNA甲基化特征MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports，通过單細胞多組學测序分析发现球客岛-足球比分直播平台，与单个CGIs通常在基因调控区域周围表现出局灶性高甲基化相反db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网娱乐中心首页大厅,娱乐中心-大厅welcomezoty中欧·(中国集团公司)官方网站，前列腺肿瘤细胞中的低甲基化区域跨越了非常大的基因贫乏区域熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站球客岛-足球比分直播平台娱乐中心首页大厅,娱乐中心-大厅welcome，这与之前描述的PMDs一致MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk SportsMG不朽情缘·(中国大陆)官方网站球客岛-足球比分直播平台。总的来说MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网，在前列腺癌基因组中鉴定了1496个PMDs球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛球客岛-足球比分直播平台，平均大小为1.2Mb熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站，这个数字与以前基于多个晚期癌症的大规模肿瘤测序结果一致db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网。与大的基因贫乏PMDs相反杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站，穿插在低甲基化结构域内的1412个PMIs是基因丰富的杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站，具有尖锐的甲基化边界熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站，包括单个基因或一小部分基因db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站。正如在其他癌症中所证明的那样杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports娱乐中心首页大厅,娱乐中心-大厅welcome，PMDs是基因贫乏的熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站娱乐中心首页大厅,娱乐中心-大厅welcome，并且强烈富集一些内源性逆转录病毒元件(ERVs)球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛，特别是长末端重复序列(LTRs)db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports。

先前研究表明杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站，乳腺癌和結腸癌的PMDs表現出活性染色質標記(H3K4me1/3、H3K27ac和H3K36me3)的缺失和抑制性組蛋白修飾的富集MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports娱乐中心首页大厅,娱乐中心-大厅welcome。使用ChIP-seq分析培養細胞系染色質景觀MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站，對前列腺癌細胞(LNCaP和22Rv1)的分析證實zoty中欧·(中国集团公司)官方网站球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛，抑制性H3K9me3標記位于中心意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台，H3K27me3位于低甲基化結構域的邊界球客岛-足球比分直播平台zoty中欧·(中国集团公司)官方网站意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台。與惡性腫瘤相關的變化主要與H3K27me3沈積有關MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports。

在癌症進化過程中MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports，DNA低甲基化過程最終包括晚期癌症中非編碼和基因貧乏基因組的大片區域MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站。非隨機表觀遺傳沈默可能在啓動腫瘤發生中發揮重要作用娱乐中心首页大厅,娱乐中心-大厅welcome球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛，選擇壓力指導複發性早期事件娱乐中心首页大厅,娱乐中心-大厅welcomeMK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports。作者試圖確定在腫瘤發生過程中始終受到早期沈默影響的基因組位點zoty中欧·(中国集团公司)官方网站db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站。從前列腺切除術標本中獲得冷凍組織切片和純化的單核用于分子分析意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网。

通过亚硫酸氢盐全基因組測序结果推断的CNV證實了單個細胞核的腫瘤起源球客岛-足球比分直播平台MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站。將腫瘤、N.P.細胞核與轉移性患者的CTC進行比較球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛。高分辨率單核分析推斷CNV鑒定出Chr8p缺失(包含NKX3-1、BMP1和FGFR1基因以及多個microRNAs)是前列腺腫瘤發生中最早的遺傳事件之一MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports，該基因座的早期等位基因缺失在前列腺癌中有報道球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛。

在這項研究中球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站，發現了40個核心低甲基化區域球客岛-足球比分直播平台熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站，這些區域在前列腺癌的早期可檢測階段到轉移性CTC中都表現出一致的低甲基化特征MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports球客岛-足球比分直播平台MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站。在這些低甲基化區域中熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站，一些小的位點逃脫了甲基化的沈默杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站，並且富含細胞增殖基因db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网。與此同時zoty中欧·(中国集团公司)官方网站，核心低甲基化區域內的轉錄沈默基因則富含免疫相關基因MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站。

最引人注目的是球客岛-足球比分直播平台MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网，在這些低甲基化區域中zoty中欧·(中国集团公司)官方网站，研究人員發現了一個包含五個CD1基因的基因簇意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台球客岛-足球比分直播平台娱乐中心首页大厅,娱乐中心-大厅welcome，這些基因向NKT細胞提供脂質抗原MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站，並且四個與IFI16相關的幹擾素誘導基因意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛，涉及先天免疫杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports。通過在免疫能力小鼠中重新表達CD1或IFI16杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站，發現腫瘤的發生被廢除意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台球客岛-足球比分直播平台，並且激活了抗腫瘤免疫力球客岛-足球比分直播平台。這一結果進一步證實了DNA低甲基化對抗腫瘤免疫基因的沈默起到了關鍵作用意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台。

該研究對于深入了解腫瘤發生機制具有重要意義杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网，它揭示了早期腫瘤發生中的表觀遺傳學變化以及低甲基化區域內共定位基因的重要性熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站。此外db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网，該研究還發現低甲基化區域可以在富含CTC的血液樣本中進行檢測娱乐中心首页大厅,娱乐中心-大厅welcome，這爲腫瘤的早期檢測和治療提供了新的思路意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台娱乐中心首页大厅,娱乐中心-大厅welcome。

參考文獻

Guo, H., Vuille, J.A., Wittner, B.S., Lachtara, E., Hou, Y., Lin, M., Zhao, T., Raman, A.T., Russell, H.C., Reeves, B.A., Pleskow, H.M., Wu, C., Gnirke, A., Meissner, A., Efstathiou, J.A., Lee, R.J., Toner, M., Aryee, M.J., Lawrence, M.S., Miyamoto, D.T., Maheswaran, S., & Haber, D.A. (2023). DNA hypomethylation silences antitumor immune genes in early prostate cancer and CTCs. Cell, 186, 2765 - 2782.e28