麝香是林麝、麝鼠等成熟雄體腹部下方位于肚臍和生殖器之間的生長腺體及香囊中的分泌物B体育(China)中国官方网站-B SPORTS意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!,麝香的香味濃郁而獨特意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」,遠聞猶如花香、脂粉、奶香、辛辣等氣味杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网,沁人心脾杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAce,具有重要的藥物和化妝品應用價值kg体育(中国区)-体育官方网站入口乐天堂fun中心(fun88) 官方网站。然而EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」B体育(China)中国官方网站-B SPORTS,由于缺乏相關麝香分泌物種的全面的多組學分析平台熊猫体育-【中国区】官方平台网站,目前人們對于麝香分泌的分子機制的研究尚淺尼斯人app官网版下载·尼斯人app官网下载官方版-尼斯人官网熊猫体育-【中国区】官方平台网站。
爲此乐天堂fun中心(fun88) 官方网站CQ9电子·(china)唯一官方网站,成都大學和重慶市藥物種植研究所聯合多家單位于2025年2月26日在著名期刊GigaScience闪昹表了題爲“Multiomics analysis provides insights into musk secretion in muskrat and musk deer”的學术論文PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAcekg体育(中国区)-体育官方网站入口尼斯人app官网版下载·尼斯人app官网下载官方版-尼斯人官网。成都大學王滔博士、楊茂森碩士和四川省藥品檢驗研究院(四川省醫療器械檢測中心、四川養麝研究所)的石鑫研究實習員爲共同第一作者PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAce杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网CQ9电子·(china)唯一官方网站。成都大學李地豔教授和重慶市藥物種植研究所竭航研究員爲論文的共同通訊作者B体育(China)中国官方网站-B SPORTS。諾禾致源提供多組學数据库平台的搭建等技术支持熊猫体育-【中国区】官方平台网站PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAce。
主要研究成果
1. 完成两種麝香分泌哺乳動物(林麝和麝鼠)的高質量染色体级别基因組組裝杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网。
2.通過比較基因組、單細胞轉錄組和三維基因組等方法意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!,解析林麝與麝鼠適應性趨同進化的基因和通路CQ9电子·(china)唯一官方网站熊猫体育-【中国区】官方平台网站PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAce。
3.成功开发一个开源、公开访问、用户友好型的麝香分泌哺乳動物多組學平台MuskDB: http://muskdb.cn/home/kg体育(中国区)-体育官方网站入口。
研究結果
1.麝鼠和林麝高質量基因組組裝
利用ONT长读长測序技术、高通量双端測序技术和Hi-C技术成功組裝了麝鼠和林麝的高質量染色体级别基因組杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网。麝鼠基因組大小爲2.48Gb乐天堂fun中心(fun88) 官方网站,scaffold N50和contig N50分别爲90.66Mb和60.53Mbkg体育(中国区)-体育官方网站入口,BUSCO值达到96.95%杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网。林麝基因組大小爲2.83Gb杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAce意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!,scaffold N50和contig N50分别爲105.82Mb和69.45Mb乐天堂fun中心(fun88) 官方网站。在麝鼠基因組中共识别到23,260个蛋白编码基因熊猫体育-【中国区】官方平台网站B体育(China)中国官方网站-B SPORTSPA视讯(中文站) - 官方网站PlayAce,预測1,013.31Mb的轉座因子PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAce意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!B体育(China)中国官方网站-B SPORTS。林麝基因組中共识别到24375个蛋白编码基因CQ9电子·(china)唯一官方网站,预測1539.41Mb的轉座因子意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!。此外尼斯人app官网版下载·尼斯人app官网下载官方版-尼斯人官网PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAce,在麝鼠和林麝基因組中发现181个扩张的基因家族和134个收缩的基因家族EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」CQ9电子·(china)唯一官方网站,分别涉及細胞周期、有丝分裂过程和嗅觉信号通路、免疫相关过程尼斯人app官网版下载·尼斯人app官网下载官方版-尼斯人官网。

2.林麝和麝鼠的正向選擇和快速進化基因挖掘
利用林麝、麝鼠、牛等12个物種的基因組進行比较基因組分析CQ9电子·(china)唯一官方网站意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!kg体育(中国区)-体育官方网站入口,作者鉴定了麝鼠和林麝中的正向選擇基因和快速進化基因EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」B体育(China)中国官方网站-B SPORTSkg体育(中国区)-体育官方网站入口,这些基因主要与脂質代谢、蛋白質結合、細胞周期调节和免疫活動相关尼斯人app官网版下载·尼斯人app官网下载官方版-尼斯人官网熊猫体育-【中国区】官方平台网站。此外熊猫体育-【中国区】官方平台网站,作者还挖掘到两个麝香分泌中的關鍵調控基因:GBA和ACSL5意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网,均与脂質代谢通路相关熊猫体育-【中国区】官方平台网站,两个物種的脂質代谢途径中表现出明显的快速進化特征尼斯人app官网版下载·尼斯人app官网下载官方版-尼斯人官网。

3.單細胞轉錄組維度挖掘麝香腺麝香分泌機制
通过單細胞RNA測序技术对麝鼠的麝香腺中采集的分泌和非分泌阶段組织样本進行單細胞分离和測序CQ9电子·(china)唯一官方网站,获得分泌阶段12,128个細胞和非分泌阶段7,270个細胞的轉錄組数据意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」。通过UMAP分析熊猫体育-【中国区】官方平台网站kg体育(中国区)-体育官方网站入口CQ9电子·(china)唯一官方网站,作者最终鉴定了13種不同的細胞类型CQ9电子·(china)唯一官方网站B体育(China)中国官方网站-B SPORTS,发现腺泡細胞/腺上皮細胞的数量在麝香分泌阶段显著增加熊猫体育-【中国区】官方平台网站,这些細胞主要涉及激素水平调节、脂質生物合成和有機酸轉运等过程PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAceB体育(China)中国官方网站-B SPORTS,在麝香分泌过程中发挥重要作用乐天堂fun中心(fun88) 官方网站意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」。

4.麝香分泌的染色質結構動態變化
作者通過Hi-C技术進一步研究麝香腺在分泌和非分泌阶段的染色質結構變化杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAce,发现染色質区室的显著變化PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAce,并且一些TADs在分泌阶段表现出更高的绝缘评分乐天堂fun中心(fun88) 官方网站EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」kg体育(中国区)-体育官方网站入口。此外kg体育(中国区)-体育官方网站入口,一些基因在分泌阶段表现出更多启動子-增强子相互作用(PEIs)尼斯人app官网版下载·尼斯人app官网下载官方版-尼斯人官网。GBA和ACSL5等基因在染色質結構變化中表现出显著的功能差异尼斯人app官网版下载·尼斯人app官网下载官方版-尼斯人官网乐天堂fun中心(fun88) 官方网站熊猫体育-【中国区】官方平台网站,可能在麝香分泌中发挥关键作用熊猫体育-【中国区】官方平台网站。

5.麝香分泌哺乳動物多組學平台:MuskDB
基于以上的麝香分泌哺乳動物多組學数据B体育(China)中国官方网站-B SPORTS乐天堂fun中心(fun88) 官方网站意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!,作者开发了开放访螌嵞MuskDB数据平台PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAce杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」。该数据平台中包含麝鼠和林麝的47,635个基因条目杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网B体育(China)中国官方网站-B SPORTS,以及831个生物學途径的信息乐天堂fun中心(fun88) 官方网站。另外B体育(China)中国官方网站-B SPORTS,还囊括了103份轉錄組数据、2組單細胞轉錄組数据、3組Hi-C数据熊猫体育-【中国区】官方平台网站PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAce。MuskDB数据平台还内嵌链T喾N實用多組學分析工具EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAce,包括序列比对、Hi-C查询、基因序列提取、轉座元件、基因共线性展示、系统发育树構建、基因表达和單細胞基因表达查询等EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」尼斯人app官网版下载·尼斯人app官网下载官方版-尼斯人官网CQ9电子·(china)唯一官方网站,可以帮助研究人員通过多種組學多維度的探究麝香分泌機制CQ9电子·(china)唯一官方网站,推動麝香分泌哺乳動物麝香分泌機制的研究kg体育(中国区)-体育官方网站入口。

总結
本研究完成两種麝香分泌哺乳動物的高質量染色体级别基因組組裝意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网熊猫体育-【中国区】官方平台网站。通过多組學分析发现尼斯人app官网版下载·尼斯人app官网下载官方版-尼斯人官网B体育(China)中国官方网站-B SPORTSCQ9电子·(china)唯一官方网站,脂質代谢基因通过适应性趋同進化驱動香腺功能形成乐天堂fun中心(fun88) 官方网站意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAce,揭示了腺泡上皮細胞增殖分化是麝香合成核心关键乐天堂fun中心(fun88) 官方网站熊猫体育-【中国区】官方平台网站。並成功开发一个公开访问、用户友好型的麝香分泌哺乳動物多組學平台MuskDBB体育(China)中国官方网站-B SPORTS。
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