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基因組測序>
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建庫測序>
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人类基因組測序>
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动植物基因組測序>
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微生物基因組測序>
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轉錄調控測序>
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表觀組測序>
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單細胞測序>
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空間轉錄組>
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基因分型>
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質譜分析>
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蛋白組學分析>
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代謝組學分析>
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免疫定量>
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轉化醫學>
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轉化醫學及临床试验服务>
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伴隨診斷一站式解決方案>
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多組學聯合分析>
935K甲基化芯片—方便快捷的甲基化檢測方法
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DNA甲基化是指在 DNA甲基化转移酶的作用下杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网，在基因组 CpG 二核苷酸的胞嘧啶5'碳位共价键结合一個甲基基团welcome-球速体育-直播认证官方网站。DNA 甲基化能引起染色质结构、DNA 构象、DNA 稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长U8国际·[China]有限公司官网，从而控制基因表达意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网。
935K甲基化芯片（Infinium MethylationEPIC v2.0）是由Illumina公司开发的甲基化位点检测芯片MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长。935K甲基化芯片包含人类甲基化组研究中最具生物学意义的>935,000個CpGsMG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长，分布于增强子、启动子区、基因编码区和CpG岛QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网U8国际·[China]有限公司官网，较其前代产品MethylationEPIC v1.0（850K）去除了性能不佳的探针QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网welcome-球速体育-直播认证官方网站意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS，新增了至少18.6万個新探针杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTSwelcome-球速体育-直播认证官方网站，不仅扩大CpG岛覆盖范围、增强外显子覆盖率QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光，实现更准确的拷贝数变异（CNV）检测意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网，同时注释基因组版本从HG19更新到HG38和v41版GenCode数据库官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光。
芯片位點
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（1）涵盖 Infinium Methylation 450 BeadChip 芯片中的＞85%的位点
（2）CpG 岛以外的 CpG 位点
（3）人类干細胞中的非 CpG 甲基化位点（CHH位点）
（4）肿瘤（多种类型的癌症）VS 正常样本中的不同甲基化位点welcome-球速体育-直播认证官方网站，可以检测多种樣本類型
（5）FANTOM5 增强子
（6）ENCODE 开放染色质和增强子
（7）脫氧核糖核酸酶超敏位點
（8）miRNA 启动子区域
（9）涵盖MethylationEPIC v1.0（850K）芯片中> 87%的位點
（10）通過ChIP-seq在癌症和細胞系中檢測到的增強子和超級增強子
（11）利用ATAC-seq在人原發性腫瘤中鑒定到的差異染色質可及區
（12）常見癌症驅動突變
技術優勢
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（1）广泛的基因组覆盖范围：每個样本检测>935,000個 CpG 位点K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发。
（2）分辨率高：單堿基分辨率意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光，可以直接檢測到發生甲基化的確切位點K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发。
（3）高质量的数据：同时采用 Infinium I 及 II 探针设计意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光，是检测范围最大化杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网。
（4）可重复性高：自身技术重复相关性R2>0.99；935K VS 850K 芯片交集探针间相关性R2>0.99；935K芯片 VS 甲基化测序（100X）相关性R2>0.96人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网welcome-球速体育-直播认证官方网站。
（5）适用于 FFPE 样品人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网welcome-球速体育-直播认证官方网站。
應用方向
腫瘤研究
肺癌、食管癌、卵巢癌等研究複雜疾病研究
精神疾病、代謝病、心血管病、免疫病等研究環境互作研究
吸煙、喝酒、工業暴露、汙染等發育研究
胚胎發育、神經分化、細胞分化等
諾禾優勢
1.周期短
樣本爲8的倍數時人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网，周期僅需30天！-
2.專業背景強
基于成熟的生物信息分析人才QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发，進行專業的項目分析QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS。 -
3.科學方案設計
從材料選取、探針捕獲、到檢測分析K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网，每一步都需要科學、缜密的設計U8国际·[China]有限公司官网，以保障高質量研究成果人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长。
檢測原理
935K 甲基化芯片流程展示
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探針一：
对于每個位点都设计有两种探针官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心，分别对应M型磁珠和U型磁珠MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光welcome-球速体育-直播认证官方网站。M 型磁珠尾部为 Gwelcome-球速体育-直播认证官方网站，用来检测甲基化位点；U型磁珠尾部为 AQY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网，用来检测未甲基化位点K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网。 基因组上的某一位点如果被甲基化了QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网welcome-球速体育-直播认证官方网站U8国际·[China]有限公司官网，那么在亚硫酸氢盐的处理下人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网welcome-球速体育-直播认证官方网站杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网，CG 仍为 CG意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTSwelcome-球速体育-直播认证官方网站，与M 型磁珠配对人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心welcome-球速体育-直播认证官方网站，荧光标记的核苷酸掺入后能被检测到荧光信号QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网，M 型磁珠发光U8国际·[China]有限公司官网QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心。反之K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心，如果没有被甲基化人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网，那么在亚硫酸氢盐的处理下杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网，CG 变为 TG意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS，与 U型磁珠配对人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网welcome-球速体育-直播认证官方网站，延伸后U 型磁珠发光MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光。 -
探針二：
Infinium Ⅱ 探针只使用一种磁珠人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光，探针末端为 Cwelcome-球速体育-直播认证官方网站官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发，配对后只掺入单個碱基K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网。根据荧光类型判断掺入的碱基类型welcome-球速体育-直播认证官方网站意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网，即可判断是否被甲基化QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心。
信息分析
935K甲基化芯片可以進行DMP、DMR信息挖掘welcome-球速体育-直播认证官方网站U8国际·[China]有限公司官网QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网，並進行系列數據分析人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网，助力高分文章發表意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS。| 935K甲基化芯片 分析内容 | 1. 样本的 β 值密度曲线 |
|---|---|
| 2. 各样本的 β 值箱线图 | |
| 3. 各样本的β 值堆叠图 | |
| 4. β 值相关性散点图 | |
| 5. PCA 图 | |
| 6.樣本相關性熱圖 | |
| 7. 差异甲基化位点（DMP）列表 | |
| 8. DMP火山图、散点图、热图 | |
| 9. DMP及基因個数统计 | |
| 10. 不同区域DMP统计 | |
| 11. DMP的TSS区域分析 | |
| 12. DMP在染色体上的分布/circos图 | |
| 13. DMP关联区域图 | |
| 14. 差异甲基化区域（DMR）列表 | |
| 15. DMR长度密度分布图 | |
| 16. DMP/DMR 相关基因的 GO 富集 | |
| 17. DMP/DMR 相关基因的 KEGG 富集 |
關聯分析
通过DNA甲基化与基因表达进行關聯分析杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网，可以帮助我们了解DNA甲基化修饰与RNA表达是否存在相关性MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心U8国际·[China]有限公司官网，样本中的哪些基因的表达受到DNA甲基化修饰的影响以及对应的基因的功能意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网。因此935K甲基化芯片和转录组的联合分析广泛应用于疾病研究人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长welcome-球速体育-直播认证官方网站，生物性状等多种领域welcome-球速体育-直播认证官方网站意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS。基于多组学文章中的应用场景和经验welcome-球速体育-直播认证官方网站，諾禾致源搭建了内容丰富的甲基化与转录组關聯分析流程意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS，以助力科研者们发表高分文章官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心。
| 935K甲基化芯片与mRNA關聯分析 | 1.利用甲基化位点对应的基因和转录组数据对应的基因信息人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心，进行關聯分析绘制starburst散点图 |
|---|---|
| 2.應用差異甲基化位點數據和轉錄組差異基因數據繪制甲基化與轉錄組相關的circos圖 | |
| 3.利用935K甲基化芯片獲得的DMR信息welcome-球速体育-直播认证官方网站，與轉錄組檢測獲得的與DMR最接近的基因表達情況U8国际·[China]有限公司官网，進行甲基化與轉錄組的聯合分析並繪制相關性熱圖 | |
| 4.根據轉錄組數據分別得出高、低表達的基因人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网welcome-球速体育-直播认证官方网站，分析轉錄組差異基因上對應的甲基化位點甲基化水平 |
送樣建議
| 樣本類型 | 送樣建議 |
|---|---|
| 組織樣本 | ≧30mg；口腔拭子≧3份 |
| FFPE |
1.推薦用試劑盒進行修複 15-20张切片（5-10μm厚K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发，1×1 cm 2大幸獍禾逵�4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网。� |
| 基因組DNA | 总量≧500ng意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光U8国际·[China]有限公司官网，浓度≥50 ng/μl |
| 細胞 | 1×106>-1×107個 |
| 全血 | ≥0.5 ML |
常見問題
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1. 怎样判断935K 芯片是否包含客户关心的位点?
- 这款芯片全面覆盖 CpG 岛、启动子区、增强子区以及基因编码区的CpG探针覆盖U8国际·[China]有限公司官网，客户可以根据芯片位點分布来判断welcome-球速体育-直播认证官方网站杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网。除此之外意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光，我们还可以提供芯片具体的位点信息帮助客户判断位点是否在芯片中官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网。
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2. 与850K 芯片相比杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网，935K 芯片存在哪些优势呢?
- 935K 芯片最大限度的保留了850K兼容性K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发，去除了850K 芯片 10.7 万個功能不佳的 CpG 探针杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网，增加了超过 18.6 万個新探针官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心，靶向已知的增强子、超级增强子、CTCF 结合域以及使用ATAC-seq和ChIP-seq鉴定的与原发性肿瘤相关的染色质开放区域杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网，位点数更多、覆盖更广、性价比更高MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发。
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3. 甲基化的差异分析支持无生物学重复吗官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心welcome-球速体育-直播认证官方网站？差异筛选的规则是什么K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发？
- 目前常规情况下甲基化差异分析是不支持无生物学重复样本的杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网U8国际·[China]有限公司官网，差异筛选时U8国际·[China]有限公司官网welcome-球速体育-直播认证官方网站，我们通常会以Delta Beta大于0.2杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网，adjP值小于0.05作为标准筛选差异位点MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长U8国际·[China]有限公司官网，但具体筛选阈值可能会根据项目的实际情况进行调整MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光。
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4. 差异分析的时候welcome-球速体育-直播认证官方网站，文件结果怎么看对照和处理的差异QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光？
- 分析结果中意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心，我们会将control组与case组以control_vs_case的形式作为分析结果官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心welcome-球速体育-直播认证官方网站QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网，其中的Delta Beta值U8国际·[China]有限公司官网QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长，则表示case组相较于control组出现的变化人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发，若DeltaBeta为正人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网，则表示case组甲基化水平高于control组意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网，为高甲基化U8国际·[China]有限公司官网，反之则为低甲基化人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长。
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