球友直播-足球篮球体育直播平台·(中国区)球友直播-足球篮球体育直播平台-ATAC-seq-諾禾致源-開放染色質高通量測序技術

基因組測序>
- 建庫測序>
  - 二代建庫測序服务
  - 三代建庫測序服务
- 人类基因組測序>
- 动植物基因組測序>
- 微生物基因組測序>
轉錄調控測序>
表觀組測序>
單細胞測序>
空間轉錄組>
基因分型>
質譜分析>
- 蛋白組學分析>
- 代謝組學分析>
- 血液蛋白質組分析>
  - Olink血液蛋白質組學
多組學聯合分析>
分子育種>
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ATAC-seq（mini ATAC-seq）

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ATAC-seq（mini ATAC-seq）——研究开放染色质的高通量测序技术

ATAC-seq（Assay forTransposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing）：结合高通量测序对Tn5转座酶易接近性核染色质区域进行测序分析PG(官方电子平台)有限公司-China直营官方网站球友直播-足球篮球体育直播平台，是研究染色质开放性/可及性的测序技术MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站。通过转座酶对某种特定时空下开放的核染色质区域进行切割球友直播-足球篮球体育直播平台熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网，即可获得在该时空下全基因组上所有的开放染色质区域信息熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站球友直播-足球篮球体育直播平台。
mini ATAC-seq技术是在常规ATAC-seq技术基础上进行升级优化DB旗舰·(中国区)官方app网站有限公司官网，从而实现5000個细胞/5mg组织即可进行建库的微量ATAC-seq技术球友直播-足球篮球体育直播平台。
90秒快速了解ATAC-seq（有聲動畫版）

應用方向

1、探究整個基因組上的開放染色質情況；

2、研究不同類型細胞分化的機制；

3、比較生物體發育不同階段/腫瘤相對正常組織等染色質開放性變化；

4、疾病/癌症形成的機制；

5、探究特定環境下PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站，作物的成熟、抗病、抗旱過程中OG视讯·(中国区)有限公司官网网站，開放染色質圖譜的變化；

6、探究轉錄因子結合熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站DB旗舰·(中国区)官方app网站有限公司官网PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站，基因表達調控等生物學過程；

諾禾優勢

1．起始量低
常规ATAC-seq 5万個细胞即可完成建库；mini ATAC-seq（微量ATAC-seq）5千個细胞即可完成染色质开放性研究熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站OG视讯·(中国区)有限公司官网网站U8国际·[China]有限公司官网，最低下探至500個细胞球友直播-足球篮球体育直播平台DB旗舰·(中国区)官方app网站有限公司官网。
2．極致周期
實現極致周期20天快速穩定交付熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站。
3．新鮮樣本
针对于新鲜样本的ATAC-seq/mini ATAC-seq研究PG(官方电子平台)有限公司-China直营官方网站，推出针对短途、中途、长途不同距离的运输方案OG视讯·(中国区)有限公司官网网站，以保证样本到达实验室的活性DB旗舰·(中国区)官方app网站有限公司官网PG(官方电子平台)有限公司-China直营官方网站。
4.分析內容豐富
除ATAC-seq/mini ATAC-seq标准分析內容外PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站PG(官方电子平台)有限公司-China直营官方网站，諾禾致源还可提供ATAC-seq/mini ATAC-seq&转录组關聯分析、Footprint分析、增强子/超级增强子分析等多项高级分析內容PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站。
5．項目經驗豐富
諾禾致源ATAC-seq/mini ATAC-seq项目经验丰富DB旗舰·(中国区)官方app网站有限公司官网，涵盖人、大小鼠、猪、鹅、马鹿、鸟类、昆虫类（如果蝇、飞蝗等）、水产/海产类（如扇贝、黄鳝、中华绒螯等）及植物（如油菜、水稻、杨树、拟南芥、苹果、葡萄等）等几十种物种；尤其针对植物果肉、果皮、胚轴等特殊组织部位积累了更丰富的样本处理经验；助力客户在Immunity、Nature Communications、Nucleic Acids Research、Cancer Research等权威杂志发表多篇高水平文章熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站球友直播-足球篮球体育直播平台U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐。
6．周期快、質量好、穩定性高
諾禾致源基于全面的物种实验库以及优质的測序平台熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐，实现快速、稳定的测序数据分析及交付熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站OG视讯·(中国区)有限公司官网网站。
- <8
  樣本量
- 35天周期
  20天（極致周期）
- NovaSeq
  測序平台

信息分析

諾禾致源 ATAC-seq 项目通过转座酶对特定时空开放的核染色质区域进行切割U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐，获得该时空下全基因组中所有活跃转录的调控序列信息DB旗舰·(中国区)官方app网站有限公司官网MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网，分析转录因子结合信息、核小体区域信息、转录调控元件分布等熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站。

分析內容	解決問題
測序數據質量評估	過濾掉低質量數據U8国际·[China]有限公司官网，保證數據質量
參考序列比對分析	唯一比对的 reads 分布统计
peak calling	定位開放區域、核小體及轉錄因子結合位點
peak注釋	探究染色質開放程度U8国际·[China]有限公司官网MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网，鑒定轉錄因子或其他調控因子可能調控的靶基因
差异 peak 分析	分析不同样本间差异 peakDB旗舰·(中国区)官方app网站有限公司官网，探究特定状态下特異性染色質開放區域
相關基因功能分析	Peak/差异 peak 相关基因 GO、KEGG 富集分析
motif 分析	探究染色質開放區可能結合的轉錄因子

關聯分析

諾禾致源提供ATAC-seq与RNA-seq關聯分析的完整分析流程球友直播-足球篮球体育直播平台，用于分析基因表达量和ATAC-seq信号强度的关系熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站。

ATAC-seq与RNA-seq關聯分析	1. 整体层面关联
	1.1 整体信号分布统计
	1.2 不同表达水平基因上下游ATAC信号统计
	1.3 整体RNA-seq/ATAC-seq信号关系
	2. 差异表达与染色质可及性
	2.1 差异基因TSS附近可及性
	2.2 差异基因相关ATAC-seq信号统计
	3. 差异表达与差异染色质可及性
	3.1 差异基因与差异peak统计
	3.2 差异基因与差异peak相关基因韦恩图
	3.3 差异基因与差异Peak的差异倍数关系
	3.4 GO富集分析
	3.5 KEGG富集分析

動植物多組學

疾病多組學

癌症多組學

微生物多組學

轉錄調控和蛋白多組學

表觀遺傳

送樣建議

	樣本類型	送樣建議
ATAC-seq	動物組織	≥50 mg
	植物組織	≥300 mg
	凍存細胞樣本	≥5×10⁵個
	新鮮細胞樣本	≥1×10⁵個
mini ATAC-seq	動物組織	≥5 mg
	凍存細胞樣本	≥1×10⁴個
	新鮮細胞樣本	≥5×10³個

常見問題

1. ATAC-seq 技术通常与哪些技术结合起来研究PG(官方电子平台)有限公司-China直营官方网站熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站？
- ATAC-seq 获得的是全基因组处于开放状态的序列球友直播-足球篮球体育直播平台，这些序列包含了潜在的调控元件DB旗舰·(中国区)官方app网站有限公司官网U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐，属于表觀遺傳学的范畴PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站U8国际·[China]有限公司官网熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站，它通常与 RNA-seq、CUT&Tag/ChIP-seq、Hi-C 等技术相结合U8国际·[China]有限公司官网球友直播-足球篮球体育直播平台MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网，可以深入研究基因表达的调控机制PG(官方电子平台)有限公司-China直营官方网站。
2. ATAC能分析转录因子吗U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐？
- 可以通過ATAC分析尋找潛在可能結合的轉錄因子信息U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐。ATAC-seq研究開放染色質的區域熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站OG视讯·(中国区)有限公司官网网站，這些區域中存在大量轉錄因子可以結合的區段熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网DB旗舰·(中国区)官方app网站有限公司官网，根據peak區域的序列進行motif分析U8国际·[China]有限公司官网，並與數據庫進行匹配熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站，提供可能結合的已知轉錄因子DB旗舰·(中国区)官方app网站有限公司官网熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站OG视讯·(中国区)有限公司官网网站，也可結合footprint分析潛在可能結合的轉錄因子PG(官方电子平台)有限公司-China直营官方网站，從而爲下遊實驗設計或驗證提供切入點PG(官方电子平台)有限公司-China直营官方网站OG视讯·(中国区)有限公司官网网站。

拓展材料

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