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單細胞測序

單細胞技術拓展(FLex、微生物)

單細胞Flex—打破新鮮樣本研究壁壘beat365中文官方网站[官网]-正版App Store尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,擴展樣本研究邊界

  • 单细胞基因表达Flexbeat365中文官方网站[官网]-正版App Store熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站,即单细胞Fixed RNA可对甲醛固定后的样本进行高灵敏度的全转录组分析尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口PA视讯·(中国区)官方网站 - Play熊猫体育「中国Panda」直播官方网站,通过特异性探针杂交捕获细胞中的mRNA尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台,实现单细胞基因表达量的检测;同时支持混样建库熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站beat365中文官方网站[官网]-正版App Store杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来,同批次操作分析熊猫体育「中国Panda」直播官方网站,最大限度减少实验可变性和批次效应熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站MK(体育科技有限公司)体育·官方网站。经过优化的产品流程将单细胞样本研究范围扩大到新鲜样本、FFPE样本beat365中文官方网站[官网]-正版App StoreMK(体育科技有限公司)体育·官方网站熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站,让单细胞转录组的研究更加灵活MK(体育科技有限公司)体育·官方网站杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站PA视讯·(中国区)官方网站 - Play。 本技术针对人的约18,000+编码基因设计了成对的特异性探针尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐,其中一段探针(RHS)的一端带有人工合成的pCS 1序列尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站MK(体育科技有限公司)体育·官方网站,用于Gel Beads上Oligo序列的捕获熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台beat365中文官方网站[官网]-正版App Store,另一段探针(LHS)设计了pRead 2S序列熊猫体育「中国Panda」直播官方网站熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台,用于文库构建和测序;同时根据探针上的Probe Barcode序列熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站MK(体育科技有限公司)体育·官方网站,可进行混样标记尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口PA视讯·(中国区)官方网站 - Playbeat365中文官方网站[官网]-正版App Store,最多可混样标记16个样本熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台。

産品優勢

  • 1.拓展拓展樣本研究邊界熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台,延長樣本等待時間
  • 2.支持混樣建庫MK(体育科技有限公司)体育·官方网站,方便樣本進行批量分析
  • 3.特異性探針設計杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站,高靈敏度捕獲全轉錄組
  • 4.百萬級細胞通量MK(体育科技有限公司)体育·官方网站beat365中文官方网站[官网]-正版App Store,混樣降低實驗成本

應用方向

  • ✓ 肿瘤异质性研究
  • ✓ 干细胞分化以及组织器官发育研究
  • ✓ 神经系统发育研究
  • ✓ 免疫方向研究
  • ✓ 疾病分型及用药指导

信息分析

  • 获得原始测序序列(Sequenced Reads)后熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台beat365中文官方网站[官网]-正版App Store熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站,通过如下流程进行生物信息分析熊猫体育「中国Panda」直播官方网站。单细胞转录组的分析核心是细胞的分群和亚群差异基因的鉴定熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站,使用10x官方分析软件Cell Ranger及第三方软件Seurat对细胞进行分型和差异分析熊猫体育「中国Panda」直播官方网站beat365中文官方网站[官网]-正版App Store,后续对这些差异基因进行功能富集beat365中文官方网站[官网]-正版App Store,从而鉴定亚群的功能特征U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐PA视讯·(中国区)官方网站 - Play熊猫体育「中国Panda」直播官方网站。

常見問題

  • 1. 单细胞Flex的杂交探针对是如何设计的杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐?

    • 單細胞Flex技術覆蓋了人的18,532個編碼基因U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐,大多數基因爲3倍探針對的覆蓋;7.5%的基因如高表達基因和線粒體蛋白編碼基因爲1倍探針對覆蓋;其中TCR連接和可變區、IG連接和可變區、核糖體蛋白、線粒體核糖體蛋白、讀通基因、KIR和HLA基因(由于其固有的等位基因多樣性)及非編碼RNA被排除在人類探針組之外杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐熊猫体育「中国Panda」直播官方网站。
  • 2. 单细胞Flex对样本有什么要求杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐MK(体育科技有限公司)体育·官方网站?

    • Flex可对新鲜样本、FFPE样本进行单细胞研究熊猫体育「中国Panda」直播官方网站尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口。新鲜样本建议保存于组织保存液中寄送U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐PA视讯·(中国区)官方网站 - Play,由諾禾致源进行样本细胞悬液制备及固定熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐,固定后的样本可于-80℃冰箱保存半年;FFPE样本建议冰袋寄送石蜡块至諾禾致源PA视讯·(中国区)官方网站 - Play熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台,样本需进行DV200质检beat365中文官方网站[官网]-正版App Store杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站,DV200>30%的样本可继续进行细胞核解离操作熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站熊猫体育「中国Panda」直播官方网站,石蜡卷实验使用量为25um 4-6张熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台beat365中文官方网站[官网]-正版App Store杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站。
  • 3. 可以应用4%多聚甲醛自行固定细胞吗MK(体育科技有限公司)体育·官方网站熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站PA视讯·(中国区)官方网站 - Play?

    • 建议新鲜样本制备、悬液固定操作由諾禾致源进行尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,实验人员对于操作流程更为熟悉熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台PA视讯·(中国区)官方网站 - Play,且Flex对于固定时间有相同要求MK(体育科技有限公司)体育·官方网站尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口beat365中文官方网站[官网]-正版App Store,统一操作更规范化;且10x固定试剂除多聚甲醛外杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来MK(体育科技有限公司)体育·官方网站,包含透化酶等其他试剂熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐,如客户必需进行自行固定处理U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站,建议使用10x官方固定试剂PA视讯·(中国区)官方网站 - Play杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站。
  • 4. 关于混样建库尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台,RNA含量相差较大的样本beat365中文官方网站[官网]-正版App StoreU8国际·科技赋能场景,更省心娱乐,可以混池建库吗熊猫体育「中国Panda」直播官方网站杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站MK(体育科技有限公司)体育·官方网站?

    • 不建議RNA含量相差大的樣本共同進行混池建庫熊猫体育「中国Panda」直播官方网站。在混池測序過程中熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,測序reads將按其固有RNA含量的比例分布到不同的樣品中杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来MK(体育科技有限公司)体育·官方网站,所有樣品將具有相同的測序飽和度PA视讯·(中国区)官方网站 - Play,因此MK(体育科技有限公司)体育·官方网站熊猫体育「中国Panda」直播官方网站熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台,具有高RNA細胞的樣品每個細胞將獲得更多的讀萓8国际·科技赋能场景,更省心娱乐PA视讯·(中国区)官方网站 - Play。哂械蚏NA細胞的樣品每個細胞的讀取將按比例減少尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口MK(体育科技有限公司)体育·官方网站。同時因爲混池的原因beat365中文官方网站[官网]-正版App Store杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站PA视讯·(中国区)官方网站 - Play,無法對單一樣本進行精准加測操作beat365中文官方网站[官网]-正版App Store尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口。
  • 5. 单细胞Flex可以与空間轉錄組联合分析吗熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站?

    • 建议单细胞Flex产品与空间Visium V2产品进行联合分析熊猫体育「中国Panda」直播官方网站熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站,二者同为探针对杂交设计beat365中文官方网站[官网]-正版App Store,且使用的探针集相同beat365中文官方网站[官网]-正版App Store,同一个样本的数据分析可高度匹配MK(体育科技有限公司)体育·官方网站beat365中文官方网站[官网]-正版App Store熊猫体育「中国Panda」直播官方网站。
  • 6. 单细胞Flex的测序策略是什么

    • 应用PE150测序策略U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐PA视讯·(中国区)官方网站 - Play,推荐测序数据量为1-2w reads/cell尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来,每个样本约30-50G数据量

VITA微生物单细胞轉錄組測序产品

  • 微生物单细胞轉錄組測序产品通过独特的微生物细胞固定透化技术杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台熊猫体育「中国Panda」直播官方网站,基于随机引物的微生物转录本原位逆转录技术熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来PA视讯·(中国区)官方网站 - Play,和单细胞捕获技术得到微生物的单细胞转录组信息MK(体育科技有限公司)体育·官方网站熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,从而研究体外纯化培养的单个菌种内部的异质性PA视讯·(中国区)官方网站 - Play熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台,或胃肠道菌群间的异质性beat365中文官方网站[官网]-正版App Store熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站,最终应用于解析菌群内部异质性以及新的亚群鉴定MK(体育科技有限公司)体育·官方网站杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来,刺激环境的适应性尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,耐药研究等方向MK(体育科技有限公司)体育·官方网站。 M20 VITA平台微生物单细胞轉錄組測序的核心原理是对细菌进行固定透化后beat365中文官方网站[官网]-正版App Store杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站,使用随机引物与细菌内的RNA结合熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,对全转录组的RNA分子进行原位逆转录杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站。通过末端转移酶(TdT)将捕获接头添加到cDNA的3’末端熊猫体育「中国Panda」直播官方网站PA视讯·(中国区)官方网站 - Play。之后beat365中文官方网站[官网]-正版App Store尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站,通过VITACruiser单细胞平台进行高通量单细胞标记PA视讯·(中国区)官方网站 - Play熊猫体育「中国Panda」直播官方网站杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站。在通过cDNA扩增建库和Illumina平台测序后U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站beat365中文官方网站[官网]-正版App Store,通过VITASeer对数据进行处理beat365中文官方网站[官网]-正版App Store熊猫体育「中国Panda」直播官方网站杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来,再通过与参考基因组的比对获得物种信息杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站,最终降维聚类形成细胞分群熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站,并展示样品中的菌种占比杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐。

應用方向

  • ✓ 探究肠道微生物群参与的药物互作、药物代谢
  • ✓ 解析肠道菌群与其他组织器官的关联
  • ✓ 临床耐药研究
  • ✓ 人体胃肠道功能调节相关产品研发
  • ✓ 酶资源的勘探
  • ✓ 胃肠道菌群改善
  • ✓ 生态动力学
  • ✓ 饲料优化

産品優勢

  • 1.高分辨率分析:在宏轉錄組技術的基礎上杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站,實現單細胞精度beat365中文官方网站[官网]-正版App Store杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来,解析菌體間異質性熊猫体育「中国Panda」直播官方网站。
  • 2.應用于原核細胞:將單細胞水平的應用範圍從真核細胞拓展到原核細胞熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站,能夠對單個微生物細胞的轉錄組進行深入研究熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐beat365中文官方网站[官网]-正版App Store,揭示細菌間的異質性MK(体育科技有限公司)体育·官方网站。
  • 3.發現稀有細胞類型:可以檢測到數量稀少但具有重要功能的微生物細胞類型U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台。
  • 4.解析微生物的動態變化:檢測微生物在不同環境條件或生長階段的轉錄組變化PA视讯·(中国区)官方网站 - Play杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台。

常見問題

  • 1. 对于细菌的形状、直径大小是否有限制要求熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台?

    • 没有限制要求熊猫体育「中国Panda」直播官方网站U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐,细菌的直径一般在 0.5~10μm 之间熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站,均符合检测条件杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来。
  • 2. 可以做真菌吗U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐PA视讯·(中国区)官方网站 - Play熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台?

    • 真菌目前還在研發測試階段MK(体育科技有限公司)体育·官方网站。
  • 3. 单菌的标准是什么杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站,如果一个细菌物种的不同菌株混合尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,算单菌吗熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台?

    • 此處單菌指種水平的一個細菌物種熊猫体育「中国Panda」直播官方网站。
  • 4. 需捕获多少细菌进行测序分析MK(体育科技有限公司)体育·官方网站熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台,测序量要求多少U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐beat365中文官方网站[官网]-正版App Store?

    • 单菌细胞数:2000-3000熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台,测序量 30-60G; 混菌细胞数:5000-10000PA视讯·(中国区)官方网站 - Playbeat365中文官方网站[官网]-正版App Store,测序量 150-300G尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口beat365中文官方网站[官网]-正版App StorePA视讯·(中国区)官方网站 - Play。
  • 5. 单细菌转录组中 rRNA 比例有多少beat365中文官方网站[官网]-正版App Store熊猫体育「中国Panda」直播官方网站尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,数据可满足后续分析吗熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站MK(体育科技有限公司)体育·官方网站熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台?

    • 核糖体比例一般为80-90%熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站。细菌的核酸量较蠱K(体育科技有限公司)体育·官方网站熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站beat365中文官方网站[官网]-正版App Store。瑀RNA损耗的数据有限MK(体育科技有限公司)体育·官方网站,30-60G 的测序量可满足单菌的分析MK(体育科技有限公司)体育·官方网站。
  • 6. 和细菌 bulk RNAseq 相比熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口熊猫体育「中国Panda」直播官方网站,单细菌转录组有什么优势beat365中文官方网站[官网]-正版App StoreU8国际·科技赋能场景,更省心娱乐?

    • 可研究細菌表達水平的異質性熊猫体育「中国Panda」直播官方网站U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来,揭示平均值掩蓋的差異MK(体育科技有限公司)体育·官方网站熊猫体育「中国Panda」直播官方网站熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台。
  • 7. 野生株和点突变改造后的突变株熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐,能检测出的转录水平的差异吗尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口熊猫体育「中国Panda」直播官方网站U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐?

    • 只要有表達差異杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站,可以檢出杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台。
  • 8. MscRNA-seq 能反映细菌丰度吗尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口beat365中文官方网站[官网]-正版App Store?与宏转录组测出来的结果一致性如何尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站熊猫体育「中国Panda」直播官方网站?

    • 可以反映細菌豐度MK(体育科技有限公司)体育·官方网站,與宏轉錄組稍有差異熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站beat365中文官方网站[官网]-正版App Store,優勢物種相似尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐。
  • 9. 进行单细菌转录组功能分析熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台,需要参考基因组吗熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来?

    • 需要熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站。
  • 10. 细菌亚群鉴定后U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐,还需要做功能验证吗杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站熊猫体育「中国Panda」直播官方网站熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台?

    • 根據研究目的可進行功能驗證beat365中文官方网站[官网]-正版App Store,如構建熒光報告菌株、流式分選等熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口。
  • 11. 送样前是否可以进行预实验熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站熊猫体育中国app官网下载地址(官方)认证体育赛事直播平台,评估样本是否满足送样需求MK(体育科技有限公司)体育·官方网站U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐。

    • 细菌固定以后MK(体育科技有限公司)体育·官方网站,取 2?L 细菌样本与 198?L 水混合后移至载玻片(可根据实际情况进行稀释)熊猫体育「中国Panda」直播官方网站杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,用显微镜观察 200X/400X 视野杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站PA视讯·(中国区)官方网站 - Play,评估细菌结团率情况及杂质情况PA视讯·(中国区)官方网站 - Play,结团率需 < 20%尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站。

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