諾禾致源

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科技服務

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轉錄調控測序

醫學轉錄組—剖析人和小鼠的mRNA信息

医学轉錄組測序采用Illumina测序平台XC·sports-官网下载官方版(中国)官方网站,针对特定物种人和小鼠的组织或细胞在某個特定状态下转录的所有mRNA进行测序918博天堂(中国区)-官方网站,與參考基因組比對龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOME博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩,既可全面快速地获得mRNA序列和表达丰度信息bsports(中国区)B—sports体育登录入口,又可进行融合基因、可变剪切等结构分析意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光。

應用方向

  • 腫瘤發生發展

    寻找研究对象重要性状或表型熊猫体育-【中国区】官方平台网站九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页),如用于癌症检测或预后 biomarker 的发现
  • 疾病致病機理

    疾病研究-尋找到研究對象重要的生物標志物(biomarker)
  • 差異表達

    尋找不同處理導致差異性狀或表型相關聯的主要功能基因九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光熊猫体育-【中国区】官方平台网站,例如不同藥物治療引起的基因表達模式變化
  • 生長發育

    尋找研究對象時序性變化的主控因素博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩918博天堂(中国区)-官方网站,例如小鼠胚胎發育過程、患者持續給藥治療等

諾禾優勢

  • 1. 样本起始量低

    RNA 0.4 μg/建库
  • 2. 周期快、质量好XC·sports-官网下载官方版(中国)官方网站博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩,稳定性高

    诺禾医学轉錄組測序基于先进的测序平台XC·sports-官网下载官方版(中国)官方网站意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光bsports(中国区)B—sports体育登录入口,系统全面的分析组织或细胞在特定条件下转录所得所有mRNA信息博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩,深度挖掘转录本结构信息918博天堂(中国区)-官方网站龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOME,助力医学研究星空·综合(体育中国)官方网站龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOME。
    • ≤30

      樣本量
    • 18天

      項目周期
    • PE150

      測序讀長
    • ≥85%

      測序質量Q30
  • 3.方案設計專業意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光熊猫体育-【中国区】官方平台网站,質控嚴格

    诺禾医学轉錄組測序严格要求测序数据质量:Q20>90%龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOME,Q30>85%bsports(中国区)B—sports体育登录入口星空·综合(体育中国)官方网站熊猫体育-【中国区】官方平台网站。从材料選取博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩,建庫測序龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOME,到数据分析熊猫体育-【中国区】官方平台网站博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩918博天堂(中国区)-官方网站, 每一步都经过科学、缜密的设计博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)bsports(中国区)B—sports体育登录入口,以保障高质量研究成果918博天堂(中国区)-官方网站九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)bsports(中国区)B—sports体育登录入口。

    材料選取

    RNA樣品
    ≥ 400ng

    文庫構建

    PE150測序
    6~12Gb

    信息分析

    同时諾禾致源高性能计算平台(High Performance Computing意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)918博天堂(中国区)-官方网站,实现快速稳定的测序数据分析及交付龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOME意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光熊猫体育-【中国区】官方平台网站。随着公司业务的发展星空·综合(体育中国)官方网站博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩bsports(中国区)B—sports体育登录入口, 高性能计算平台将会持续更新并扩容九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页),以保证高效的数据处理和安全的数据存储九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)。
  • 4. 項目經驗丰富

    至2021年12月龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOME,諾禾致源已与协和医学院、安贞医院、北京天坛医院等遍布全国范围的多家医院建立了良好的合作关系博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩熊猫体育-【中国区】官方平台网站bsports(中国区)B—sports体育登录入口,进行了深入合作XC·sports-官网下载官方版(中国)官方网站,已在Cell Stem Cell 、Nature Structural & Molecular Biology、Genome Research、Nature Communications等权威期刊发表多篇高水平文章熊猫体育-【中国区】官方平台网站九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台。
    • 80人

      分析團隊
    • 10年

      項目經驗
    • 20000+

      結題項目
    • 1對1

      項目服務

信息分析

諾禾致源医学轉錄組測序项目信息分析龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOME,经过严格数据质控保证数据分析可靠性bsports(中国区)B—sports体育登录入口,信息分析分为表达水平分析和结构水平分析熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台。表达水平分析包括基因表达量分析、相关性分析、差异基因及其富集分析、GSEA分析、WGCNA分析等意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩,结构水平包括可變剪切分析、变异位点分析、融合基因分析等918博天堂(中国区)-官方网站熊猫体育-【中国区】官方平台网站。同时新增高级医学轉錄組測序熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光,应用转录组数据对肿瘤样本进行免疫相关分析熊猫体育-【中国区】官方平台网站博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩XC·sports-官网下载官方版(中国)官方网站,细化研究免疫微环境的组成bsports(中国区)B—sports体育登录入口XC·sports-官网下载官方版(中国)官方网站九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页),对机体免疫因子机制的探究更具有意义和实用价值龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOME熊猫体育-【中国区】官方平台网站。高級分析包含腫瘤純度與評分、肿瘤微环境和免疫表型評分等龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOME九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)。
有參轉錄組 分析內容 解決問題
標准分析 測序數據質量評估 過濾掉低質量數據龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOME,保證數據質量
與參考基因組比對 比對率分析
基因表達水平分析 分析基本的表達量
樣本相關性分析 分析樣本間的相關性大小
差異基因分析 尋找不同比較組合間的差異基因
GO/KEGG富集分析 差異基因的GO博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩bsports(中国区)B—sports体育登录入口熊猫体育-【中国区】官方平台网站,KEGG富集分析
DO富集分析 差異基因的DO富集分析
DisGeNET富集分析 差異基因的DisGeNET富集分析
Reactome富集分析 差異基因的Reactome富集分析
蛋白互作網絡分析 差異基因蛋白互作網絡的分析
GSEA分析 基因集富集分析
WGCNA基因共表達網絡分析 分析模塊與樣本間的相關性龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOME九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页),尋找關鍵模塊和hub基因
可變剪切分析 不同樣本間可變剪接事件的差異分析
SNP/Indel分析 分析變異位點
融合基因分析 進行融合基因的檢測與分析
高級分析 腫瘤純度與評分 计算获得腫瘤純度與評分
腫瘤微環境-xcell 對腫瘤微環境相關細胞的占比評估
免疫表型評分 評估免疫相關因子

送樣建議

樣本類型 普通轉錄組/真核鏈特轉錄組
新鮮植物組織幹重 叶片、花 ≥ 0.3g; 根、茎、种子等其他组织 ≥ 0.5g
新鮮動物組織幹重 内脏组织、脑组织 ≥ 0.08g; 脂肪、皮肤、骨头、血管等其他组织 ≥ 0.3
新鮮培養細胞 >≥5*106
新采集的全血(加入 TRIzol) >≥5mL
新采集的全血 (液氮速冻) >≥2mL
PAXgene 采血管 ≥1 管
石蠟切片 厚度在5-10μm,含組織面積大于25mm2的切片12張意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOME。

常見問題

  • 1.医学轉錄組測序中血液样本送样熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台bsports(中国区)B—sports体育登录入口意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光,有哪些注意事项?

    • 医学轉錄組測序的血液样本采血建议使用EDTA抗凝管进行采血熊猫体育-【中国区】官方平台网站bsports(中国区)B—sports体育登录入口博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩,可离心分离出白细胞、单個核细胞进行送样意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光星空·综合(体育中国)官方网站,或全血直接加三倍trizol等方法进行处理熊猫体育-【中国区】官方平台网站博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩,液氮速冻XC·sports-官网下载官方版(中国)官方网站九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)918博天堂(中国区)-官方网站,-80℃保存星空·综合(体育中国)官方网站,干冰运输熊猫体育-【中国区】官方平台网站。
  • 2.医学轉錄組測序標准分析和DGE分析的关系是什么九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)XC·sports-官网下载官方版(中国)官方网站熊猫体育-【中国区】官方平台网站?

    • 医学轉錄組測序的標准分析和DGE分析主要的差别在于分析內容上熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩bsports(中国区)B—sports体育登录入口,標准分析除了差异基因富集分析外博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩,还可以进行基因结构分析918博天堂(中国区)-官方网站九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)XC·sports-官网下载官方版(中国)官方网站。而DGE就是数字基因表达谱熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOME,一般只分析差异基因918博天堂(中国区)-官方网站bsports(中国区)B—sports体育登录入口熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,不进行基因结构分析XC·sports-官网下载官方版(中国)官方网站。
  • 3.医学轉錄組測序的肿瘤样本准备时需要注意哪些事项bsports(中国区)B—sports体育登录入口意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOME?

    • 由于肿瘤样本活性较高XC·sports-官网下载官方版(中国)官方网站熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,RNA在常温条件下短时间内会几乎全部降解意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光XC·sports-官网下载官方版(中国)官方网站918博天堂(中国区)-官方网站,不利于进行医学轉錄組測序博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOME。因此918博天堂(中国区)-官方网站熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台XC·sports-官网下载官方版(中国)官方网站,建议取到肿瘤样本后熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,立即放到RNAlater中保存博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩熊猫体育-【中国区】官方平台网站918博天堂(中国区)-官方网站,充分浸润后九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)XC·sports-官网下载官方版(中国)官方网站意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光,-80℃保存熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台918博天堂(中国区)-官方网站bsports(中国区)B—sports体育登录入口, 干冰运输;或者样本取得后立即液氮速冻(要充分)熊猫体育-【中国区】官方平台网站918博天堂(中国区)-官方网站,-80℃保存九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页),干冰运输熊猫体育-【中国区】官方平台网站意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)。尽可能减少组织样本在常温空气中暴露时间博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,保证RNA的完整性九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOME熊猫体育-【中国区】官方平台网站。

拓展材料

更多內容意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光bsports(中国区)B—sports体育登录入口,可掃描側邊欄"一對一業務咨詢"二維碼添加科研服務經理咨詢bsports(中国区)B—sports体育登录入口博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩。

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