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轉錄調控測序

smallRNA测序 ——研究small RNA功能及调控机制

小RNA(Small RNAzoty中欧·(中国集团公司)官方网站意昂体育·[官方网]有限公司官网,sRNA)通过特异性地识别结合 RNA 诱导的沉默复合体(RISC)对目标 mRNA 的表达在转录和翻译水平进行抑制意昂体育·[官方网]有限公司官网熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站,在调节個体发育、细胞增殖分化、肿瘤的发生发展及抗病毒等整個细胞水平的几乎所有事件中起着重要的调控作用意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!,是细胞中高度复杂的 RNA 调控网络中的重要成员熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站。目前广为研究的small RNA 主要是miRNA、siRNA和 piRNAzoty中欧·(中国集团公司)官方网站U8国际·[中国区]有限公司官网,其中 miRNA 的研究最为深入熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站。
Small RNA测序采用Illumina测序平台意昂体育·[官方网]有限公司官网威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站,可针对样本中的sRNA展开分析威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站意昂凯捷4(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」,既能鉴定已知sRNA、也能预测新的sRNA并预测sRNA的靶基因意昂体育·[官方网]有限公司官网U8国际·[中国区]有限公司官网威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站,为研究small RNA功能及调控机制提供有力手段意昂体育·[官方网]有限公司官网U8国际·[中国区]有限公司官网熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站。

應用方向

small RNA适合生命体生长发育等各個阶段、部位或方面的研究意昂凯捷4(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」沐鸣娱乐II(中国)官方平台资讯站_沐鸣娱乐2意昂体育·[官方网]有限公司官网。
  • 植物方向

    植物對環境的適應性、突發、個體發育、遺傳性狀
  • 動物方向

    農藝性狀、適應性、個體發育、遺傳性狀、藥物幹預模式動物調控機制
  • 真菌方向

    機理性、應用性、藥用食用性研究

諾禾優勢

  • 1. 周期快、质量好U8国际·[中国区]有限公司官网威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站,稳定性高

    Small RNA通过先进的测序平台球客岛-专业体育赛事直播资讯平台,一次性可获得数百万条序列球客岛-专业体育赛事直播资讯平台熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站U8国际·[中国区]有限公司官网,结合先进的分析方法球客岛-专业体育赛事直播资讯平台威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站,可在全基因组水平快速鉴定和预测各种类型的Small RNA沐鸣娱乐II(中国)官方平台资讯站_沐鸣娱乐2意昂体育·[官方网]有限公司官网,得到与调控相关的所有基因威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站意昂体育·[官方网]有限公司官网意昂凯捷4(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」。
    • 項目周期45天

    • 測序平台Novaseq

  • 2. 方案设计专业沐鸣娱乐II(中国)官方平台资讯站_沐鸣娱乐2,质控严格

    诺禾Small RNA测序采用Illumina测序平台意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站意昂体育·[官方网]有限公司官网,可针对样本中的sRNA展开分析熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站意昂凯捷4(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」,既能鉴定已知sRNA、也能预测新的sRNA并预测sRNA的靶基因zoty中欧·(中国集团公司)官方网站,为研究small RNA功能及调控机制提供有力手段熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站意昂凯捷4(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」。

    材料選取

    提取RNA
    ≥ 2 μg

    文庫構建
    諾禾致源独有
    smallRNA文庫

    SE50測序
    6~20Mb

    信息分析

  • 3. 项目文章以及物种经验丰富

    諾禾致源已经成功对鼠、猪、牛、水稻、葡萄、芒草、南极鱼、鲟鱼、红旗东方魨、大鲵、扬子鳄、梭子蟹、对虾、扇贝、海参、疟原虫、蝗虫等300多個物种进行small RNA测序分析沐鸣娱乐II(中国)官方平台资讯站_沐鸣娱乐2意昂凯捷4(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」意昂体育·[官方网]有限公司官网,并在The Plant Cell、 Scientific Reports等权威期刊发表文章20多篇U8国际·[中国区]有限公司官网。
    • 80人

      分析團隊
    • 7年

      項目經驗
    • 2000+

      結題項目
    • 1對1

      項目服務

信息分析

诺禾高通量测序技术可以对样本中small RNA进行测序和表达定量意昂凯捷4(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」zoty中欧·(中国集团公司)官方网站熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站,从而解析sRNA和其它非编码RNA以及相应靶序列熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站。测序原始数据质控后U8国际·[中国区]有限公司官网,进行Clean reads 长度分布统计意昂凯捷4(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站,small RNA注释沐鸣娱乐II(中国)官方平台资讯站_沐鸣娱乐2球客岛-专业体育赛事直播资讯平台, 已知 miRNA 注释意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!,已知piRNA注释意昂体育·[官方网]有限公司官网zoty中欧·(中国集团公司)官方网站,ncRNA分析意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!U8国际·[中国区]有限公司官网,新miRNA 预测(有参考基因组)zoty中欧·(中国集团公司)官方网站意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站,差异基因分析意昂体育·[官方网]有限公司官网,miRNA 家族分析U8国际·[中国区]有限公司官网意昂体育·[官方网]有限公司官网,差异表达 miRNA 聚类分析意昂凯捷4(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」沐鸣娱乐II(中国)官方平台资讯站_沐鸣娱乐2,miRNA靶基因预测K8凯发就来凯发集团【China官网】天生赢家一触即发U8国际·[中国区]有限公司官网熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站,靶基因GO、KEGG富集分析zoty中欧·(中国集团公司)官方网站威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站。协助研究者从海量数据中 找出与条件相关的特异性基因zoty中欧·(中国集团公司)官方网站, 然后进?步分析这些特异性基因的生物学意义熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站U8国际·[中国区]有限公司官网沐鸣娱乐II(中国)官方平台资讯站_沐鸣娱乐2。

關聯分析

  • 1.miRNA与lncRNA關聯分析

    • 当lncRNA上带有miRNA结合位点时球客岛-专业体育赛事直播资讯平台沐鸣娱乐II(中国)官方平台资讯站_沐鸣娱乐2,miRNA可与lncRNA结合影响lncRNA的功能意昂体育·[官方网]有限公司官网熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站U8国际·[中国区]有限公司官网。同时威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站,根据ceRNA理论意昂凯捷4(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」zoty中欧·(中国集团公司)官方网站,miRNA可以通过RISC与lncRNA结合意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!意昂凯捷4(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」,指导lncRNA的降解U8国际·[中国区]有限公司官网意昂体育·[官方网]有限公司官网熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站。miRNA的靶向lncRNA预测分析威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站沐鸣娱乐II(中国)官方平台资讯站_沐鸣娱乐2zoty中欧·(中国集团公司)官方网站,可通过生信分析 软件预测差异表达的miRNA的靶向lncRNAK8凯发就来凯发集团【China官网】天生赢家一触即发。
  • 2.miRNA与mRNA關聯分析

    • 根據miRNA對mRNA的抑制作用原理意昂体育·[官方网]有限公司官网,篩選顯著下調的miRNA和顯著上調的mRNA球客岛-专业体育赛事直播资讯平台,以及顯著上調的miRNA和顯著下調的mRNA的組合作爲靶基因對意昂凯捷4(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」。
  • 3.miRNA与CircRNA關聯分析

    • CircRNA通過與miRNA結合的方式抑制miRNA的功能意昂凯捷4(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站K8凯发就来凯发集团【China官网】天生赢家一触即发。通過生信軟件分析預測circRNA和miRNA的靶向關系威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站。

送樣建議

樣品類型 送樣量 備注

新鮮動物組織幹重

內髒組織、腦組織≥0.5g脂肪、皮膚、骨頭、血管等其他組織≥2g

核酸不丰富部位沐鸣娱乐II(中国)官方平台资讯站_沐鸣娱乐2, 例如脂肪、成熟皮肤、骨头等部位建议酌情增加送樣量

新鮮植物組織幹重

叶片、花≥?0.8g 根、茎、种子等其他组≥2g

成熟部位意昂凯捷4(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」zoty中欧·(中国集团公司)官方网站,例如植物茎、根、种子等部位建议酌情增加送樣量

新鮮培養細胞

≥1×10 7  

BD采血管

≥2管

血液樣本送樣前加入EDTA抗凝管意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!意昂凯捷4(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」zoty中欧·(中国集团公司)官方网站,推薦使用BD管送樣

Total RNA建库起始量

總量:≥2ug 浓度:≥50ng/uL;体积:20uL ≤ V ≤120uL

常見問題

  • 1.小 RNA 測序對樣品提取有什麽特殊要求意昂体育·[官方网]有限公司官网K8凯发就来凯发集团【China官网】天生赢家一触即发?

    • 提取总RNA时建议不要使用过柱试剂盒熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站球客岛-专业体育赛事直播资讯平台意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!,也不要使用LiCl沉淀zoty中欧·(中国集团公司)官方网站,以免丢失小片段RNAK8凯发就来凯发集团【China官网】天生赢家一触即发zoty中欧·(中国集团公司)官方网站。如果直接提供small RNA样品意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!,可以使用small RNA提取专用试剂盒来进行提取沐鸣娱乐II(中国)官方平台资讯站_沐鸣娱乐2。
  • 2.爲什麽實驗結果中會存在降解的 rRNA序列zoty中欧·(中国集团公司)官方网站熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站?

    • 由于 total RNA 会发生轻微的降解沐鸣娱乐II(中国)官方平台资讯站_沐鸣娱乐2K8凯发就来凯发集团【China官网】天生赢家一触即发,生物体内也有自然的降解过程意昂凯捷4(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」K8凯发就来凯发集团【China官网】天生赢家一触即发zoty中欧·(中国集团公司)官方网站,因此实验结果中会含有小部分 mRNA 降解片段zoty中欧·(中国集团公司)官方网站K8凯发就来凯发集团【China官网】天生赢家一触即发。但通常比例很低意昂凯捷4(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站,并且取决于样品 total RNA 的质量意昂体育·[官方网]有限公司官网zoty中欧·(中国集团公司)官方网站。
  • 3.進行小 RNA 測序時意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站意昂体育·[官方网]有限公司官网,客戶除了樣品以外還需要提供哪些相關信息K8凯发就来凯发集团【China官网】天生赢家一触即发?

    • 需要提供相應物種的參考基因組相關信息意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!U8国际·[中国区]有限公司官网。如果沒有本物種的基因組意昂体育·[官方网]有限公司官网,需要提供近緣物種的相關信息U8国际·[中国区]有限公司官网。

拓展材料

  • 收藏好文

    Small RNA测序球客岛-专业体育赛事直播资讯平台意昂体育·[官方网]有限公司官网,只懂miRNA你就out了!
  • 線上課程

    轉錄調控多組學拓新應用專題研討會

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