Stereo-seqFFPE空间轉錄組測序-超高分辨率、全物种的原位全景式技术
-
Stereo-seqFFPE空間轉錄組技术能同时检测到组织里每个细胞的基因信息和空间位置MK(体育科技有限公司)体育·官方网站,其使用的芯片是基于DNBSEQ测序技术研制的具有空间位置信息的、阵列式排布的DNA纳米球空间捕获芯片沐鸣娱乐-中国集团「一家走心的游戏平台」杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站。该芯片可以实现超高精度和超大视野的生命分子成像沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!,其分辨率可达500纳米(单个细胞可被400个像素点捕获)MK(体育科技有限公司)体育·官方网站沐鸣娱乐-中国集团「一家走心的游戏平台」意昂4体育(中国)数字娱乐技术创新平台。实现器官和生命全景分子细胞图谱的绘制PA视讯(中国区)官网 - PlayAce沐鸣娱乐-中国集团「一家走心的游戏平台」杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站。
信息分析
|
根據空間基因表達譜探究不同細胞類型的位置和功能信息
|
空間擬時序分析可展示組織微環境下的細胞分化軌迹
|
|
利用基因表達差異數據揭示組織異質性
|
探究空間背景下細胞間的相互作用關系
|
|
通過差異基因篩選細胞或疾病的marker基因
|
富集分析可展示在特定條件下富集的生物學功能或基因通路
|
常見問題
-
1.Stereo-FFPE相比与Visium HD有什么优势PA视讯(中国区)官网 - PlayAce杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站沐鸣娱乐-中国集团「一家走心的游戏平台」?
-
答:两个技术同样都是高分辨率的空間轉錄組学技术杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口,Visium HD基于人鼠特异性的探针捕获原理沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!,对于低表达量基因捕获效率更好沐鸣娱乐-中国集团「一家走心的游戏平台」,而Stereo-FFPE基于随机引物捕获原理沐鸣娱乐-中国集团「一家走心的游戏平台」qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网,不仅可以应用于人和小鼠杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME,也可对其他物种样本进行时空组学信息挖掘PA视讯(中国区)官网 - PlayAce。可同时实现 mRNA 和 non-coding RNA的原位捕获PA视讯(中国区)官网 - PlayAce。可同时捕获微生物及其宿主的空间表达信息MK(体育科技有限公司)体育·官方网站,进而探究宿主与微生物的互作关系XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版。
-
2.Stereo-FFPE空間轉錄組能够兼容的样本类型有哪些PA视讯(中国区)官网 - PlayAce意昂4体育(中国)数字娱乐技术创新平台?
- 答:除了兼容福尔马林固定石蜡包埋的组织块(FFPE)以外意昂4体育(中国)数字娱乐技术创新平台,对于无法邮寄石蜡块的老师qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口,可以选择展平的石蜡片放入50ml离心管中(不贴片)4-6张(每张单独放一个离心管内)邮寄至諾禾致源
-
3.Stereo-FFPE空間轉錄組对于样本质量的要求是什么沐鸣娱乐-中国集团「一家走心的游戏平台」XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!?
-
4.Stereo-FFPE空间轉錄組測序结果中XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版,lncRNA一般占比是多少XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME?
- 答:lncRNA MID/Total MID:人样本为6%~12%;小鼠样本为5%~9%(该数据针对部分研发数据分析沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网,因受样本量限制沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!沐鸣娱乐-中国集团「一家走心的游戏平台」XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版,您的实测数据中该比例可能会略有差异)杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站XC sport·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版PA视讯(中国区)官网 - PlayAce。
-
5.對于FFPE樣本目前可以做ssDNA染色後再添加鄰片H&E圖像作爲底片加進去用來做組織分割嗎PA视讯(中国区)官网 - PlayAce杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网MK(体育科技有限公司)体育·官方网站?如果用H&E染色來做細胞分割沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!,目前有第三方接入流程嗎qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口意昂4体育(中国)数字娱乐技术创新平台?
-
答:可以鄰片H&E切片圈組織結構PA视讯(中国区)官网 - PlayAcePA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMEqy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口,受鄰片配准精度限制沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!,組織分割結果需要用戶手動介入進行調整;另外H&E染色做細胞分割效果可能不佳意昂4体育(中国)数字娱乐技术创新平台qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口,如果您有細胞分割的需求沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站沐鸣娱乐-中国集团「一家走心的游戏平台」,我們建議您選擇ssDNA染色方案意昂4体育(中国)数字娱乐技术创新平台MK(体育科技有限公司)体育·官方网站,時空StereoMap軟件兼容任何第三方軟件的細胞分割結果PA视讯(中国区)官网 - PlayAce。
-
6.Stereo-FFPE空間轉錄組分析结果中沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME意昂4体育(中国)数字娱乐技术创新平台,微生物检测PA视讯(中国区)官网 - PlayAcePA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME,一次能检测到多少种微生物MK(体育科技有限公司)体育·官方网站?可以看到捕获的基因数吗沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!意昂4体育(中国)数字娱乐技术创新平台?
-
答:對于微生物的檢測種類PA视讯(中国区)官网 - PlayAce,主要看數據庫的選擇意昂4体育(中国)数字娱乐技术创新平台PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMEqy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口。我們提供了相對權威的數據庫Kraken2?MK(体育科技有限公司)体育·官方网站沐鸣娱乐-中国集团「一家走心的游戏平台」PA视讯(中国区)官网 - PlayAce,但用戶也可以自己配置其他數據庫到流程中;目前對于微生物可以定位到“種”沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!沐鸣娱乐-中国集团「一家走心的游戏平台」杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网,目前是看不到捕獲的微生物基因數PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!PA视讯(中国区)官网 - PlayAce。(因爲數據庫主要作用是菌種鑒定)
更多內容意昂4体育(中国)数字娱乐技术创新平台,可掃描側邊欄"一對一業務咨詢"二維碼添加科研服務經理咨詢MK(体育科技有限公司)体育·官方网站。
售後服務可聯系側邊欄"在線客服"、電話400-6581585qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口,或發送郵件至 service@novogene.com