基因組測序>
建庫測序>
人类基因組測序>
动植物基因組測序>
微生物基因組測序>
轉錄調控測序>
表觀組測序>
單細胞測序>
空間轉錄組>
基因分型>
質譜分析>
蛋白組學分析>
代謝組學分析>
血液蛋白質組分析>
多組學聯合分析>
分子育種>
基因合成>
遺傳圖譜—精确构建连锁遗传图
遗传连锁图谱(Genetic linkage map):又叫连锁图谱(Linkage map)熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台PA视讯(中国区)官网 - PlayAce,指分子标记在染色体上的相对位置kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站MK(体育科技有限公司)体育·官方网站,用遗传距离来衡量距离熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台。遗传距离单位是厘摩(cM)沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!MK(体育科技有限公司)体育·官方网站意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台, 表示分子标记在染色体交换过程中的重组频率熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台。
图1 常见家系
遺傳圖譜分析方法:
1. 高密度遺傳圖譜
以連鎖遺傳中染色體的交換和重組爲基礎lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」,通過連續多次兩點或三點測驗等方法計算出交換值lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司,確定位于同一染色體基因的相對位置的距離意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台,繪成連鎖遺傳圖MK(体育科技有限公司)体育·官方网站。
图2 高密度连锁图谱
2. 多倍体遺傳圖譜
多倍化是植物的进化驱动力之一意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台,基于多倍体物种在生长活力、生物量积累和抗逆适应性等方面的优势MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长kg体育·(中国China)官方网站,一直较难破译的多倍体物种意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」MK(体育科技有限公司)体育·官方网站,其遺傳圖譜的构建相比于二倍体要复杂得多kg体育·(中国China)官方网站意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台。諾禾致源针对多倍体物种开发的图谱构建流程已助力科研论文成功发表MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长。
图3 多倍体遺傳圖譜
應用方向
1. QTL定位与功能挖掘
通過表型性狀與標記間的連鎖分析來確定QTL在染色體上的位置、效應lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台,進而實現性狀相關基因的挖掘MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台。
2. 辅助基因组组装
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3. 比较基因组学分析
通過表型性狀與標記間的連鎖分析來確定QTL在染色體上的位置、效應lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司kg体育·(中国China)官方网站PA视讯(中国区)官网 - PlayAce,進而實現性狀相關基因的挖掘MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长。
4. 分子标记辅助育种
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諾禾優勢
1.高速度 高密度 高质量
基于全基因组重测序或简化基因組測序的检测方法沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!,可一次性快速开发大量的分子标记熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司MK(体育科技有限公司)体育·官方网站, 测序数据和上图标记质量高MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!,可获得高饱和或者超密度遺傳圖譜PA视讯(中国区)官网 - PlayAceMK(体育科技有限公司)体育·官方网站,已广泛应用于各种模式和非模式生物遺傳圖譜构建熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台。2.高質量測序數據熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台MK(体育科技有限公司)体育·官方网站MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长,高性能計算平台
BSA性狀定位采用先进的高通量测序平台熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站,快速、高效地读取高质量的测序数据MK(体育科技有限公司)体育·官方网站意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台。 諾禾致源高性能计算平台(High Performance Computingkg体育·(中国China)官方网站,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司PA视讯(中国区)官网 - PlayAce意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台,实现快速稳定的 测序数据分析及交付kg体育·(中国China)官方网站沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!。随着公司业务的发展沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!,高性能计算平台将会持续 更新并扩容lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!,以保证高效的数据处理和安全的数据存储kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台。PE150
測序讀長≥85%
測序質量Q3020,280個
物理核數1,727 T flops
計算峰值速度400 TB
總內存58.6PB
總儲存3.出色完成每一個項目環節
至2021年12月kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长,諾禾致源已对畜牧、作物、果蔬、花卉、普通植物、水产等上百个物种进行了遺傳圖譜构建MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」。“科学 的方案设计MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长MK(体育科技有限公司)体育·官方网站,严格的质控管理lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」,专业的分析團隊MK(体育科技有限公司)体育·官方网站lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台,丰富的項目經驗MK(体育科技有限公司)体育·官方网站,优质的項目服務” 确保每一个环节都能出色完成lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司,助力科学研究MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长kg体育·(中国China)官方网站PA视讯(中国区)官网 - PlayAce。50人
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群體類型
F1、F2、BC、
RILs等
群體大小
≥150
WGS(350bp文庫)
親本:10-30×/個
子代:≥5×/個
子代GBS
Tag≥10萬/RAD
測序≥1×/個
信息分析
信息分析
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|---|---|
| 測序數據質量評估 | 測序數據質量評估 |
| 與參考基因組比對 | 與參考基因組比對(有参) 與擬參考基因組比對(無參) |
| 群體SNP檢測及注釋 | 群體SNP檢測及注釋 |
| 遺傳標記開發及過濾 | 遺傳標記開發及過濾 |
| 遺傳圖譜构建及质量评估 | 遺傳圖譜构建及质量评估 |
常見問題
1. 亲本如何选择lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台?
2. 构建图谱的軟件有哪些意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台?各有什么区别与联系PA视讯(中国区)官网 - PlayAceMG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台?
3. 不同群体如何选择上图标记意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司PA视讯(中国区)官网 - PlayAce?
4. 图谱质量判定标准有哪些MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」lehu·乐虎-(88国际)官方网站有限公司?
5. 常用的QTL作图軟件有哪些沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台?各有什么不同kg体育·(中国China)官方网站?
| 軟件 | WinQTL | MapQTL | IciMapping | QTLNetwork |
|---|---|---|---|---|
| 適用群體 | BC、DH、RIL、F2 | F1、F2、RIL、BC、DH | BC、DH、RIL、F2 | F2、RIL、BC、DH |
| 標記限制 | 每條染色體不高于1000 | 總數不高于7000 | 10000以內 | 無限制 |
| 定位方法 | IM、CIM、MIM | IM、MQM | IM、ICIM | MCIM |
| 定位結果 | LOD、貢獻率、加性效應、顯性效應 | LOD、貢獻率、加性效應顯性效應 | LOD、貢獻率、加性效應、顯性效應、上位性效应 | LOD、貢獻率、加性效應、顯性效應、上位效應 |
參考文獻
[1] Gu Q , Ke H , Liu Z , et al. A high-density genetic map and multiple environmental tests reveal novel quantitative trait loci and candidate genes for fibre quality and yield in cotton[J]. Theoretical and Applied Genetics, 2020.更多內容PA视讯(中国区)官网 - PlayAce,可掃描側邊欄"一對一業務咨詢"二維碼添加科研服務經理咨詢意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台。
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