諾禾致源

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科技服務

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表觀組測序

ChIP-seq—DNA-蛋白質相互作用研究技術

结合染色质免疫共沉淀技术(ChIP)和高通量測序技术熊猫体育「中国Panda」直播官方网站,对目的蛋白结合的 DNA 片段进行测序球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口,能够高效地在全基因组范围内检测与組蛋白修飾、转录因子等互作的 DNA 区段zoty中欧·(中国有限公司)官方网站必一·运动(B - Sports)体育官方网站熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS。
  • 全基因組範圍:

    獲取全基因組範圍特定目的蛋白與DNA的互作信息熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS。
  • 抗體類型豐富:

    具有多种商品化 ChIP级抗体杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网,高效支持实验开展意昂体育·[官方网]有限公司官网球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口。

應用方向

組蛋白修飾
轉錄因子靶點檢測
超級增強子鑒定

諾禾優勢

  • 1. 实验稳定

    诺禾ChIP-seq可稳定获得全基因组范围内研究蛋白特异结合的DNA片段球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口,分析組蛋白修飾及表觀遺傳修饰的信息熊猫体育「中国Panda」直播官方网站zoty中欧·(中国有限公司)官方网站必一·运动(B - Sports)体育官方网站。
  • 2. 项目文章以及物种经验丰富

    諾禾致源已经成功完成对人、小鼠、斑马鱼、酵母、水稻、拟南芥、玉米、烟草、棉花等物种进行ChIP-seq分析意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光,助力 客户在Cell、Nucleic Acids Research、Nature Communications、Cancer Research等权威杂志发表多篇高水平文章杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网。
  • 3. 生信分析內容丰富

    諾禾ChIP-seq基于文章中高頻出現的分析內容球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口vsport-(中国区)官方网站,搭建ChIP-seq與RNA-seq關聯分析PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAce熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS。
  • 4. 科学的方案设计

    从材料選取熊猫体育「中国Panda」直播官方网站意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网,建庫測序杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAce,到数据分析意昂体育·[官方网]有限公司官网熊猫体育「中国Panda」直播官方网站,每一步都经过科学、缜密的设计zoty中欧·(中国有限公司)官方网站必一·运动(B - Sports)体育官方网站,以保障高质量研究成果熊猫体育「中国Panda」直播官方网站。

    材料選取

    DNA樣品

    文庫構建
    ChIP-seq文庫

    高通量測序

    信息分析

信息分析

諾禾致源ChIP-seq测序项目PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAce,对IP下来的合格DNA样本进行建庫測序获得高质量的reads意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网zoty中欧·(中国有限公司)官方网站,通过motif分析判断IP实验的特异性以及分析的可信性必一·运动(B - Sports)体育官方网站意昂体育·[官方网]有限公司官网球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口,高效预测相关基因zoty中欧·(中国有限公司)官方网站杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网熊猫体育「中国Panda」直播官方网站,并对其进行功能富集分析意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光vsport-(中国区)官方网站杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网,预测特异蛋白的功能?、组蛋白染色体结合图谱以及DNA的表观修饰球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAce。
分析內容 解決問題
測序數據質量評估 過濾掉低質量數據熊猫体育「中国Panda」直播官方网站,保證數據質量
與參考基因組比對 reads分布及比對結果可視化
peak峰calling 分析蛋白結合位點
motif分析 蛋白結合序列的偏好性
peak峰相關基因注釋 尋找蛋白潛在調控基因
差異peak分析 分析不同樣本間差異peak峰
相關基因功能分析 相关基因GO, KEGG富集分析

關聯分析

通过ChIP-seq数据与基因表达进行關聯分析熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口,可以进一步研究組蛋白修飾/转录因子是如何调控下游基因意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光熊猫体育「中国Panda」直播官方网站。基于多组学文章中的应用场景和经验意昂体育·[官方网]有限公司官网熊猫体育「中国Panda」直播官方网站意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光,諾禾致源搭建了内容丰富的ChIP-seq与转录组關聯分析流程zoty中欧·(中国有限公司)官方网站熊猫体育「中国Panda」直播官方网站意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光,以助力科研者们发表高分文章熊猫体育「中国Panda」直播官方网站球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口。
ChIP-seq与RNA-seq關聯分析 1. 整体上的关联vsport-(中国区)官方网站必一·运动(B - Sports)体育官方网站意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光,展示表达水平和表观水平、不同表达水平的基因上下游的表观信号分布以及表观信号的变化程度与表达水平变化之间的关联
2. 差异表达与表观水平的关联zoty中欧·(中国有限公司)官方网站,展示表达水平发生变化的那些基因所对应的表观水平的情况
3. 差異表觀水平與表達水平的關聯zoty中欧·(中国有限公司)官方网站,對于表觀水平發生變化的區域(差異峰)vsport-(中国区)官方网站zoty中欧·(中国有限公司)官方网站,展示其對應的基因的表達水平情況
4. 差異表達水平與差異表觀水平的關聯意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光熊猫体育「中国Panda」直播官方网站,差異表達基因與差異峰相關基因之間的交集情況PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAce熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口,並對各種交集的基因做GO和KEGG富集分析

送樣建議

類型 送樣建議
動物組織 0.5~1 g
植物組織 3~5 g
細胞數量(固定後送樣) >107

常見問題

  • 1. Input和IP样本之间的关系是什么意昂体育·[官方网]有限公司官网意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光?

    • Input和IP属于两個样本PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAce意昂体育·[官方网]有限公司官网,:在前期检测、建库、测序环节中都是平行进行的zoty中欧·(中国有限公司)官方网站意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光,但是分析中需要将两個样本的测序数据进行整合分析杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网,得出最终的Peak结果必一·运动(B - Sports)体育官方网站杏宇娱乐-杏宇注册登录-平台官网,并进行后续分析球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光。
  • 2.Input是什麽意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光必一·运动(B - Sports)体育官方网站?有什麽作用zoty中欧·(中国有限公司)官方网站熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS?

    • DNA片段化后zoty中欧·(中国有限公司)官方网站,在进行免疫沉淀前vsport-(中国区)官方网站,需要取一部分断裂后的染色质做Input对照(不进行免疫沉淀过程)vsport-(中国区)官方网站。Input是断裂后的基因组DNAPA视讯(中文站) - 官方网站PlayAce熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光,需要与沉淀后的样本DNA一起经过逆转交联、DNA纯化以及其他方法检测意昂体育·[官方网]有限公司官网。通过后续数据分析必一·运动(B - Sports)体育官方网站,我们可以通过Input对照排除背景噪音(非特异性结合所造成的假阳性Peaks)vsport-(中国区)官方网站熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS,验证染色质断裂的效果和整個实验中IP效果意昂体育·[官方网]有限公司官网,所以Input对照是IP-seq实验必不可少的步骤PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAcezoty中欧·(中国有限公司)官方网站。

拓展材料

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