諾禾致源

 > 

科技服務

 > 

基因組測序

宏基因組測序(二代)

宏基因組測序—一步到位还原菌群及其功能组成

宏基因组学(Metagenomics)MG不朽情缘·(中国版区)官方网站,又称元基因组学beat·365(中文)-唯一官方认证网站CQ9(电子中国)在线官方网站,是以特定生境中的整个微生物群落作为研究对象澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站,无需分离培养long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站,直接提取环境样本DNA进行测序PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMElong8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站,研究环境微生物的群落 结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络等球客岛-足球比分直播平台XC-sports(中国区)-体育官方网站入口HOME_U8国际_U8共创美好未来,已广泛应用于微生物领域球客岛-足球比分直播平台MG不朽情缘·(中国版区)官方网站。

應用方向

  • 人體或動物微生態及其與疾病關聯:

    如腸道菌群HOME_U8国际_U8共创美好未来,皮膚菌群MG不朽情缘·(中国版区)官方网站PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMEbeat·365(中文)-唯一官方认证网站,口腔菌群long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站,肥胖、糖尿病、癌症等患者腸道微生物;
  • 自然環境微生態:

    如作物根系或受汙染等土壤微生物long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站MG不朽情缘·(中国版区)官方网站,海洋、冰川、汙水等水體微生物;
  • 工業環境微生態:

    如食品发酵液、酸性工业废水、污泥处理器等微生物多样性球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口,以及产甲烷菌、硝化 / 反硝化细菌的功能基因研究澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站HOME_U8国际_U8共创美好未来。
  • 食品或藥品的微生物安全檢測beat·365(中文)-唯一官方认证网站。

諾禾優勢

  • 1.周期短PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME,通量高CQ9(电子中国)在线官方网站MG不朽情缘·(中国版区)官方网站,信息全

    諾禾致源宏基因组研究采用先进的Illumina测序平台澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站HOME_U8国际_U8共创美好未来,结合样品特点 和数据的产出澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站球客岛-足球比分直播平台,选取较好组装效果HOME_U8国际_U8共创美好未来MG不朽情缘·(中国版区)官方网站beat·365(中文)-唯一官方认证网站,充分挖掘环境样品中的微生物菌群和功能基因MG不朽情缘·(中国版区)官方网站。 具有“周期短、通量高、信息全”的优势beat·365(中文)-唯一官方认证网站,已广泛应用于土壤、海洋等研究中MG不朽情缘·(中国版区)官方网站。
  • 2. 提取经验丰富

    糞便、土壤、水體濾膜、發酵液、口腔拭子等MG不朽情缘·(中国版区)官方网站球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口,數萬例樣品的提取經驗
  • 3. 分析手段全面

    單樣本組裝、混合組裝、Readsmapping流程任您選擇球客岛-足球比分直播平台CQ9(电子中国)在线官方网站MG不朽情缘·(中国版区)官方网站,充分挖掘物種信息和功能XC-sports(中国区)-体育官方网站入口MG不朽情缘·(中国版区)官方网站。
    • 60人+

      分析團隊
    • 10年+

      項目經驗
    • 10000+

      結題項目

信息分析

分析內容=標准分析+高級分析澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站。
以特定生境中的整個微生物群落作爲研究對象MG不朽情缘·(中国版区)官方网站PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMEbeat·365(中文)-唯一官方认证网站,直接提取群落樣本的DNA球客岛-足球比分直播平台XC-sports(中国区)-体育官方网站入口,采用二代測序技術PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMEHOME_U8国际_U8共创美好未来XC-sports(中国区)-体育官方网站入口,獲得群落微生物基因信息總和long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站。
分析內容 解決問題
測序數據質量評估 過濾掉低質量數據HOME_U8国际_U8共创美好未来MG不朽情缘·(中国版区)官方网站beat·365(中文)-唯一官方认证网站,保證數據質量
基因預測 基因預測及相关性分析
物種、功能注釋 物種、基因功能注釋及相關分析
VFDB 細菌致病菌毒力因子相關分析
MGEs 轉移原件相關分析
PHI 病原體-宿主相互作用相關分析

高級分析 解決問題
碳氮硫循環分析 地球化學循環功能分析
噬菌體分析 噬菌體及前噬菌體預測及分析
binning+單菌組裝 獲得無法分離培養的單菌基因組
CCA/RDA 分析 菌群與環境因子相關分析

送樣建議

樣本類型 建議送樣量 最低送樣量
土壤/汙泥/沈積物/腐殖質 3g 1g
水体滤膜(孔径 0.22-0.45μm/直径 3-4cm) 3張 1張
空氣濾膜(直徑種類多PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME,與采樣器搭配beat·365(中文)-唯一官方认证网站CQ9(电子中国)在线官方网站long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站,有明顯顔色沈澱在濾膜上) 3張 1張
拭子 5-10個 3個
瘤胃液/發酵液/組織液/沖洗液(離心有明顯沈澱) 3-5mL,沈澱1g 1mL,沈澱0.5g
糞便/腸道內容物 2g(小鼠6-10粒) 0.5g(小鼠3粒)
動物/人組織 1g 0.5g
牛奶/酸奶 30mL/50g 10mL/5g
食糜 2g 1g
食品表面拭子 10個 5個

常見問題

  • 1.做Meta 分析需要有生物学重复吗HOME_U8国际_U8共创美好未来MG不朽情缘·(中国版区)官方网站?

    • 自然环境 (土壤、水体、发酵物、食品等): 至少3個生物学重复MG不朽情缘·(中国版区)官方网站long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站CQ9(电子中国)在线官方网站,推荐5個生物学重复
      体内样本(肠道、粪便、口腔拭子、胃组织样等):个体特异性高球客岛-足球比分直播平台,易出现样本偏离CQ9(电子中国)在线官方网站MG不朽情缘·(中国版区)官方网站球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口,至少3個重复球客岛-足球比分直播平台,推荐6-10個重复以上球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口球客岛-足球比分直播平台MG不朽情缘·(中国版区)官方网站。
  • 2.糞便樣品制備注意事項

    • 糞便的保存球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口球客岛-足球比分直播平台MG不朽情缘·(中国版区)官方网站,可放在-80℃beat·365(中文)-唯一官方认证网站long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站,根據經驗PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMECQ9(电子中国)在线官方网站beat·365(中文)-唯一官方认证网站,取內部糞便提取基因組最好HOME_U8国际_U8共创美好未来,但是不易操作MG不朽情缘·(中国版区)官方网站CQ9(电子中国)在线官方网站PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME。由于糞便自身的特殊性beat·365(中文)-唯一官方认证网站CQ9(电子中国)在线官方网站球客岛-足球比分直播平台,建議隨時收集隨時保存MG不朽情缘·(中国版区)官方网站long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站,以便達到較好的DNA提取效果HOME_U8国际_U8共创美好未来CQ9(电子中国)在线官方网站。
  • 3. 对于宏基因组项目球客岛-足球比分直播平台,怎么排除宿主污染HOME_U8国际_U8共创美好未来MG不朽情缘·(中国版区)官方网站beat·365(中文)-唯一官方认证网站?

    • 1. 取样时球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站,尽量不要取靠近组织的部位;
      2. 可采用相应的去宿主试剂盒提惹蚩偷-足球比分直播平台澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站。
      3. 若有参考基因组澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站MG不朽情缘·(中国版区)官方网站,可通过比对分析去除宿主基因组污染beat·365(中文)-唯一官方认证网站球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口。
  • 4.如果存在较大的宿主的污染球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口HOME_U8国际_U8共创美好未来,且没有宿主基因组的参考序列可以进行宏基因組測序吗PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMEXC-sports(中国区)-体育官方网站入口beat·365(中文)-唯一官方认证网站?

    • 不可以CQ9(电子中国)在线官方网站,如果宿主的DNA包含大量的环境DNAlong8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMEMG不朽情缘·(中国版区)官方网站,测序之后澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站球客岛-足球比分直播平台,会存在严重的污染澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站CQ9(电子中国)在线官方网站HOME_U8国际_U8共创美好未来,暂无已知宿主基因组的序列来进行比对去污染long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口MG不朽情缘·(中国版区)官方网站,会影响后续结果分析的准确性球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口,且可用的 數據量会很少;但是如果在提取的过程CQ9(电子中国)在线官方网站HOME_U8国际_U8共创美好未来XC-sports(中国区)-体育官方网站入口,宿主基因组的污染的量较少球客岛-足球比分直播平台PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME,后期的数据分析暂可忽略污染PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMEXC-sports(中国区)-体育官方网站入口球客岛-足球比分直播平台。
  • 5.不同樣本測多少數據量合適HOME_U8国际_U8共创美好未来long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站,有沒有依據PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME?

    • 一般遵循文章影響因子越高澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站,樣本量和數據量越高的規律澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站beat·365(中文)-唯一官方认证网站。嬰兒腸道、糞便等簡單環境推薦6G以上數據量XC-sports(中国区)-体育官方网站入口,水體、土壤、淤泥等複雜環境推薦12G以上數據量XC-sports(中国区)-体育官方网站入口MG不朽情缘·(中国版区)官方网站long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站。
      雜志名 發表時間 研究方向 樣本數 數據量
      Nature 2012.01 2型糖尿病 145例中國人粪便样本 378.4G
      Nature 2013.08 肥胖與超肥胖 147例糞便樣本 393G
      Pans 2014.05 小鼠腸道 80例糞便樣本 8.54G
      Cell Host&Microbe 2015.10 小兒克羅恩病 366例糞便樣本 870G

更多內容CQ9(电子中国)在线官方网站HOME_U8国际_U8共创美好未来XC-sports(中国区)-体育官方网站入口,可掃描側邊欄"一對一業務咨詢"二維碼添加科研服務經理咨詢long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站球客岛-足球比分直播平台澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站。

售後服務可聯系側邊欄"在線客服"、電話400-6581585HOME_U8国际_U8共创美好未来,或發送郵件至 service@novogene.com

Copyright@2011-2025 All Rights Reserved    版权所有:北京諾禾致源科技股份有限公司    京ICP備15007085號-1

一對一業務咨詢

在線客服

聯系方式

聯系電話

400-658-1585

意昂注册平台

service@novogene.com
意昂5平台登录注册
网站地图sitemap