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基因組測序>
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建庫測序>
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人类基因組測序>
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动植物基因組測序>
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微生物基因組測序>
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轉錄調控測序>
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表觀組測序>
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單細胞測序>
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空間轉錄組>
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基因分型>
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質譜分析>
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蛋白組學分析>
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代謝組學分析>
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血液蛋白質組分析>
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多組學聯合分析>
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分子育種>
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基因合成>
有参轉錄組測序—解析基因表达及结构水平变化
真核有参轉錄組測序（RNA-seq）采用Illumina测序平台球盟会·qmh(中国区)-官方网站熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站，对真核生物特定组织或细胞在某個特定状态下转录的所有mRNA进行测序沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!球盟会·qmh(中国区)-官方网站kg体育(中国区)-体育官方网站入口，與參考基因組比對kg体育(中国区)-体育官方网站入口K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户，既可全面快速分析mRNA序列和丰度信息、又可对基因结构和产生的新转录本进行分析K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口kg体育(中国区)-体育官方网站入口熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站。應用方向
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生長發育
分析發育過程或生長過程時空特異性表達的基因集熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站，描述生長圖譜 -
脅迫研究
研究脅迫環境下的機體響應機制 -
性狀差異
尋找研究對象重要性狀或表型 -
互作關系研究
通過轉錄水平尋找到關鍵調節的基因或者代謝通路beat·365(中文)-唯一官方认证网站，研究宿主與寄主之間相互作用關系
諾禾優勢
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1. 样本起始量低
RNA 0.4 μg/建库 -
2. 周期快、质量好乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!beat·365(中文)-唯一官方认证网站，稳定性高
诺禾真核有参轉錄組測序基于优质的测序平台vsport-(中国区)官方网站，通过reads與參考基因組比對乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户，系统全面的对基因进行表达定量和结构分析意昂体育·[官方网]有限公司官网，获得某個物种在特定条件下的转录信息kg体育(中国区)-体育官方网站入口乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户，实现快速、稳定的测序数据分析及交付beat·365(中文)-唯一官方认证网站沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!。≤30
樣本量21天
周期PE150
讀長≥85%
數據質量Q30
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3. 方案设计专业kg体育(中国区)-体育官方网站入口，质控严格
诺禾真核有参轉錄組測序针对不同的物种和组织部位沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!kg体育(中国区)-体育官方网站入口，采用合适的提取方法；根据不同的需求可提供不同的建库方式；严格要求测序数据质量： Q20＞90％意昂体育·[官方网]有限公司官网beat·365(中文)-唯一官方认证网站，Q30＞85％vsport-(中国区)官方网站熊猫体育「中国Panda」直播官方网站。从材料選取kg体育(中国区)-体育官方网站入口，建庫測序熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站，到数据分析beat·365(中文)-唯一官方认证网站乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站，每一步都经过科学、缜密的设计球盟会·qmh(中国区)-官方网站vsport-(中国区)官方网站，以保障高质量研究成果kg体育(中国区)-体育官方网站入口vsport-(中国区)官方网站。同时諾禾致源高性能计算平台（High Performance Computingkg体育(中国区)-体育官方网站入口，HPC）采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合球盟会·qmh(中国区)-官方网站，实现快速稳定的测序数据分析及交付熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站。 随着公司业务的发展熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站，高性能计算平台将会持续更新并扩容熊猫体育「中国Panda」直播官方网站，以保证高效的数据处理和安全的数据存储K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口。材料選取
RNA样品 ≥0.4μg
文庫構建（普通轉錄組文庫/鏈特異性文庫）
上機測序
信息分析
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4. 项目文章以及物种经验丰富
諾禾致源已经成功对水稻、拟南芥、番茄、花生、棉花、黄瓜、小麦、大鼠等上千個有参考基因组的物种进行了真核有参轉錄組測序分析意昂体育·[官方网]有限公司官网，并助力研究者在Cell Stem Cell、Genome Research、Nature Communications 等权威期刊发表高水平文章多篇熊猫体育「中国Panda」直播官方网站vsport-(中国区)官方网站意昂体育·[官方网]有限公司官网。80人
分析團隊10年
項目經驗20000+
結題項目1對1
項目服務
信息分析
諾禾致源真核有参轉錄組測序项目信息分析球盟会·qmh(中国区)-官方网站熊猫体育「中国Panda」直播官方网站beat·365(中文)-唯一官方认证网站，经过严格数据质控保证数据分析可靠性熊猫体育「中国Panda」直播官方网站vsport-(中国区)官方网站沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!，信息分析分为表达水平分析和结构水平分析球盟会·qmh(中国区)-官方网站。表达水平分析包括基因表达量分析、 相关性分析、差异基因及其富集分析、GSEA分析、WGCNA分析等意昂体育·[官方网]有限公司官网，结构水平包括可變剪切分析、变异位点分析、新轉錄本預測乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户熊猫体育「中国Panda」直播官方网站beat·365(中文)-唯一官方认证网站。| 有參轉錄組 | 分析內容 | 解決問題 |
|---|---|---|
| 標准分析 | 測序數據質量評估 | 過濾掉低質量數據K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口，保證數據質量 |
| 與參考基因組比對 | 比對率分析 | |
| 基因表達水平分析 | 分析基本的表達量 | |
| 樣本相關性分析 | 分析樣本間的相關性大小 | |
| 差異基因分析 | 尋找不同比較組合間的差異基因 | |
| GO/KEGG富集分析 | 差異基因的GO乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!，KEGG富集分析 | |
| 蛋白互作網絡分析 | 差異基因蛋白互作網絡的分析 | |
| GSEA分析 | 基因集富集分析 | |
| WGCNA基因共表達網絡分析 | 分析模塊與樣本間的相關性vsport-(中国区)官方网站乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站，尋找關鍵模塊和hub基因 | |
| 可變剪切分析 | 不同樣本間可變剪接事件的差異分析 | |
| SNP/Indel分析 | 分析變異位點 | |
| 新轉錄本預測 | 挖掘該物種新的基因或轉錄本 |
送樣建議
| 樣本類型 | 送樣建議 |
|---|---|
| 新鮮植物組織幹重 | 叶片、花 ≥ 0.3g； 根、茎、种子等其他组织 ≥ 0.5g |
| 新鮮動物組織幹重 | 内脏组织、脑组织 ≥ 0.08g； 脂肪、皮肤、骨头、血管等其他组织 ≥ 0.3 |
| 新鮮培養細胞 | >≥5*106個 |
| 新采集的全血(加入 TRIzol) | >≥5mL |
| 新采集的全血 (液氮速冻) | >≥2mL |
| PAXgene 采血管 | ≥1 管 |
| 石蠟切片 | 厚度在5-10μm,含組織面積大于25mm2的切片12張vsport-(中国区)官方网站。 |
| 菌體/菌絲 |
>3*106個 >0.3g |
| 半固體細菌 | ≥ 0.5mL |
常見問題
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1.哪些物种可以进行真核有参轉錄組測序?
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做真核有参轉錄組測序熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站，对物种有以下要求：
a. 物种为真核生物；
b. 物种具有参考基因组K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口beat·365(中文)-唯一官方认证网站，至少拼接到scaffold水平；
c. 具有较为完整的注释熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站熊猫体育「中国Panda」直播官方网站沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!。
注：如果没有参考基因组可以选择真核无参轉錄組測序
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做真核有参轉錄組測序熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站，对物种有以下要求：
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2.真核有参轉錄組測序標准分析和DGE分析的关系是什么beat·365(中文)-唯一官方认证网站球盟会·qmh(中国区)-官方网站？
- 真核有参轉錄組測序的標准分析和DGE分析主要的差别在于分析內容上球盟会·qmh(中国区)-官方网站，標准分析除了差异基因富集分析外vsport-(中国区)官方网站K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口，还可以进行基因结构分析乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口。而DGE就是数字基因表达谱 vsport-(中国区)官方网站，一般只分析差异基因kg体育(中国区)-体育官方网站入口熊猫体育「中国Panda」直播官方网站球盟会·qmh(中国区)-官方网站，不进行基因结构分析vsport-(中国区)官方网站熊猫体育「中国Panda」直播官方网站沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!。
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3.真核有参轉錄組測序（RNA-seq）的深度和覆盖度是多少熊猫体育「中国Panda」直播官方网站意昂体育·[官方网]有限公司官网vsport-(中国区)官方网站？
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一般组装基因組測序的项目才会涉及到测序深度和覆盖度熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站，基因組測序项目中测序深度是指测序得到的总碱基数与待测基因组大小的比值熊猫体育「中国Panda」直播官方网站球盟会·qmh(中国区)-官方网站。假设一個基因大小为2M乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户意昂体育·[官方网]有限公司官网beat·365(中文)-唯一官方认证网站，
测序深度为10Xbeat·365(中文)-唯一官方认证网站，那么获得的总数据量为20Mvsport-(中国区)官方网站。覆盖度是指测序获得的序列占整個基因组的比例beat·365(中文)-唯一官方认证网站K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户。由于基因组中的高GC、重复序列等复杂结构的存在K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口球盟会·qmh(中国区)-官方网站，测序最终拼接
组装获得的序列往往无法覆盖有所的区域乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站vsport-(中国区)官方网站，这部分没有获得的区域就称为Gap熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!vsport-(中国区)官方网站。
轉錄組測序（RNA-seq）一般不涉及深度和覆盖度两個概念沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!熊猫体育「中国Panda」直播官方网站，大多考虑的是样本测序数据量kg体育(中国区)-体育官方网站入口vsport-(中国区)官方网站球盟会·qmh(中国区)-官方网站，和mapping率指标意昂体育·[官方网]有限公司官网kg体育(中国区)-体育官方网站入口沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!。一般使用以下的计算方式计算：深度= 数据量大小 / 参考基因组大星蛎嘶帷mh(中国区)-官方网站。桓哺嵌鹊募扑憧刹慰几昧唇樱�https：//github.com/shiquan/bamdst
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一般组装基因組測序的项目才会涉及到测序深度和覆盖度熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站，基因組測序项目中测序深度是指测序得到的总碱基数与待测基因组大小的比值熊猫体育「中国Panda」直播官方网站球盟会·qmh(中国区)-官方网站。假设一個基因大小为2M乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户意昂体育·[官方网]有限公司官网beat·365(中文)-唯一官方认证网站，
测序深度为10Xbeat·365(中文)-唯一官方认证网站，那么获得的总数据量为20Mvsport-(中国区)官方网站。覆盖度是指测序获得的序列占整個基因组的比例beat·365(中文)-唯一官方认证网站K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户。由于基因组中的高GC、重复序列等复杂结构的存在K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口球盟会·qmh(中国区)-官方网站，测序最终拼接
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