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轉錄調控測序

真核有参轉錄組測序

數據質控

测序得到的原始测序序列(Sequenced Reads)或者 raw readsK8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTSXC-sports(中国区)-体育官方网站入口,里面含有带接头的、低质量的reads意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTSXC-sports(中国区)-体育官方网站入口,为了保证信息分析质量Z6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6comkg体育·(中国区)官方网站 - Play,必须对raw reads过滤MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sportskg体育·(中国区)官方网站 - PlayZ6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6com,得到clean readsZ6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6com杏鑫平台|杏鑫娱乐-杏鑫登录-杏鑫官方平台意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光,后续分析都基于clean reads熊猫体育app官方入口(中国官方)认证体育赛事直播平台杏鑫平台|杏鑫娱乐-杏鑫登录-杏鑫官方平台。在测序过程中会存在一定的错误率MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports杏鑫平台|杏鑫娱乐-杏鑫登录-杏鑫官方平台XC-sports(中国区)-体育官方网站入口,测序错误率分布检查可以反映测序数据的质量MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光。

參考序列比對

將比對到基因組上的reads分布情況進行統計意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTS,定位區域分爲Exon(外顯子)、Intron(內含子)
和Intergenic(基因間區)Z6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6comK8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发XC-sports(中国区)-体育官方网站入口。reads與參考基因組比對率杏鑫平台|杏鑫娱乐-杏鑫登录-杏鑫官方平台Z6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6com意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光,
指比對到參考基因組上的reads數目除以有效測序數據的reads數據kg体育·(中国区)官方网站 - Play,可反映樣本的基因組拼接注釋水平Z6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6com。

基因表達水平分析

一個基因表達水平的直接體現就是其轉錄本的豐度情況XC-sports(中国区)-体育官方网站入口,轉錄本豐度越高意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光杏鑫平台|杏鑫娱乐-杏鑫登录-杏鑫官方平台XC-sports(中国区)-体育官方网站入口,則基因表達水平越高MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk SportsK8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发熊猫体育app官方入口(中国官方)认证体育赛事直播平台。我們通過所有基因的FPKM密度圖以及小提琴圖對不同實驗條件下的基因表達水平進行比較熊猫体育app官方入口(中国官方)认证体育赛事直播平台MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports,可以直觀的獲得不同實驗條件下基因表達水平的情況熊猫体育app官方入口(中国官方)认证体育赛事直播平台LOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光。

RNA-seq相關性分析

RNA-seq相關性分析K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports,是证明所涉及的生物学实验操作是可以重复的且变异不大熊猫体育app官方入口(中国官方)认证体育赛事直播平台,另一个是为了确保后续的差异基因分析得到更可靠的结果意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTS意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光Z6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6com。

差異表達基因分析

差異表達基因以火山圖、聚類熱圖、韋恩圖等形式展示意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光,可直觀展示樣本間差異基因表達的情況MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk SportsZ6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6comXC-sports(中国区)-体育官方网站入口。用火山圖可直觀展示不同實驗條件下差異基因的分布情況XC-sports(中国区)-体育官方网站入口kg体育·(中国区)官方网站 - PlayMK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports。

差異表達基因篩選及聚類分析

聚類分析用于判斷差異基因在不同實驗條件下的表達模式熊猫体育app官方入口(中国官方)认证体育赛事直播平台,可通過將表達模式相同或相近的基因聚集成類XC-sports(中国区)-体育官方网站入口kg体育·(中国区)官方网站 - PlayLOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」,可清晰解讀不同條件下樣本間表達模式的差異熊猫体育app官方入口(中国官方)认证体育赛事直播平台kg体育·(中国区)官方网站 - PlayLOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」。

差異基因GO富集分析

差异基因GO富集柱状图熊猫体育app官方入口(中国官方)认证体育赛事直播平台,直观的反映出在生物过程(biological process)、细胞组分(cellular component)
和分子功能(molecular function)K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发杏鑫平台|杏鑫娱乐-杏鑫登录-杏鑫官方平台意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光,富集的GO term上差异基因的个数分布情况熊猫体育app官方入口(中国官方)认证体育赛事直播平台。
可挖掘差異基因的功能及所在的信號通路K8凯发就来凯发集团【官网】天生赢家一触即发MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk SportsLOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」,縮小基因篩選的範圍XC-sports(中国区)-体育官方网站入口。

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