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轉錄調控測序

全長轉錄組(三代)

全長轉錄組-三代測序助力轉錄組數據解讀

全長轉錄組是基于PacBio平台或Nanopore平台進行測序獲得物種轉錄組信息的方法乐虎.lehu(国际)中国区唯一官方网站PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce,其可以獲得mRNA全長序列意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页),克服轉錄本拼接短、信息不完整的難題人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网,實現可變剪切及融合基因等結構變異的研究乐虎.lehu(国际)中国区唯一官方网站PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce。

應用方向

  • 農學

    完善基因組/轉錄組信息:複雜基因結構意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!,轉錄本結構和功能分析乐虎.lehu(国际)中国区唯一官方网站PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce。
    差異/動態轉錄組:脅迫處理或不同時序轉錄組變化乐虎.lehu(国际)中国区唯一官方网站U8国际·[集团]有限公司官网,動植物馴化機制QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网U8国际·[集团]有限公司官网人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网。
    比較轉錄組:近緣物種間親緣關系QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网U8国际·[集团]有限公司官网,mRNA序列差異PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAceU8国际·[集团]有限公司官网人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网。
  • 醫學

    融合現象解析:融合基因的癌症致病機理U8国际·[集团]有限公司官网U8国际·[China]有限公司官网。
    複雜基因轉錄本研究:疾病或癌症相關基因的複雜剪切形式沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!U8国际·[China]有限公司官网U8国际·[集团]有限公司官网。
    定量轉錄組:基因/轉錄本水平定量人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAceU8国际·[集团]有限公司官网,挖掘條件特異性基因/轉錄本乐虎.lehu(国际)中国区唯一官方网站。

諾禾優勢

  • 平台優人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)U8国际·[集团]有限公司官网,質量好九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce,性價比高

    基于強大的Pacbio平台或Nanopore平台意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长乐虎.lehu(国际)中国区唯一官方网站,獲取mRNA全長序列QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网,文庫構建時無需將轉錄本打斷PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAceU8国际·[China]有限公司官网,信息分析無需組裝人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网乐虎.lehu(国际)中国区唯一官方网站,准確重構轉錄組全貌九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!。
    • 55天

      項目周期
    • 測序平台

      PacBio or Nanopore
    • All

      信息分析

信息分析

諾禾致源全长轉錄組測序项目信息分析沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网,经过严格数据质控保证数据分析可靠性人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网U8国际·[集团]有限公司官网沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!,准确获取转录本信息U8国际·[集团]有限公司官网。
有參全長轉錄組分析條目 無參全長轉錄組分析條目
意昂体育app下载安装官网 數據質控九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)U8国际·[集团]有限公司官网,轉錄本鑒定、聚類與校正
與參考基因組比對 SSR分析
可變剪切分析 蛋白編碼框(CDS)預測
新基因、新轉錄本預測 轉錄本的GO/KOG/KEGG分類
七大數據庫功能注釋 七大數據庫功能注釋
融合基因分析 LncRNA編碼潛能預測
lncRNA 编码潜能预测 樣本間轉錄本比較
可變腺苷酸化分析 動植物轉錄因子分析
樣本間轉錄本比較 基因表達水平分析(相關性MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长U8国际·[China]有限公司官网,差異表達分析)
動植物轉錄因子分析 差异表达基因GO和KEGG 富集分析
基因表達水平分析(相關性乐虎.lehu(国际)中国区唯一官方网站人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网,差異表達分析)
差异表达基因GO和KEGG 富集分析

送樣建議

樣本類型 送樣建議-PacBio 送樣建議-Nanopore
新鮮動物組織幹重 ≥ 0.8g ≥0.3g
新鮮植物組織幹重 ≥ 1g ≥0.5g
新鮮培養細胞數量 ≥ 5×10 7 ≥ 5×10 6
全血(加入Trizol) ≥ 10mL ≥ 5mL
菌體 ≥ 5×10 7個/≥ 0.8g ≥ 5×10 6個/≥ 0.3g

常見問題

  • 1.全長轉錄組是否需要打斷九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页),拼接U8国际·[集团]有限公司官网PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAceU8国际·[China]有限公司官网?

    • 全长转录组是基于PacBio或Nanopore三代測序平台乐虎.lehu(国际)中国区唯一官方网站人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce,无需打断拼接U8国际·[集团]有限公司官网,直接获得包含5’乐虎.lehu(国际)中国区唯一官方网站,3’UTR九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网,poly A tail的完整转录本U8国际·[集团]有限公司官网MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网,从而准确分析有参考基因组物种 可变剪切及融合基因等结构信息人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce,克服无参考基因组物种转录本拼接较短、信息不完整的难题PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce。
  • 2.全長轉錄組檢測准確率如何意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!乐虎.lehu(国际)中国区唯一官方网站MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长?

    • 三代测序碱基错误率是没有偏好性的乐虎.lehu(国际)中国区唯一官方网站PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!,对于PacBio平台人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!,研究全长转录组采用的是CCS(circular consensus sequencing read乐虎.lehu(国际)中国区唯一官方网站,环形一致性序列)测序模式沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!,产生的HiFi read 通常平均质量值可达Q30以上;对于Nanopore平台U8国际·[China]有限公司官网MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网,利用有参考基因组物种的基因组信息进行序列校正人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!,也可以有效提高碱基校正效果沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!。
  • 3.全長轉錄組是否獲得全部LncRNA

    • 建库过程是通过识别RNA上的Poly-A结构U8国际·[集团]有限公司官网QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网U8国际·[China]有限公司官网,将总RNA中的具有Poly-A的mRNA与部分具有Poly-A的LncRNA富集出来参与建库的人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!U8国际·[集团]有限公司官网,没有Poly-A结构的LncRNA是无法富集出来 并建庫測序U8国际·[China]有限公司官网沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!,因此只能获得一部分LncRNA结果QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网。

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