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基因組測序>
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建庫測序>
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人类基因組測序>
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动植物基因組測序>
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微生物基因組測序>
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轉錄調控測序>
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表觀組測序>
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單細胞測序>
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空間轉錄組>
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基因分型>
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質譜分析>
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蛋白組學分析>
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代謝組學分析>
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血液蛋白質組分析>
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多組學聯合分析>
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分子育種>
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基因合成>
CUT&Tag—DNA-蛋白質相互作用研究技術
- CUT&Tag技术是一种研究蛋白质-DNA互作的新方法意昂体育·[官方网]有限公司官网。该技术使用磁珠吸附活细胞熊猫体育app官方入口（中国官方）认证体育赛事直播平台，洋地黄皂苷打开细胞膜的通透性；pA-Tn5转座酶在抗体引导下精确结合靶蛋白附近的DNA序列U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站，由于Tn5连有测序接头球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口沐鸣2-科技赋能场景,让娱乐更有趣!U8国际·[China]有限公司官网，可以直接在片段化的 DNA 两端添加接头意昂体育·[官方网]有限公司官网熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台，最终通过PCR扩增获得完整的文库熊猫体育app官方入口（中国官方）认证体育赛事直播平台。
-
CUT&Tag建库原理图（DOI: 10.1038/s41467-019-09982-5）
應用方向
1、DNA組蛋白修飾研究（組蛋白甲基化、乙酰化及新組蛋白修飾：乳酸化、磷酸化等）；2、DNA-轉錄因子互作研究（探究轉錄因子結合位點的分布規律、轉錄因子之間的合作規則；基因轉錄調控的具體機制）；
3、增强子/超级增强子分析（鉴定超级增强子、结合轉錄組測序结果确定所调控的靶基因）；
4、組學驗證手段（通過其他組學找到潛在結合的轉錄因子或是組蛋白修飾後進行驗證）；
諾禾優勢
1．低起始量建庫
微量建庫研發沐鸣2-科技赋能场景,让娱乐更有趣!意昂体育·[官方网]有限公司官网熊猫体育app官方入口（中国官方）认证体育赛事直播平台，可低至1000個細胞起始；-
2. 低活性建库
細胞活性低至40%可穩定出庫 3. 新鮮样本
針對于新鮮樣本的CUT&Tag研究球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口，推出針對短途、中途、長途不同距離的運輸方案熊猫体育app官方入口（中国官方）认证体育赛事直播平台，以保證樣本到達實驗室的活性U8国际·[中国区]有限公司官网。-
4. 分析內容丰富
除CUT&Tag标准分析內容外意昂体育·[官方网]有限公司官网beat·365(中国)-官方认证网站，諾禾致源还可提供CUT&Tag&转录组關聯分析、增强子/超级增强子分析等多项高级分析內容球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口。 5. 项目经验丰富
諾禾致源CUT&Tag累计项目一抗30+沐鸣2-科技赋能场景,让娱乐更有趣!球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台，包含人、小鼠、小麦、拟南芥、银杏等多类型物种熊猫体育app官方入口（中国官方）认证体育赛事直播平台。对于珍贵样本、凍存后低活性样本、植物难提核样本分别进行针对性优化U8国际·[China]有限公司官网beat·365(中国)-官方认证网站沐鸣2-科技赋能场景,让娱乐更有趣!，建立了多套实验流程球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口意昂体育·[官方网]有限公司官网熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站，助力客户在Signal Transduction and Targeted Therapy、Nature Cell Biology、Nucleic Acids Research等多个权威杂志发表高水平文章U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐。-
6. 周期快、质量好、稳定性高
諾禾致源基于全面的物种实验库以及优质的測序平台beat·365(中国)-官方认证网站，实现快速、稳定的测序數據分析及交付球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口。<10
樣本量40天
周期NovaSeq
測序平台
信息分析
諾禾致源CUT&Tag测序项目球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口，通过对获得的高质量reads球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口，进行Peak calling及motif分析球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台，高效预测相关基因沐鸣2-科技赋能场景,让娱乐更有趣!熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站， 进行功能富集分析、预测特异蛋白的功能U8国际·[中国区]有限公司官网球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口，组蛋白染色体结合图谱以及DNA的表观修饰U8国际·[China]有限公司官网球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台意昂体育·[官方网]有限公司官网。| 分析內容 | 解決問題 |
|---|---|
| 測序數據質量評估 | 過濾掉低質量數據熊猫体育app官方入口（中国官方）认证体育赛事直播平台beat·365(中国)-官方认证网站U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐，保證數據質量 |
| 參考序列比對分析 | 唯一比对的 reads 分布统计 |
| peak calling | 定位組蛋白修飾/轉錄因子結合位點 |
| peak注釋 | 鑒定目標組蛋白修飾/轉錄因子潛在調控的靶基因 |
| 差异 peak 分析 | 分析DNA-蛋白互作在不同處理條件下的差異 |
| 相關基因功能分析 | Peak/差异 peak 相关基因 GO、KEGG 富集分析 |
| motif 分析 | 目的轉錄因子結合的Motif序列 （转录因子对应的已知Motif & 转录因子对应的新的Motif） |
關聯分析
| CUT&Tag与RNA-seq關聯分析 | 1. 整体层面的关联 |
|---|---|
1.1 整体信号分布展示 | |
1.2 不同表达?平基因的CUT&Tag 信号分布展示 | |
1.3 所有基因的CUT&Tag 信号热图 | |
1.4 所有基因启动子区域CUT&Tag信号与基因表达量关联密度散点图 |
|
| 2.差異表達基因對應表觀信號分布 | |
2.1 差异表达基因的CUT&Tag 信号 | |
2.2 差异表达基因的RNA-seq和CUT&Tag 信号热图 | |
2.3 差异表达基因上的CUT&Tag 信号累计分布图 |
|
| 3.差異峰區域相關的基因表達變化情況 | |
3.1 CUT&Tag 信号变化与表达变化的热图 | |
3.2 差异峰相关基因的FPKM累计分布图 | |
| 4. 差异峰区域与差异表达基因的关联 | |
| 4.1 CUT&Tag 和RNA-seq的四象限图 | |
| 4.2 差异峰基因和差异表达基因的韦恩图 | |
| 4.3 GO富集分析 | |
| 4.4 KEGG富集分析 |
送樣建議
| 樣本類型 | 樣本狀態 | 送樣建議 |
|---|---|---|
| 細胞樣本 | 凍存 | 每份≥40万球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口熊猫体育app官方入口（中国官方）认证体育赛事直播平台，凍存前活性＞90%beat·365(中国)-官方认证网站，建议送备份 |
| 新鮮 | 每份≥20万beat·365(中国)-官方认证网站U8国际·[中国区]有限公司官网熊猫体育app官方入口（中国官方）认证体育赛事直播平台，凍存前活性＞80%熊猫体育app官方入口（中国官方）认证体育赛事直播平台沐鸣2-科技赋能场景,让娱乐更有趣!，建议送备份 | |
| 動物組織 | 新鮮/凍存 | 常见组织≥40 mg 心、腎、神經等組織≥50mg |
| 植物組織 | 新鮮/凍存 | 幼嫩組織葉片≥0.3g 種子、根等組織0.5～1g |
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一抗建議：
請選擇ChIP級別的一抗意昂体育·[官方网]有限公司官网，提供未稀釋的一抗原液沐鸣2-科技赋能场景,让娱乐更有趣!。送樣前請聯系銷售提供一抗的說明書U8国际·[中国区]有限公司官网球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台沐鸣2-科技赋能场景,让娱乐更有趣!，以方便後續項目進行球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口。具體的送樣要求請詳詢各地區銷售技術人員U8国际·[China]有限公司官网。
常見問題
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1.與ChIP-seq相比球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口，CUT&Tag的優勢是熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站意昂体育·[官方网]有限公司官网球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口？
CUT&Tag起始量更低、數據信噪比更高、周期更快熊猫体育app官方入口（中国官方）认证体育赛事直播平台。
a. 起始量更低：chip需要千万级别细胞意昂体育·[官方网]有限公司官网熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口，CUT&Tag仅需十万级别甚至可低至60个细胞建库；
b. 数据信噪比更高：CUT&Tag无需超声打断等操作意昂体育·[官方网]有限公司官网，属于原位捕获的技术beat·365(中国)-官方认证网站熊猫体育app官方入口（中国官方）认证体育赛事直播平台，数据信噪比更高；
c. 周期更快：CUT&Tag采用高活性的自带部分接头的转座酶U8国际·[China]有限公司官网U8国际·[中国区]有限公司官网，无需超声处理等U8国际·[中国区]有限公司官网球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台意昂体育·[官方网]有限公司官网，大大简化了操作流程熊猫体育app官方入口（中国官方）认证体育赛事直播平台U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐，节省了实验时间熊猫体育app官方入口（中国官方）认证体育赛事直播平台意昂体育·[官方网]有限公司官网球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口。
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2. CUT&Tag对于一抗应该如何选择U8国际·[China]有限公司官网熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站？
優先選用ChIP/ChIP-seq級別的候選抗體；ChIP級別抗體＞非ChIP級別抗體；文獻驗證過的抗體＞非文獻驗證過的抗體；
ChIP級別抗體對抗體純度、特異性結合的要求都比較高球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐，是完成CUT&Tag實驗的首選抗體球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口beat·365(中国)-官方认证网站沐鸣2-科技赋能场景,让娱乐更有趣!。如果沒有找到目的基因的ChIP-seq級別的抗體球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站，通過ChIP和IP驗證的抗體也可以使用U8国际·[China]有限公司官网beat·365(中国)-官方认证网站，但是盡量不要使用沒有標注ChIP應用的抗體球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台beat·365(中国)-官方认证网站，或者標注未檢測的抗體U8国际·[中国区]有限公司官网沐鸣2-科技赋能场景,让娱乐更有趣!U8国际·[China]有限公司官网，否則實驗效果可能不太理想U8国际·[China]有限公司官网U8国际·[中国区]有限公司官网意昂体育·[官方网]有限公司官网。
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