基因組測序>
建庫測序>
人类基因組測序>
动植物基因組測序>
微生物基因組測序>
轉錄調控測序>
表觀組測序>
單細胞測序>
空間轉錄組>
基因分型>
質譜分析>
蛋白組學分析>
代謝組學分析>
血液蛋白質組分析>
多組學聯合分析>
分子育種>
基因合成>
RRBS—經濟且准確的DNA甲基化
准確:
單堿基分辨率B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,准確分析每一個胞嘧啶的甲基化狀態fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站。經濟:
性价比高意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站,在较少的测序数据量下B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌,针对启动子及 CpG 岛区域的DNA甲基化进行分析MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站。應用方向
队列研究 疾病与风险因素、遗传特征、生物标记物等研究J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌。諾禾優勢
PE150
測序讀長≥80%
測序質量Q3020,280個
物理核數1,727T flops
項目經驗400TB
總內存58.6PB
總儲存材料選取
DNA樣品
文庫構建
甲基化文庫
PE150測序
信息分析
信息分析
諾禾致源RRBS实现单碱基分辨率的甲基化位点准确 定位意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光,快速准确找到差异位点意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站,实现高效分析DMR及相关基因的功能分析J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌。| 分析內容 | 解決問題 |
|---|---|
| 測序數據質量評估 | 過濾低質量數據VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站,保證數據質量 |
| 與參考基因組比對 | 比對率和覆蓋度分析 |
| 甲基化位點calling | 分析甲基化位點 |
| 甲基化分布 | 甲基化在基因組B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光,染色體尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站,功能與元件上的分布 |
| 差異甲基化分析 | 寻找 DMR |
| 相關基因分析 | 相关基因GOVSport -(CHINA) 胜利因您更精彩db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网,KEGG 富集分析 |
| 多樣本分析 | PCA 分析多样本甲基化变化规律 |
關聯分析
通过DNA甲基化与基因表达进行關聯分析意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩,可以帮助我们了解DNA甲基化修饰与RNA表达是否存在相关性熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,样本中的哪些基因的表达受到DNA甲基化修饰的影响以及对应的基因的功能fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88。因此RRBS和转录组的联合分析广泛应用于疾病研究意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光,生物性状等多种领域熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台。 基于多组学文章中的应用场景和经验意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光,諾禾致源搭建了内容丰富的甲基化与转录组關聯分析流程意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌,以助力科研者们发表高分文章J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌。| DNA甲基化与RNA-seq關聯分析 | 1. 整体上的关联尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌,主要从染色体层面基因甲基化水平与表达水平分布VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌,基因上下游层面甲基化水平与表达水平分布两個方面来展示DNA甲基化修饰与基因表达的关系 |
|---|---|
| 2. DMR相关基因表达与甲基化修饰尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网,以甲基化分析得到的DMR相关基因为主体MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,以不同形式展示其表达与甲基化修饰的关系 | |
| 3. DMR相关基因与差异基因联合分析J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌,将DMR相关基因与转录组分析得到的差异基因取交集B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌,以不同的形式展示交集基因的甲基化水平和表达量及其注释信息 | |
| 4. DMR相关基因与差异基因功能分析db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,主要是基于基因集合间求交集并进行GO和KEGG富集分析 |
送樣建議
| 樣本類型 | 送樣建議 |
|---|---|
| 新鮮動物組織 | >500 mg |
| 新鮮培養細胞數量 | 5×108個 |
| 全血 | >2 mL |
常見問題
1.爲什麽RRBS數據分析中樣本的CG含量較低?
由于樣品在建庫時使用bisulfite處理後db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站,非甲基化的C轉化爲Ufun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光,後期PCR後進一步轉化爲TJ9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌,因此甲基化項目CG含量偏低是正常的VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台。
2.为什么 RRBS 主要应用于人、鼠、猪等高等哺乳动物意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌?
RRBS 用 MspI 酶切将 CpG 位点富集出来进行测序B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网,该酶的酶切位点为 CˇCGG熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站,而不适用于CHG与CHH序列环境的检测db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台。 高等哺乳动物中 DNA 甲基化主要发生在5’-CpG-3’二核苷酸的胞嘧啶上B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩,植物中许多物种的甲基化信息位于CHG与CHH序列环境fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站。
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