諾禾致源

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科技服務

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表觀組測序

RRBS—經濟且准確的DNA甲基化

  • 简化甲基化测序(Reduced Representation Bisulfite Sequencing意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光,RRBS)通过酶切富集启动子及 CpG 岛区域熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩,并进行 Bisulfite 测序fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,同时 实现 DNA 甲基化状态检测的高分辨率和测序数据的高利用率fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88。作为一种高性价比的甲基化研究方法VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,简化甲基化测序在大规模 临床样本的研究中具有广泛的应用前景熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台。
  • 准確:

    單堿基分辨率B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,准確分析每一個胞嘧啶的甲基化狀態fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站。
  • 經濟:

    性价比高意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站,在较少的测序数据量下B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌,针对启动子及 CpG 岛区域的DNA甲基化进行分析MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站。

應用方向

队列研究 疾病与风险因素、遗传特征、生物标记物等研究J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌。
癌症疾病 肿瘤、精神疾病、代谢病、免疫病等研究J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网。
动物发育 肌肉发育、育种与繁殖等研究J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站。

諾禾優勢

  • 1. 生信分析內容丰富 诺禾RRBS基于文章中高频出现的分析內容J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌,搭建DNA甲基化与转录组關聯分析熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台。
  • 2. 周期快、质量好B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88,稳定性高 诺禾采用先进的高通量测序平台MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站,并与高性能计算平台(High Performance Computing澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,HPC)结合意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,实现 快速、稳定的测序数据分析及交付意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光。
    • PE150

      測序讀長
    • ≥80%

      測序質量Q30
    • 20,280

      物理核數
    • 1,727T flops

      項目經驗
    • 400TB

      總內存
    • 58.6PB

      總儲存
  • 3. 方案设计专业熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站,质控严格 诺禾RRBS建库加入阴性对照λDNAVSport -(CHINA) 胜利因您更精彩澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,要求重亚硫酸盐转化效率99%以上fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网,并采用主流软件bismark 进行分析... 从材料 选取熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,建庫測序fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88,到数据分析MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站,每一步都经过科学、缜密的设计J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,以保障高质量研究成果澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌。

    材料選取

    DNA樣品

    文庫構建
    甲基化文庫

    PE150測序

    信息分析

  • 4. 项目文章以及物种经验丰富 諾禾致源已经成功完成对猪J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌,牛MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网,羊熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网,人澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩,大鼠J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌,小鼠等物种进行简化甲基化测序分析熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,助力客户在Journal of Agricultural and Food Chemistry等权威杂志发表多篇高水平文章尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站。

信息分析

諾禾致源RRBS实现单碱基分辨率的甲基化位点准确 定位意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光,快速准确找到差异位点意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站,实现高效分析DMR及相关基因的功能分析J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌。
分析內容 解決問題
測序數據質量評估 過濾低質量數據VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站,保證數據質量
與參考基因組比對 比對率和覆蓋度分析
甲基化位點calling 分析甲基化位點
甲基化分布 甲基化在基因組B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光,染色體尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站,功能與元件上的分布
差異甲基化分析 寻找 DMR
相關基因分析 相关基因GOVSport -(CHINA) 胜利因您更精彩db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网,KEGG 富集分析
多樣本分析 PCA 分析多样本甲基化变化规律

關聯分析

通过DNA甲基化与基因表达进行關聯分析意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩,可以帮助我们了解DNA甲基化修饰与RNA表达是否存在相关性熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,样本中的哪些基因的表达受到DNA甲基化修饰的影响以及对应的基因的功能fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88。因此RRBS和转录组的联合分析广泛应用于疾病研究意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光,生物性状等多种领域熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台。 基于多组学文章中的应用场景和经验意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光,諾禾致源搭建了内容丰富的甲基化与转录组關聯分析流程意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌,以助力科研者们发表高分文章J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌。
DNA甲基化与RNA-seq關聯分析 1. 整体上的关联尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌,主要从染色体层面基因甲基化水平与表达水平分布VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌,基因上下游层面甲基化水平与表达水平分布两個方面来展示DNA甲基化修饰与基因表达的关系
2. DMR相关基因表达与甲基化修饰尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网,以甲基化分析得到的DMR相关基因为主体MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,以不同形式展示其表达与甲基化修饰的关系
3. DMR相关基因与差异基因联合分析J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌,将DMR相关基因与转录组分析得到的差异基因取交集B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌,以不同的形式展示交集基因的甲基化水平和表达量及其注释信息
4. DMR相关基因与差异基因功能分析db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,主要是基于基因集合间求交集并进行GO和KEGG富集分析

送樣建議

樣本類型 送樣建議
新鮮動物組織 >500 mg
新鮮培養細胞數量 5×108個
全血 >2 mL

常見問題

  • 1.爲什麽RRBS數據分析中樣本的CG含量較低?

      由于樣品在建庫時使用bisulfite處理後db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站,非甲基化的C轉化爲Ufun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光,後期PCR後進一步轉化爲TJ9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌,因此甲基化項目CG含量偏低是正常的VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台。

  • 2.为什么 RRBS 主要应用于人、鼠、猪等高等哺乳动物意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌?

      RRBS 用 MspI 酶切将 CpG 位点富集出来进行测序B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网,该酶的酶切位点为 CˇCGG熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口MG不朽情缘·(中国大陆)官方网站,而不适用于CHG与CHH序列环境的检测db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网熊猫体育【China版权】官方网站 - 最全赛事直播平台。 高等哺乳动物中 DNA 甲基化主要发生在5’-CpG-3’二核苷酸的胞嘧啶上B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩,植物中许多物种的甲基化信息位于CHG与CHH序列环境fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站。

拓展材料

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