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多組學聯合分析

表觀組學(染色質微環境)

表觀遺傳多組學

  • DNA甲基化+轉錄組(RNA-seq)

    聯合轉錄組(RNA-seq)OG视讯·(中国区)集团有限公司官方网站球友直播-足球篮球体育直播平台,可以了解樣本中DNA甲基化修飾和RNA表達是否存在整體上的相關性、樣本中哪些基因的轉錄表達受到DNA甲基化修飾的影響的基因及功能球友直播-足球篮球体育直播平台。
  • RNA甲基化(m6A修飾)+轉錄組(RNA-seq)

    在進行m6A相關研究時結合轉錄組(RNA-seq)OG视讯·(中国区)官方网站kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站熊猫体育【Panda】官方网站- Panda SPORTS,進一步挖掘RNA甲基化酶靶基因OG视讯·(中国区)集团有限公司官方网站,探究轉錄本修飾水平與基因表達水平的相關性OG视讯·(中国区)官方网站K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发vsport-(中国区)官方网站。

染色質微環境多組學

  • ATAC-seq+轉錄組(RNA-seq)

    将ATAC与转录组(RNA-seq)关联分析杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来OG视讯·(中国区)官方网站,可以研究ATAC信号反映的染色质开放性程度与基因表达调控的机制K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发,评估用染色质开放性阐述转录水平乃 至下游表型变化的可信度熊猫体育【Panda】官方网站- Panda SPORTSOG视讯·(中国区)官方网站。
  • CUT&Tag+ATAC-seq+轉錄組(RNA-seq)

    CUT&Tag與ATAC-seq以及轉錄組(RNA-seq)聯合分析OG视讯·(中国区)集团有限公司官方网站杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来球友直播-足球篮球体育直播平台,可以探究組蛋白標記調控和染色質開放性的一致相關性kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发,探究轉錄因子調控轉錄起始的過程OG视讯·(中国区)集团有限公司官方网站vsport-(中国区)官方网站熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台,以及完善染色質微環境調控基因表達的調控網絡球友直播-足球篮球体育直播平台OG视讯·(中国区)官方网站kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站。
  • Hi-C+轉錄組(RNA-seq)

    整合Hi-C與轉錄組(RNA-seq)數據kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站球友直播-足球篮球体育直播平台,用以研究染色體結構變化與基因表達調控之間的關系OG视讯·(中国区)官方网站K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发,從基因組、轉錄組兩種組學結合的視角闡述生物體性狀形成的相關機制OG视讯·(中国区)官方网站熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台。

染色質微環境多組學

一对一项目服务K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发球友直播-足球篮球体育直播平台熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台,科学的方案设计K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发,严格的质控管理球友直播-足球篮球体育直播平台,专业的分析團隊K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来OG视讯·(中国区)官方网站,丰富的项目经验K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发U8国际·[股份]有限公司官网,优质的项目服务vsport-(中国区)官方网站K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发,确保每一个环节都能出色完成熊猫体育【Panda】官方网站- Panda SPORTSU8国际·[股份]有限公司官网,同时还搭建各组学联合分析流程熊猫体育【Panda】官方网站- Panda SPORTS,全面助力客户科学研究及发表文章进军高分文章OG视讯·(中国区)集团有限公司官方网站vsport-(中国区)官方网站U8国际·[股份]有限公司官网。

多组学送樣建議


DNA甲基化 取樣標准 表觀遺傳學具有顯著的組織特異性OG视讯·(中国区)集团有限公司官方网站杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来,不同組織細胞間甲基化狀態可能會有巨大差異U8国际·[股份]有限公司官网熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台,重點需要參考老師的研究課題進行取樣
測序深度 全基因组甲基化测序OG视讯·(中国区)官方网站杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来,測序深度建议 30×/ 样
RNA甲基化 (m6A修饰 ) 取樣標准 取樣時間、部位、環境等盡量保持一致球友直播-足球篮球体育直播平台熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台,不同類型的樣本可能會存在一定差異K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发vsport-(中国区)官方网站OG视讯·(中国区)官方网站,針對具體研究部位進行取樣
ATAC-seq 取樣標准 取樣過程中OG视讯·(中国区)集团有限公司官方网站熊猫体育【Panda】官方网站- Panda SPORTS,盡可能減少人爲造成的樣品間差異K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发,且確保自己的樣本沒有外源汙染
CUT&Tag/ChIP-seq 取樣標准 采集的樣本應該通過嚴格的細胞學、組織學、病理學等相關鑒定杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来vsport-(中国区)官方网站球友直播-足球篮球体育直播平台,且確保自己的樣本沒有外源汙染
Hi-C 取樣標准 微小个体生物球友直播-足球篮球体育直播平台,建议选择相对近源的物种进行混样杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来熊猫体育【Panda】官方网站- Panda SPORTS,混样个体切忌太多;含水量极高的样本K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发,建议客户多准备一些样本K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发,选择底部细胞沉淀进行实验;辅助组装样本尽可能保持与基因组样本来自同 一个体 ( 或相对近源的个体 )
注:各組學樣本分裝保存並寄送

信息分析内容 ( 单组学 )


DNA甲基化 RNA甲基化 ATAC-seq CUT&Tag/ChIP-seq Hi-C
甲基化位點檢測 结合位点检测(peak calling) 互作圖譜構建
單樣本甲基化分析 Motif分析 差異互作圖譜分析
功能區域甲基化水平分布 基因功能區peak分布 A/B compartments分析
差異甲基化區域分析 差異分析 TAD分析

信息分析内容 ( 多组学 )


DNA甲基化 RNA甲基化(m6A 修饰 ) ATAC-seq CUT&Tag/ChIP-seq Hi-C
與RNA-seq聯合分析
  1. 從染色體層面、基因及上下遊層面展示DNA甲基化修飾與基因表達的關系
  2. 研究轉錄組差異基因表達與甲基化修飾的關系
  3. 揭示DMR相關基因的表達與甲基化修飾的關系
  4. 研究DMR相關基因與差異基因的overlap基因並進行功能分析
  1. 結合轉錄組數據杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来K8·凯发(中国【官网】集团天生赢家一触即发熊猫体育【Panda】官方网站- Panda SPORTS,篩選overlap基因集
  2. Overlap基因集功能分析
  1. 獲得RNA-seq/ATAC-seq信號分布情況;
  2. 研究差異表達與染色質可及性關系;
  3. 研究差異表達與差異染色質可及性熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台,篩選overlap基因集並進一步分析;
  1. 研究基因的表達水平和CUT&Tag信號水平關系
  2. 差異表達基因的表觀水平變化的研究
  3. 研究差異峰相關基因的表達水平變化
  4. 篩選並分析差異表達與差異峰相關overlap基因集並進行功能分析
  1. 研究處理組和對照組A/Bcompartment的變化區域與對應的基因的表達水平變化
  2. 統計差異互作區域對應的差異表達基因的表達水平熊猫体育【Panda】官方网站- Panda SPORTS,並觀察三維染色質互作的變化與基因表達變化的關系
  3. 鑒定保守TAD區域vsport-(中国区)官方网站,並利用轉錄組數據對其進行分類分析;

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