杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网·(中国区)杏耀_杏耀娱乐登录_杏耀注册代理平台官网-935K甲基化芯片-諾禾致源-EWAS基因分型差異性甲基化位點區域

基因組測序>
- 建庫測序>
  - 二代建庫測序服务
  - 三代建庫測序服务
- 人类基因組測序>
- 动植物基因組測序>
- 微生物基因組測序>
轉錄調控測序>
表觀組測序>
單細胞測序>
空間轉錄組>
基因分型>
質譜分析>
- 蛋白組學分析>
- 代謝組學分析>
- 血液蛋白質組分析>
  - Olink血液蛋白質組學
多組學聯合分析>
分子育種>
基因合成>
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人甲基化芯片

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人甲基化芯片—方便快捷的甲基化檢測方法

DNA甲基化是指在 DNA甲基化转移酶的作用下球客岛-专业体育赛事直播资讯平台U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」，在基因组 CpG 二核苷酸的胞嘧啶5'碳位共价键结合一個甲基基团U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」B体育(China)中国官方网站-B SPORTS。DNA 甲基化能引起染色质结构、DNA 构象、DNA 稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录，从而控制基因表达U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」球客岛-专业体育赛事直播资讯平台。
935K甲基化芯片（Infinium MethylationEPIC v2.0）是由Illumina公司开发的甲基化位点检测芯片标题意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTSB体育(China)中国官方网站-B SPORTS。935K甲基化芯片包含人类甲基化组研究中最具生物学意义的>935,000個CpGs标题，分布于增强子、启动子区、基因编码区和CpG岛必一·运动(B - Sports)体育官方网站，较其前代产品MethylationEPIC v1.0（850K）去除了性能不佳的探针标题，新增了至少18.6万個新探针J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌U8国际·[中国区]有限公司官网球客岛-专业体育赛事直播资讯平台，不仅扩大CpG岛覆盖范围标题尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录B体育(China)中国官方网站-B SPORTS，增强外显子覆盖率尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录U8国际·[中国区]有限公司官网，实现更准确的拷贝数变异（CNV）检测J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌标题，同时注释基因组版本从HG19更新到HG38和v41版GenCode数据库标题K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」。

芯片位點

（1）涵盖MethylationEPIC v1.0（850K）芯片> 87%的位點
（2）CpG 岛以外的 CpG 位点
（3）人类干細胞中的非 CpG 甲基化位点（CHH位点）
（4）肿瘤（多种类型的癌症）VS 正常样本中的不同甲基化位点标题必一·运动(B - Sports)体育官方网站意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTS，可以检测多种樣本類型
（5）FANTOM5 增强子
（6）ENCODE 开放染色质和增强子
（7）脫氧核糖核酸酶超敏位點
（8）miRNA 启动子区域
（9）通過ChIP-seq在癌症和細胞系中檢測到的增強子和超級增強子
（10）利用ATAC-seq在人原發性腫瘤中鑒定到的差異染色質可及區
（11）常見癌症驅動突變

技術優勢

（1）广泛的基因组覆盖范围：每個样本检测>935,000個 CpG 位点U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」球客岛-专业体育赛事直播资讯平台。
（2）分辨率高：單堿基分辨率标题，可以直接檢測到發生甲基化的確切位點J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录。
（3）高质量的数据：同时采用 Infinium I 及 II 探针设计尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录，使检测范围最大化必一·运动(B - Sports)体育官方网站。
（4）可重複性高：自身技術重複相關性R²>0.99；935K VS 850K 芯片交集探针间相关性R²>0.99；935K芯片 VS 甲基化测序（100X）相关性R²>0.96B体育(China)中国官方网站-B SPORTSK8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发球客岛-专业体育赛事直播资讯平台。
（5）适用于 FFPE 样品U8国际·[中国区]有限公司官网意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTS。

應用方向

腫瘤研究
肺癌、食管癌、卵巢癌等研究
複雜疾病研究
精神疾病、代謝病、心血管病、免疫病等研究
環境互作研究
吸煙、喝酒、工業暴露、汙染等
發育研究
胚胎發育、神經分化、細胞分化等

諾禾優勢

1.周期短
- 8的倍數
  樣本量
- 30天
  周期
- Illumina
  IScan
  檢測平台
2.專業背景強
基于成熟的生物信息分析人才球客岛-专业体育赛事直播资讯平台，進行專業的項目分析意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTSU8国际·[中国区]有限公司官网必一·运动(B - Sports)体育官方网站。
3.科學方案設計
從材料選取、探針捕獲、到檢測分析U8国际·[中国区]有限公司官网尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTS，每一步都需要科學、缜密的設計K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发必一·运动(B - Sports)体育官方网站U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」，以保障高質量研究成果意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTS。

檢測原理

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探針一：
对于每個位点都设计有两种探针球客岛-专业体育赛事直播资讯平台意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTS，分别对应M型磁珠和U型磁珠K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发U8国际·[中国区]有限公司官网。M 型磁珠尾部为 GJ9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌U8国际·[中国区]有限公司官网，用来检测甲基化位点；U型磁珠尾部为 AU8国际·[中国区]有限公司官网，用来检测未甲基化位点标题。基因组上的某一位点如果被甲基化了U8国际·[中国区]有限公司官网，那么在亚硫酸氢盐的处理下J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录，CG 仍为 CGK8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发，与M 型磁珠配对球客岛-专业体育赛事直播资讯平台必一·运动(B - Sports)体育官方网站，荧光标记的核苷酸掺入后能被检测到荧光信号U8国际·[中国区]有限公司官网，M 型磁珠发光尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录标题意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTS。反之K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTSJ9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌，如果没有被甲基化U8国际·[中国区]有限公司官网U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录，那么在亚硫酸氢盐的处理下标题，CG 变为 TGJ9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌，与 U型磁珠配对球客岛-专业体育赛事直播资讯平台，延伸后U 型磁珠发光必一·运动(B - Sports)体育官方网站球客岛-专业体育赛事直播资讯平台B体育(China)中国官方网站-B SPORTS。
探針二：
Infinium Ⅱ 探针只使用一种磁珠K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发球客岛-专业体育赛事直播资讯平台必一·运动(B - Sports)体育官方网站，探针末端为 CK8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发标题意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTS，配对后只掺入单個碱基意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTSU8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」U8国际·[中国区]有限公司官网。根据荧光类型判断掺入的碱基类型J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」，即可判断是否被甲基化K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录。

信息分析

935K甲基化芯片可以進行DMP、DMR信息挖掘U8国际·[中国区]有限公司官网意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTS标题，並進行系列數據分析球客岛-专业体育赛事直播资讯平台，助力高分文章發表U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」。

935K甲基化芯片分析内容	1. 各样本的 β 值密度曲线图、箱线图和堆叠图
	2. 组间 β 值相关性散点图
	3. PCA 图
	4. 样本相关性热图
	5. 差异甲基化位点（DMP）列表
	6. DMP火山图、散点图、热图
	7. 高、低甲基化DMP及基因個数统计
	8. 不同区域DMP统计
	9. DMP的TSS区域分析
	10. DMP在染色体上的分布图和circos图
	11. 差异甲基化区域（DMR）列表
	12. DMR长度密度分布图
	13. DMP/DMR 相关基因的 GO 富集
	14. DMP/DMR 相关基因的 KEGG 富集

關聯分析

通过DNA甲基化与基因表达进行關聯分析尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录，可以帮助我们了解DNA甲基化修饰与RNA表达是否存在相关性必一·运动(B - Sports)体育官方网站U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录，样本中哪些基因的表达受到DNA甲基化修饰的影响以及对应基因的功能K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发U8国际·[中国区]有限公司官网。因此935K甲基化芯片和转录组的联合分析广泛应用于疾病研究J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌，生物性状等多种领域标题。
基于多组学文章中的应用场景和经验B体育(China)中国官方网站-B SPORTSU8国际·[中国区]有限公司官网U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」，諾禾致源搭建了内容丰富的甲基化与转录组關聯分析流程U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTSU8国际·[中国区]有限公司官网，以助力科研者们发表高分文章球客岛-专业体育赛事直播资讯平台。

935K甲基化芯片与mRNA關聯分析	1.利用甲基化位点对应的基因和转录组数据对应的基因信息U8国际·[中国区]有限公司官网，进行關聯分析绘制starburst散点图
	2.應用差異甲基化位點數據和轉錄組差異基因數據繪制甲基化與轉錄組相關的circos圖
	3.利用935K甲基化芯片獲得的DMR信息U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」，與轉錄組檢測獲得的與DMR最接近的基因表達情況J9九游\|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌B体育(China)中国官方网站-B SPORTS，進行甲基化與轉錄組的聯合分析並繪制相關性熱圖
	4.根據轉錄組數據分別得出高、低表達的基因意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTSJ9九游\|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌，分析轉錄組差異基因上對應的甲基化位點甲基化水平

動植物多組學

疾病多組學

癌症多組學

微生物多組學

轉錄調控和蛋白多組學

表觀遺傳

送樣建議

樣本類型	送樣建議
組織樣本	≧30mg；口腔拭子≧3份
FFPE	推薦用試劑盒進行修複 15-20张切片（5-10μm厚球客岛-专业体育赛事直播资讯平台B体育(China)中国官方网站-B SPORTS，1×1 cm ²大星蚩偷�-专业体育赛事直播资讯平台意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTS。�
基因組DNA	总量≧500ng必一·运动(B - Sports)体育官方网站B体育(China)中国官方网站-B SPORTS，浓度≥50 ng/μl
細胞	1×10⁶-1×10⁷個
全血	≥0.5 ml
唾液	≥4 ml

常見問題

1. 怎样判断935K 芯片是否包含客户关心的位点?
- 这款芯片的CpG探针全面覆盖 CpG 岛、启动子区、增强子区以及基因编码区必一·运动(B - Sports)体育官方网站标题尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录，客户可以根据芯片位點分布来判断U8国际·[中国区]有限公司官网标题。除此之外U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录，我们还可以提供芯片具体的位点信息帮助客户判断位点是否在芯片中球客岛-专业体育赛事直播资讯平台U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」。
2. 与850K 芯片相比必一·运动(B - Sports)体育官方网站B体育(China)中国官方网站-B SPORTS，935K 芯片存在哪些优势呢?
- 935K 芯片最大限度的保留了850K兼容性必一·运动(B - Sports)体育官方网站意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTS球客岛-专业体育赛事直播资讯平台，去除了850K 芯片 10.7 万個功能不佳的 CpG 探针球客岛-专业体育赛事直播资讯平台U8国际·[中国区]有限公司官网J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌，增加了超过 18.6 万個新探针J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌，靶向已知的增强子、超级增强子、CTCF 结合域以及使用ATAC-seq和ChIP-seq鉴定的与原发性肿瘤相关的染色质开放区域U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」标题意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTS，位点数更多、覆盖更广、性价比更高标题U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」。
3. 甲基化的差异分析支持无生物学重复吗标题？差异筛选的规则是什么意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTSU8国际·[中国区]有限公司官网必一·运动(B - Sports)体育官方网站？
- 目前常规情况下甲基化差异分析是不支持无生物学重复样本的K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发，差异筛选时U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」球客岛-专业体育赛事直播资讯平台，我们通常会以Delta Beta大于0.2意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTSB体育(China)中国官方网站-B SPORTS，adjP值小于0.05作为标准筛选差异位点意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTSU8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌，但具体筛选阈值可能会根据项目的实际情况进行调整意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTS必一·运动(B - Sports)体育官方网站。
4. 差异分析的时候意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTSU8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」，文件结果怎么看对照和处理的差异J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录？
- 分析结果中必一·运动(B - Sports)体育官方网站尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录，我们会将control组与case组以control_vs_case的形式作为分析结果标题球客岛-专业体育赛事直播资讯平台，其中的Delta Beta值尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录球客岛-专业体育赛事直播资讯平台B体育(China)中国官方网站-B SPORTS，则表示case组相较于control组出现的变化K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发，若DeltaBeta为正B体育(China)中国官方网站-B SPORTS，则表示case组甲基化水平高于control组K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发球客岛-专业体育赛事直播资讯平台J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌，为高甲基化球客岛-专业体育赛事直播资讯平台K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发必一·运动(B - Sports)体育官方网站，反之则为低甲基化U8国际·[中国区]有限公司官网尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录。

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