基因組測序>
建庫測序>
人类基因組測序>
动植物基因組測序>
微生物基因組測序>
轉錄調控測序>
表觀組測序>
單細胞測序>
空間轉錄組>
基因分型>
質譜分析>
蛋白組學分析>
代謝組學分析>
血液蛋白質組分析>
多組學聯合分析>
分子育種>
基因合成>
動植物多組學组合形式
基因組+重測序+轉錄組
獲取物種參考基因組尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版,並利用重測序獲得性狀相關基因DB旗舰·(中国区)官方app网站有限公司官网杏宇娱乐-杏宇注册登录平台,與轉錄組進行關聯球客岛-专业体育赛事直播资讯平台,相互驗證結果杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口,縮小候選基因範圍杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口,並研究性狀調控機制球客岛-专业体育赛事直播资讯平台杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口OG视讯·(中国区)官方网站。基因組+轉錄組+代謝組
整合基因組變異、基因表達和代謝物數據熊猫体育「ChinaPanda」App下载官方网站尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版,構建代謝物-基因-遺傳位點的互作關系網絡尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心,研究育種過程中代謝物變化的遺傳基礎熊猫体育「ChinaPanda」App下载官方网站官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心。基因組+轉錄組+表觀遺傳
基因組變異結果與ATAC-seq、Hi-C、甲基化等多組學數據進行集成DB旗舰·(中国区)官方app网站有限公司官网,進一步從不同層面探索造成性狀差異的生物學機制官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心。诺禾動植物多組學技术优势
更专业 熊猫体育「ChinaPanda」App下载官方网站,更先进 OG视讯·(中国区)官方网站,更优质 杏宇娱乐-杏宇注册登录平台杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口,更多元多組學取樣建議
| DNA 重测序样本 | 取樣標准 | 样本间不能有明显的亚群分化OG视讯·(中国区)官方网站,主要为自然群体尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版,群体来源广泛、遗传多样性 丰富 |
|---|---|---|
| 數量 | 建议样本量≥ 200 个 | |
| 測序深度 | 全基因組測序球客岛-专业体育赛事直播资讯平台,測序深度建议不低于 10×/ 样 | |
| 代謝組樣本 | 取樣標准 | 每个物种选 3-5 株不同的样本OG视讯·(中国区)官方网站官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,植物取不同植株上的果实或叶片等组织杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口乐天堂fun88·(官网)娱乐中心 -我的账户尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版,动物 取不同组织部位样本(或特定器官)官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心乐天堂fun88·(官网)娱乐中心 -我的账户OG视讯·(中国区)官方网站,混样作为一个生物学重复(取样时间、 部位、环境尽量保持一致) |
| 甲基化樣本 | 取樣標准 | 由于表观遗传学具有显著的组织特异性熊猫体育「ChinaPanda」App下载官方网站,不同组织细胞间甲基化状态可能会有 巨大差异杏宇娱乐-杏宇注册登录平台,最好针对研究部位进行取样 |
| 轉錄組樣本 | 取樣標准 | 與其組學的材料來源相同 |
| 注意:各組學樣本分裝保存並寄送 | ||
信息分析內容
| 基因组 de novo 分析 | 代謝組數據分析 | 甲基化數據分析 | 轉錄組數據分析 |
|---|---|---|---|
| 基因组 de novo 组装 | 代謝物定性定量 | 與參考基因組比對 | 可變剪切分析 |
| 基因組注釋 | 代謝物數據質控 | 甲基化位點檢測 | 基因表達水平分析 |
| 比較基因組分析 | 代謝物通路及分類注釋 | 甲基化分布分析 | 差異基因分析 |
| 共线性 /WGD 分析 | 差異甲基化分析 | ||
| 基因組+重測序+代謝組+轉錄組/甲基化聯合分析 | |||
| 分析類型 | 分析內容 | 解決問題 |
|---|---|---|
| 染色體重排鑒定 | 基因組共線性比對並分析各組共線性片段 | 结合代谢组数据或者甲基化数 据乐天堂fun88·(官网)娱乐中心 -我的账户熊猫体育「ChinaPanda」App下载官方网站DB旗舰·(中国区)官方app网站有限公司官网,适应性形成机制乐天堂fun88·(官网)娱乐中心 -我的账户OG视讯·(中国区)官方网站,调控遗 传机制官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心熊猫体育「ChinaPanda」App下载官方网站,提高优势育种效率和 准确性熊猫体育「ChinaPanda」App下载官方网站。 |
| 祖先染色體核型構建 | 祖先核型分析OG视讯·(中国区)官方网站,基因組核型信息與基因組重排統計 | |
| 代謝組樣本 | 取樣標准 | |
| 多倍體亞基因組差異表達 | 共线性基因对 Ka/Ks 计算乐天堂fun88·(官网)娱乐中心 -我的账户杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,与转录组数据比对后计算亚基因组间表达差异 | 多倍体物种各亚基因组之间的 表达差异熊猫体育「ChinaPanda」App下载官方网站球客岛-专业体育赛事直播资讯平台,解析转录动态和基 因组相互作用 |
| 基因家族鉴定 基因结构与蛋白结构分析DB旗舰·(中国区)官方app网站有限公司官网,进化树构建熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,染色体定位等 | 为研究物种多组学功能、分子 遗传、代谢调控提供数据支持 | |
| 個性化分析 | ||
| 多組學數據庫 | 可視化展示物種基因組、轉錄組、表觀組、代謝組等組學數據杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口,整合分析結果 | 为研究物种多组学功能、分子 遗传、代谢调控提供数据支持 |
| 重測序群體分析 | 代謝組數據分析 | 甲基化數據分析 | 轉錄組數據分析 |
|---|---|---|---|
| 與參考基因組比對 | 代謝物定性定量 | 與參考基因組比對 | 可變剪切分析 |
| 標記檢測及注釋 | 代謝物數據質控 | 甲基化位點檢測 | 基因表達水平分析 |
| 群體遺傳多態性分析 | 代謝物通路及分類注釋 | 甲基化分布分析 | 差異基因分析 |
| LD 分析 | 差異甲基化分析 | ||
| 重测序 + 代谢组 / 甲基化联合分析 | |||
| 分析類型 | 分析內容 | 解決問題 |
|---|---|---|
| 表型處理 | 生物学重复表型 / 异常表型處理 | 檢驗表型是否符合正態分布的規律 |
| 性狀關聯分析 | 基因型与表型性状(代谢物 / 甲基化)关联分析尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版,曼哈顿图、QQ 图 | 鉴定出与代谢物 / 甲基化变异密切相关 且具有特定功能的基因位点或标记位点 |
| 候選基因功能注釋 | 显著 SNP 位点所在物理位置上下游一定区域内的相关基因进行功能 注释 | |
| 候選區域單倍型圖譜構建 | 对显著关联 SNP 位点所处的单倍型进行单体型内基因注释杏宇娱乐-杏宇注册登录平台熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,找到功 能相关基因位点 | |
| 重测序 + 转录组联合分析 | ||
| eQTL 分析 | cis-e QTL、trans-e QTL 分析 | DNA 调控区变异位点对基因表达的影响 |
|---|---|---|
| GWAS-eQTL 分析 | 与 GWAS 结果关联的 eQTL 结果 | 将 eQTL 数据与 GWAS 数据量化整合DB旗舰·(中国区)官方app网站有限公司官网, 实现从 SNP 到基因表达再到复杂性状 的精准定位 |
| TWAS 分析 | 基因 - 表型关系官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,基因表达与表型之间的关联分析 | 找出表达量与复杂性状关联的基因熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,即 鉴定出显著的性状 - 基因表达关联 |
| 個性化分析 | ||
| SV/CNV 分析 | SV/CNV 检测及注释 | 开发 SV/CNV 标记 |
|---|---|---|
| 選擇消除分析 | Tajima′ D 测验、Fst 分析、θπ 分析、Fst & Pi 分析 | 挖掘與馴化性狀相關的基因 |
| 與選擇消除聯合分析 | mGWAS 分析结果与选择消除结果联合分析 | 縮小變異相關候選區間 |
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