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空間轉錄組

10x Visium 空間轉錄組

10x Visium空間轉錄組—基因表达与形态学内容相结合

  • 空间轉錄組測序可以提供研究对象的转录组等数据信息EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAceXC-sports(中国区)-体育官方网站入口,同时还能定位其在组织中的空间位置杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站,将转录组 信息与空间位置信息相结合qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发,为检测组织中的细胞空间组成与基因表达提供了强有力的手段EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站。
  • 高分辨率:

    10x Visium 空間轉錄組产品以前所未有的分辨率来展示组织不同位置细胞中的基因活跃信息九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站,将空间位置信息 和转录组分析相结合EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」,有着令人期待的应用前景EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」。
  • 高效産出:

    該産品優勢體現在樣本准備簡單U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口,技術周期短九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户,分辨率高杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页),靈敏度高和無偏檢測基因表達杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce。

應用方向

  • 腫瘤學研究

    研究腫瘤微環境、腫瘤異質性、病程進展、病症形態、腫瘤浸潤淋巴細胞九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)。
  • 免疫學研究

    研究免疫細胞浸潤、免疫細胞中的基因表達特征、免疫群體的擴散娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户XC-sports(中国区)-体育官方网站入口。
  • 發育生物學研究

    研究免疫細胞浸潤、免疫細胞中的基因表達特征、免疫群體的擴散九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站。
  • 神經科學研究

    繪制大腦的各個細胞層U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce,區分正常與患病的大腦解剖特征PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户。
  • 病理學研究

    通過添加基因表達維度得出形態學結論熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站,通過基因表達了解可能發生假陰性/假陽性的位置PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)。

諾禾優勢

  • 1. 专业服务平台

    诺禾空間轉錄組拥有完善的技術平台K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站,专业的服务團隊杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站,丰富的项目经验PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站,精湛的切片技术熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发,极致的服务周期以及提供一 站式解决方案PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站。采用Illumina NovaSeq6000平台测序杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站,项目周期30个自然日EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」,高效精准EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」,实现稳定的测序数据分析及交付K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站。
  • 2. 科学方案设计

    从样本冷冻包埋熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」,样本的预处理娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户,建庫測序XC-sports(中国区)-体育官方网站入口U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」,到数据分析熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站,每一环节都经过科学、缜密的 设计娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户,以保障高质量数据产出熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站。

信息分析

获得原始测序序列(Sequenced Reads)后熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口,通过如下流程进行标准生物信息分析:

關聯分析

  • 1. 10x Visium空間轉錄組+10x Genomics单细胞3'转录组产品

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  • 2. 10x Visium空間轉錄組结合其他产品

    结合基因组、转录组、蛋白组等多组学产品熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发XC-sports(中国区)-体育官方网站入口,包括scATAC-seq、Bulk RNA-seq、原位测序等技术K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」,将不同层面之间的信息进行整合杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站XC-sports(中国区)-体育官方网站入口EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」,多维度数据为研究提供新的思路娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发。

常見問題

  • 1. 为什么选空间轉錄組測序技术娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页),它能为我们带来什么样的结果EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发?

    • 在生物學中EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce,“空間”這個概念具有非常重要的意義杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页),因爲它可以讓我們用來描述生物網絡的相互作用EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」XC-sports(中国区)-体育官方网站入口九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页),生物網絡中每個細胞都受到其周圍環境的影響熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站XC-sports(中国区)-体育官方网站入口,例如:
      (1)想了解多細胞生物中某類細胞的功能特性杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站,只有結合它們的空間位置信息娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户,才能更好的诠釋該類細胞在特定環境下的生物學功能娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户XC-sports(中国区)-体育官方网站入口。原因是每個細胞都不是孤立的PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAceU8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」,處于不同的微環境中EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」,基因表達模式會有不同K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发XC-sports(中国区)-体育官方网站入口,行使的功能也會出現差異PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce。
      (2)衆所周知K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口,在胚胎發育時期娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户,細胞處于胚胎中的位置不同XC-sports(中国区)-体育官方网站入口qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口,有著不同的發育命運娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户,從而形成特定的器官PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce。
      (3)肿瘤的发生U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce,生长U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」,转移及演化与肿瘤所处的微环境有着密切的关系EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」,肿瘤细胞qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户,肿瘤相关的基质细胞(stromal cell)及周围的血管qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户,组织免疫细胞等共同形成了“肿瘤微环境”EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」,肿瘤与环境之间既可以相互促进又可以相互拮抗EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站,因此利用空間轉錄組对肿瘤微环境的研究对于认识肿瘤的发生娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发,发展熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口,转移和治疗有着重要的意义娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce。 空間轉錄組的优势还体现在无偏基因检测层面熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页),即样本在维持原有形态的前提下进行基因表达检测XC-sports(中国区)-体育官方网站入口,在神经科学领域方面有着明显的优势和效果产出杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口。
  • 2. 空間轉錄組的输出结果类似于一个组织有序的地图U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」,围绕着感兴趣的地方进行深层次的数据挖掘娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户XC-sports(中国区)-体育官方网站入口,弥补之前位置缺失的情况下K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发,我们对事物本质的认知EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」。10x Visium 空間轉錄組产品可以做的样本类型娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户?

    • 目前 10x 官方测试的石蜡样本类型包含人、小鼠各器官(待优化的組織類型有:脂肪组织、扁桃体组织和皮肤组织);新鲜冷冻样本类型包含人、小鼠和大鼠各器官(待优化的組織類型有:骨髓组织、健康小鼠的皮肤和胰腺组织);其它物种样本九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户,尤其是哺乳类动物样本娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户,可进行尝试qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页),但会有些风险EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」。建议先收集样本九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口,进行组织冷冻包埋和质检熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口,和组织透化U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」,组织透化合格的样本成功率更高一些EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」。
  • 3. 对于人、鼠较为特殊的组织样本娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口,比如胚胎、眼或较为柔软纤薄的组织XC-sports(中国区)-体育官方网站入口娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站,预处理时会有一定的难度杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站,难点在于哪里K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户?应该如何操作EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」?

    • 難點在于冷凍包埋時要保持其原本的形態結構熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」,以及調整到合適的位置以保證切片時切到您感興趣的研究面EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站,建議先拿組織進行一些冷凍包埋和切片的預實驗杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站,多練習和嘗試K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发。
  • 4. 新鲜样本收集与预处理的方法及注意事项qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户?

    • 應盡量收集新鮮的組織樣本PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAceU8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」,避免室溫長時間放置XC-sports(中国区)-体育官方网站入口杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站,避免汙染K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAceqy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口。如果是臨床樣本娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户,建議盡量將組織放在幹淨的離心管或者密封袋中U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」,然後埋入冰中U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」,短暫保存和運輸qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口。
  • 5. 组织尺寸标准qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」XC-sports(中国区)-体育官方网站入口,及尺寸不符的处理办法K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)?

    • 样本截面大小应不超过6.5 mm × 6.5 mmqy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户。
      稍大的组织样本九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)XC-sports(中国区)-体育官方网站入口K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发,比如长条状的EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」,长度在1 cm左右K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发,可在组织切片通过组织划分的方法获得合适大小的切片EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」。
      如果是過大的樣本XC-sports(中国区)-体育官方网站入口,建議在速凍前先進行組織分割成多個小塊qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发,樣本過大可能會導致組織冷凍不均勻熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce,破壞組織結構EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」。
      如果樣本很小九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页),可在冷凍包埋時將多個樣本同時包埋EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发。
  • 6. 组织的冷冻和包埋的方法娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户?

    • 根據組織凍存和包埋的順序PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAceK8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发,可選用兩種方式:
      (1)先冷凍後包埋
      新鲜的组织需要进行速冻(异戊烷液氮孕苊ㄌ逵钢泄鶳anda」直播认证官方网站K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发。┮员苊 RNA 降解和冰晶的形成U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」。组织速冻后熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站XC-sports(中国区)-体育官方网站入口,需要在干冰上进行 OCT 包埋熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」,OCT 作用是维持组织形态结构杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站,在切片时提供结构支撑熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce。
      (2)冷凍和包埋同時進行
      有些組織(比如胚胎等)非常柔軟九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce,失去液體的支撐就會改變其正常形態杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户,對于這樣的組織可采取冷凍和包埋同時進行(異戊烷液氮杂槔种行摹⒉岽筇ü偻┯槔种行 -我的账户。┑姆椒ň庞巍せ(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站。
      具体方法步骤可参见微信文案https://mp.weixin.qq.com/s/3pMshpxCeyqDzj--_KaPUQ冷冻包埋方法不仅仅局限于文档中的方法九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAceU8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」,如果客户用自己的方法速冻包埋后质检合格即可用于空間轉錄組实验U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」。
  • 7. 样本质检的内容及方法U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发?

    • 组织需要进行质检EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户,然后才能进行正式的空間轉錄組实验熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站,质检合格的样本进行后续空间测序成功率会高很多PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce,质检的内容主要包括:
      (1)組織形態學檢測:
      冰冻切片或石蜡切片U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」XC-sports(中国区)-体育官方网站入口娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户,做普通 H&E 染色即可娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」。主要看样本是否符合客户研究目的PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAceXC-sports(中国区)-体育官方网站入口,其次观察组织形态上是否完整XC-sports(中国区)-体育官方网站入口PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站,比如是否有大的裂痕、冰晶形成而产生的空泡、褶皱等XC-sports(中国区)-体育官方网站入口娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户。
      (2)RNA 完整性检测:
      冰冻切片提取 RNA娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户,跑2100检测 RIN 值K8凯发就来凯发集团【中国】天生赢家一触即发U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」,理想情况下 RNA RIN 值应大于7;石蜡切片因RNA完整性被破坏娱乐中心—注册大厅(官网)娱乐中心 -我的账户杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站,提取RNA测DV200XC-sports(中国区)-体育官方网站入口EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」PA体育-视讯(中国区)官网 - PlayAce,RNA DV200应大于等于50%XC-sports(中国区)-体育官方网站入口EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」。对于未达标的样本九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)熊猫体育「中国Panda」直播认证官方网站,理论上不推荐进行空間轉錄組测试EON4-意昂4凯捷「强保障平台,更省心注册」U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」杏鑫平台|杏鑫娱乐-专为杏鑫提供注册登录服务的网站。

拓展材料

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