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單細胞測序

产品簡介

  • 单细胞三代全长轉錄組測序技术综合了10x Genomics平台的单细胞捕获技术和Nanopore公司的三代全长测序技术熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩,能够读取单细胞转录本的全长信息VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网,不仅能实现二代测序的全部生信分析博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩,还可以在Isoform澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩,融合基因龙8-long8·(国际)唯一官方网站熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台,可变剪接等方向的深入拓展研究博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口。 諾禾致源单细胞转录组二代+三代解决方案db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS,利用10x Genomic平台微流控、油滴包裹和 barcode 标记等技术博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站,来实现高通量的细胞捕获和标记Zoty中欧·(中国)体育官方网站,对单细胞mRNA捕获后进行反转录生成cDNA意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台,将同一份cDNA分成两部分VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩,分别构建二代测序文库和三代测序文库;用Illumina和Oxford Nanopore PromethION平台分别对二代和三代转录组文库进行测序;使用10x Genomics官网推荐的相应的分析软件及可视化软件对二代数据进行下游数据分析;使用Oxford Nanopore的wf-single-cell分析流程意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站,对三代数据进行下游分析K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口球盟会·qmh(中国区)-官方网站。

應用方向

  • ✓ 分析不同细胞间转录本的异质性
  • ✓ 探究可变剪接、融合基因形成的原因
  • ✓ 探究Isoform产生的原因
  • ✓ 分析Isoform对细胞/组织功能的影响
  • ✓ ......

諾禾優勢

  • ✓ 超过30000例单细胞样本制备经验意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTSZoty中欧·(中国)体育官方网站,丰富完善的各物种样本类型制备方法澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站,全流程一站式服务
  • ✓ 采用2+3技术路线博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩,二代和三代测序应用于同一份样品Zoty中欧·(中国)体育官方网站,提高数据可信度VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站龙8-long8·(国际)唯一官方网站,精准定量转录本
  • ✓ 丰富的单细胞样本制备捕获经验博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩,单细胞三代兼容单细胞二代样本类型
  • ✓ 结合10×单细胞捕获技术博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩,实现了高通量、低成本、高灵敏度的全长序列分析
  • ✓ 检测融合基因信息K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口球盟会·qmh(中国区)-官方网站龙8-long8·(国际)唯一官方网站,可以将融合基因定位到细胞亚群Zoty中欧·(中国)体育官方网站,实现对融合基因所在细胞的基因表达差异研究(融合 vs 非融合)意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTSZoty中欧·(中国)体育官方网站,后续可以通过拟时序分析博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTSZoty中欧·(中国)体育官方网站,在分化轨迹中标注融合基因发生的位置球盟会·qmh(中国区)-官方网站,拓展融合细胞的研究范畴
  • ✓ 挖掘功能基因球盟会·qmh(中国区)-官方网站澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站Zoty中欧·(中国)体育官方网站,如膜蛋白、分泌蛋白、转录因子等的转录本使用情况K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口Zoty中欧·(中国)体育官方网站博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩,并发现全新功能转录本(isoform)
  • ✓ 二代测序与三代测序优势互补熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台球盟会·qmh(中国区)-官方网站澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站,基于三代更全面的转录本信息意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS,得到更精细的细胞亚群

生信分析

使用 NanoPlot 对原始数据进行基本质控及數據展示Zoty中欧·(中国)体育官方网站博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站,随后使用wf-single-cell 软件对单细胞三代全长转录组数据进行基本过滤后意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS,比对基因组进行基因及转录本等的定量龙8-long8·(国际)唯一官方网站,再使用 Seurat 软件球盟会·qmh(中国区)-官方网站,直观地展示细胞分群和细胞亚群在TSNE/UMAP上的二维分布以及差异基因和差异转录本的表达情况澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站。后续对这些差异基因进行功能富集意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTSK8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口,从而鉴定亚群的功能特征球盟会·qmh(中国区)-官方网站,而基于转录本的差异结果可实现不同可变剪切分析Zoty中欧·(中国)体育官方网站K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口。此外还可借助相应数据进行融合基因分析博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网。

常見問題

  • 1. 为什么要做單細胞全長轉錄組K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口?

    • 单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 能够表征来自复杂组织的单个细胞之间的基因表达差异熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网,提供更高分辨率的转录组信息意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站。目前大多数单细胞实验都是使用短读长完成的VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩。由于短读长的片段化球盟会·qmh(中国区)-官方网站Zoty中欧·(中国)体育官方网站,只捕获分子的各端意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS龙8-long8·(国际)唯一官方网站K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口。测序片段只能在基因水平上提供表达信息博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩,缺少可能对疾病或生物功能十分关键的异构体多样性分析Zoty中欧·(中国)体育官方网站意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS。
      而單細胞全長轉錄組测序VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩龙8-long8·(国际)唯一官方网站db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网,可获得完整mRNA序列db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网球盟会·qmh(中国区)-官方网站,用于对不同mRNA异构体、可变剪切、融合基因等进行分析Zoty中欧·(中国)体育官方网站博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩,随着单细胞研究领域的越来越深入球盟会·qmh(中国区)-官方网站Zoty中欧·(中国)体育官方网站,在癌症、神经生物学、发育生物学、免疫学、基因编辑、耐药研究等方向都有广泛应用前景Zoty中欧·(中国)体育官方网站。
  • 2. 單細胞全長轉錄組目前支持的样本类型澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台球盟会·qmh(中国区)-官方网站?产品策略推荐db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网Zoty中欧·(中国)体育官方网站?

    • 單細胞全長轉錄組目前不限物种VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩球盟会·qmh(中国区)-官方网站,送樣建議与10x单细胞转录组一致球盟会·qmh(中国区)-官方网站db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口,非常规物种为保证数据质量VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩Zoty中欧·(中国)体育官方网站意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS,建议先做单细胞二代转录组龙8-long8·(国际)唯一官方网站,基于二代数据质量良好的基础上球盟会·qmh(中国区)-官方网站db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网VSport -(CHINA) 胜利因您更精彩,执行单细胞三代建庫測序意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTSK8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网。
      产品策略推荐单细胞“2+3”技术策略球盟会·qmh(中国区)-官方网站意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS,即同一份样本经10x Genomics捕获后球盟会·qmh(中国区)-官方网站龙8-long8·(国际)唯一官方网站,反转录成cDNA;后续将cDNA一分为二意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTSK8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口龙8-long8·(国际)唯一官方网站,一部分二代建庫測序(主要用于基因定量);一部分进行Oxford Nanopore Technologies三代建庫測序(主要用于融合基因/可见剪接/isoform分析);3.單細胞全長轉錄組推荐细胞捕获数意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS?数据产出是多少K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站Zoty中欧·(中国)体育官方网站?
      单细胞三代全长轉錄組測序建议的细胞数为5000-8000意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS球盟会·qmh(中国区)-官方网站,正常情况下db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台,一个单细胞二代转录组样本可对应一个单细胞三代全长轉錄組測序芯片Zoty中欧·(中国)体育官方网站,单细胞三代数据产出约为80M readsZoty中欧·(中国)体育官方网站db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网,数据量约80G龙8-long8·(国际)唯一官方网站澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站Zoty中欧·(中国)体育官方网站。
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  • 4. 对于之前已经执行过二代單細胞測序样本意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTSVSport -(CHINA) 胜利因您更精彩球盟会·qmh(中国区)-官方网站,是否可以直接进行Nanopore单细胞三代建庫測序K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台?

    • 可以意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS龙8-long8·(国际)唯一官方网站博天堂(918)官方网站 - 让你更精彩,要求如下:(1)捕获试剂类型:10x Genomics 3’ V3.1(2)二代单细胞数据质量良好(3)捕获后的cDNA剩余量≥50ng
      满足以上三点的基础上意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS,可以将该cDNA质检熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站,质检合格后db娱乐体育官网下载(中国)有限公司官网,即可进行Nanopore单细胞三代全长转录组建庫測序意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站。

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