杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来·(中国区)杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来-10X 单细胞 ATAC-諾禾致源-单细胞10XATAC

基因組測序>
- 建庫測序>
  - 二代建庫測序服务
  - 三代建庫測序服务
- 人类基因組測序>
- 动植物基因組測序>
- 微生物基因組測序>
轉錄調控測序>
表觀組測序>
單細胞測序>
空間轉錄組>
基因分型>
質譜分析>
- 蛋白組學分析>
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- 血液蛋白質組分析>
  - Olink血液蛋白質組學
多組學聯合分析>
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10X 单细胞 ATAC

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产品簡介

單細胞ATAC測序是一種利用Tn5轉座酶探究染色質可接近性的測序技術V体育(VSport)官网-专业体育赛事直播与资讯平台long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站入口澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站。經過改造的Tn5轉座酶與細胞核孵育PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰球客岛-专业体育赛事直播资讯平台，Tn5轉座酶可以靶向染色質開放區進行切割long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站入口PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站，並一步插入測序接頭意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!beat·365(中国)-官方认证网站V体育(VSport)官网-专业体育赛事直播与资讯平台，大大縮短建庫時間PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰。單細胞ATAC測序結果可以展示表觀遺傳學方面的變化long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站入口熊猫体育中国app官网下载地址（官方）认证体育赛事直播平台beat·365(中国)-官方认证网站，在單細胞水平揭示染色質的可及性意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTSbeat·365(中国)-官方认证网站PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站，推算轉錄因子的結合位點和核小體的區域位置PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰。探究造成基因表達變化的深層原因澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站。图1 scATAC-seq捕获流程

産品特點

高通量：
10x Genomics 单细胞ATAC测序平台利用微流控和凝胶珠技术beat·365(中国)-官方认证网站，可一次性获得成千上万细胞核中的表观遗传信息熊猫体育中国app官网下载地址（官方）认证体育赛事直播平台PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站。一步建库省去后期酶切、加尾、连接的时间PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!熊猫体育中国app官网下载地址（官方）认证体育赛事直播平台，通量高、周期短球客岛-专业体育赛事直播资讯平台beat·365(中国)-官方认证网站。
精確：
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聯合單細胞轉錄組獲取多組學信息：
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10x scRNA和10x ATAC分开做的方法澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站入口，使用Find Transfer Anchors鉴定scATAC-seq数据集和scRNA-seq数据集的锚点进行整合分析
10x Multiome使用加权最近邻方法(WNN),对RNA数据以及ATAC数据进行联合降维聚类澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站，分析ATAC和RNA细胞对应关系澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站熊猫体育中国app官网下载地址（官方）认证体育赛事直播平台意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!，对不同cluster的基因进行差异富集分析澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!。
（2）多組學細胞類型之間的相關性分析
對于scRNA-seq數據PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰熊猫体育中国app官网下载地址（官方）认证体育赛事直播平台，得到每種細胞類型關于每一個基因的平均表達量；對于scATAC-seqPG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站，得到平均基因活性；之後做歸一化意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰，並得到基因的z-score值意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!，然後利用高變基因球客岛-专业体育赛事直播资讯平台V体育(VSport)官网-专业体育赛事直播与资讯平台，計算scATAC-seq?數據和scRNA-seq數據細胞類型的Pearson相關系數
（3）Peak-gene相關性分析：通過基因表達和附近peak可及性的相關性beat·365(中国)-官方认证网站PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站，來找到能調控該基因的peak集合

諾禾優勢

1.豐富的項目經驗：
單細胞ATAC樣本數2000+熊猫体育中国app官网下载地址（官方）认证体育赛事直播平台，涉及物種人、鼠、豬、小麥等20多個物種PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站入口。
2.過硬的技術實力：
40人资深实验专家團隊意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站beat·365(中国)-官方认证网站，进口高端实验设备long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站入口意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTSbeat·365(中国)-官方认证网站，六大区域实验室熊猫体育中国app官网下载地址（官方）认证体育赛事直播平台PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站，多点驻地实验员澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰，业务覆盖全国beat·365(中国)-官方认证网站澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站。
3.專業和多樣化的分析內容：
深入挖掘ATAC數據PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站入口，聯合轉錄組進行機制解析PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTSV体育(VSport)官网-专业体育赛事直播与资讯平台，澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS。

信息分析

10x Genomics 单细胞ATAC 产品同时满足了表观遗传学研究与高通量细胞捕获的需求beat·365(中国)-官方认证网站，可以在单细胞水平揭示细胞核内染色质可及性的差异long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站入口熊猫体育中国app官网下载地址（官方）认证体育赛事直播平台，同时还能够鉴定细胞类型特异的转录因子PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站beat·365(中国)-官方认证网站澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站，深入研究基因调控网络熊猫体育中国app官网下载地址（官方）认证体育赛事直播平台球客岛-专业体育赛事直播资讯平台，进一步的分析可以预测转录因子结合位点PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站，推测染色质调控活性意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!beat·365(中国)-官方认证网站熊猫体育中国app官网下载地址（官方）认证体育赛事直播平台，从而在系统发育long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站入口beat·365(中国)-官方认证网站V体育(VSport)官网-专业体育赛事直播与资讯平台，疾病发生等重要生物学过程中揭示细胞在表观遗传学上的差异与动态变化澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站。

常見問題

1.爲什麽選擇單細胞ATAC測序技術PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!？
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2.对于10x scATAC的样本要求long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站入口？
- 1）物種要求：人、小鼠PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰，其他物種要求有較高質量的基因組；
  2）細胞類型要求：能夠制備成高質量單細胞核懸液的類型；
  3）細胞核抽提質量要求：活細胞比例<5%；显微镜下意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS，细胞核形态完整；尽量去除细胞碎片和细胞团beat·365(中国)-官方认证网站PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站，抽提后细胞核总量≥10w意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!。
3.單細胞核懸液制備如何抽核球客岛-专业体育赛事直播资讯平台熊猫体育中国app官网下载地址（官方）认证体育赛事直播平台PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站？
- 1）諾禾致源提供10x scATAC 抽核服务PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站，请联系销售预约；
  2）客户自行抽核beat·365(中国)-官方认证网站意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!，諾禾致源提供资料和经验参考熊猫体育中国app官网下载地址（官方）认证体育赛事直播平台球客岛-专业体育赛事直播资讯平台意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!。
4.單細胞核懸液質檢標准熊猫体育中国app官网下载地址（官方）认证体育赛事直播平台？
- 1）細胞活性≤5%；
  2）無碎片和細胞團；
  3）顯微鏡下核形態完整；
  4）細胞核總量≥10w；
5.染色后的核是否可进行10x scATAC意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!？
- 不可以！结合 DNA 的染料会影响细胞核内的 DNA 构象PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站，导致10x scATAC测序不准确熊猫体育中国app官网下载地址（官方）认证体育赛事直播平台意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰。
6.10x scATAC和10x scRNA如何联合使用意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!？
- 可根据老师需求选取两种方案：1) 10x scATAC+10x scRNA 2) 10x Chromium Single Cell Multiome（ATAC + Gene Expression）
  第 2）种方案可获得同一细胞水平的转录组和ATAC信息熊猫体育中国app官网下载地址（官方）认证体育赛事直播平台，但由于该技术稳定性不高（约60%）PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰，我们更推荐第 1）种方案球客岛-专业体育赛事直播资讯平台。
  1) 10x scATAC+10x scRNA：转录组适合做细胞悬液的意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!，组织分为两份long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站入口PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站，一份悬液做10x scRNA-seqlong8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站入口意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!，另一份直接抽核做10x scATAC-seqlong8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站入口熊猫体育中国app官网下载地址（官方）认证体育赛事直播平台澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站。转录组适合抽核的意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站，抽一份核悬液意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS，分开分别做单细胞转录组和ATACPG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站。后续生信分析意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTSV体育(VSport)官网-专业体育赛事直播与资讯平台，可通过Find Transfer Anchors鉴定scATAC-seq数据集和scRNA-seq数据集的锚点进行整合分析球客岛-专业体育赛事直播资讯平台意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS。
  2）10x Chromium Single Cell Multiome：基于同一细胞核的单细胞^3’基因表达和开放染色质分析澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站，可以同时检测同一细胞核的可及性区域数据和转录本数据熊猫体育中国app官网下载地址（官方）认证体育赛事直播平台澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!，实现单细胞的多組學聯合分析球客岛-专业体育赛事直播资讯平台意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站。
7.開展單細胞ATAC測序意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!，是否必須進行核懸液制備V体育(VSport)官网-专业体育赛事直播与资讯平台？
- 需要long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站入口球客岛-专业体育赛事直播资讯平台PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰，轉座反應需要細胞核分離才能有效工作意昂4体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!beat·365(中国)-官方认证网站。如果沒有細胞核分離球客岛-专业体育赛事直播资讯平台澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站入口，轉座試劑和酶就無法進入核DNA意昂5·Kgame(中国区)体育官方网站-EON SPORTS，檢測性能將受到嚴重影響PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰beat·365(中国)-官方认证网站long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站入口。