尼斯人app官网版下载·尼斯人app官网下载官方版-尼斯人官网·(中国区)尼斯人app官网版下载·尼斯人app官网下载官方版-尼斯人官网-10X 单细胞ATAC-文獻案例-諾禾致源

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10X 单细胞 ATAC

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Integrated single-cell profiling dissects cell-state-specific enhancer landscapes of human tumor-infiltrating CD8+ T cells^[1]

期刊：Molecular cell
影響因子：19.328
發表單位：德國萊布尼茨免疫治療研究所
發表時間：2023年02月

一、研究內容

本文通过单细胞轉錄組測序(scRNA-seq)和单细胞ATAC测序(scATAC-seq)CQ9电子·(中国区)官方app网站有限公司官网熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站，对来源于多个病人的来源的四种实体瘤进行整合分析PG(中国电子)股份有限公司-PG智能科技智慧平台HOME-沐鸣娱乐「强保障平台,更省心注册」，构建了不同TILs（tumor-infiltrating lymphocytesPG(中国电子)股份有限公司-PG智能科技智慧平台CQ9电子·(中国区)官方app网站有限公司官网，肿瘤浸润淋巴细胞）中T细胞的染色质可及性图谱意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐，获得了肿瘤TILs细胞的增强子-启动子互作图谱CQ9电子·(中国区)官方app网站有限公司官网qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口球友直播-球友直播app下载_球友直播app，并鉴定了细胞状态特异性的超级增强子调控元件熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站CQ9电子·(china)唯一官方网站。同时CQ9电子·(中国区)官方app网站有限公司官网，基于单细胞染色质可及性拟时序分化轨迹推断分析意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐HOME-沐鸣娱乐「强保障平台,更省心注册」，确定了TILs功能障碍过程中的关键增强子元件、转录调控因子和关键靶基因CQ9电子·(china)唯一官方网站CQ9电子·(中国区)官方app网站有限公司官网MK(体育科技有限公司)体育·官方网站。

案例二：通過與促炎性間質微環境的相互作用實現基底細胞癌向炎症細胞轉變和腫瘤抵抗

Basal-to-inflammatory transition and tumor resistance via crosstalk with a pro-inflammatory stromal niche^[2]

期刊：Nature Communications
影響因子：17.694
發表單位：斯坦福大學醫學院
發表時間：2024年09月

一、研究內容

采用单细胞轉錄組測序、单细胞ATAC测序、空間轉錄組学和多重成像技术HOME-沐鸣娱乐「强保障平台,更省心注册」CQ9电子·(china)唯一官方网站，结合功能验证CQ9电子·(china)唯一官方网站MK(体育科技有限公司)体育·官方网站，识别出一种炎症和治疗富集同时存在的肿瘤上皮细胞状态球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口，命名为基底细胞癌向炎症细胞转变（BIT）qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口。BIT标志物在许多其他上皮肿瘤中与总体患者生存率呈负相关MK(体育科技有限公司)体育·官方网站意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐。BST（基底细胞癌向鳞状细胞癌的转变）和BIT发生在单个肿瘤的相邻但不同的区域：BST起源于肿瘤结节的核心HOME-沐鸣娱乐「强保障平台,更省心注册」球友直播-球友直播app下载_球友直播appPG(中国电子)股份有限公司-PG智能科技智慧平台，而BIT起源于由与肿瘤相关的TREM1髓系标志物定义的特殊炎症环境球友直播-球友直播app下载_球友直播appMK(体育科技有限公司)体育·官方网站。TREM1髓系衍生的细胞因子IL1和OSM在BIT肿瘤上皮中激活炎症NF-κB家族转录因子意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐球友直播-球友直播app下载_球友直播app球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口，降低了人BCC（基底细胞癌）移植肿瘤对SMOi（平滑抑制）治疗的敏感性熊猫体育-【中国区】官方直播平台网站球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口PG(中国电子)股份有限公司-PG智能科技智慧平台，从而赋予耐药性qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口CQ9电子·(中国区)官方app网站有限公司官网。这项工作对异质性局部肿瘤微环境有了更深入的认识CQ9电子·(china)唯一官方网站球友直播-球友直播app下载_球友直播app意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐，并将BIT确定为由特殊炎症微环境驱动的耐药但可靶向的肿瘤状态CQ9电子·(china)唯一官方网站qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口。

參考文獻

[1] Riegel D, Romero-Fernández E, Simon M, et al. Integrated single-cell profiling dissects cell-state-specific enhancer landscapes of human tumor-infiltrating CD8+ T cells. Mol Cell. 2023;83(4):622-636.e10. doi:10.1016/j.molcel.2022.12.029
[2] Li NY, Zhang W, Haensel D, et al. Basal-to-inflammatory transition and tumor resistance via crosstalk with a pro-inflammatory stromal niche. Nat Commun. 2024;15(1):8134. Published 2024 Sep 17. doi:10.1038/s41467-024-52394-3