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轉錄調控測序

lncRNA測序—研究lncRNA的差异表达如何影响生物学过程

长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)是一类长度超过200 nt的长链非编码RNA尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站,通过与DNA、RNA或蛋白质结合杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载B体育(China)中国官方网站-B SPORTS,在表觀遺傳、转录及转录后等水平调控基因表达U8国际·[官方网]有限公司官网。
lncRNA測序针对有参考基因组样本开展准确的lncRNA鉴定和lncRNA靶基因预测杏鑫平台|杏鑫娱乐-杏鑫登录-杏鑫官方平台MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长乐天堂fun中心(fun88) 官方网站,同时提供针对测序数据中mRNA的分析OG视讯·(中国区)官方网站,结果更全面K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口,广泛应用于医学、农学研究领域尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长。

應用方向

lncRNA測序适合生命体生长发育等各个阶段、部位或方面的研究K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口。
  • 動物

    人、小鼠、斑馬魚等胚胎發育、性腺發育、肌肉發育和免疫調控生命過程研究K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口。
  • 植物

    植物逆境響應、器官發育、生殖生長和病毒侵染等研究MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长OG视讯·(中国区)官方网站B体育(China)中国官方网站-B SPORTS。
  • 癌症疾病

    腫瘤、精神疾病、代謝病、心血管病、免疫病等疾病發生與診治研究杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载。

諾禾優勢

  • 1. 周期快、质量好QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网,稳定性高

    诺禾lncRNA測序采用先进的国内外平台测序MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长,并与高性能计算平台(High Performance ComputingU8国际·[官方网]有限公司官网MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长,HPC)结合OG视讯·(中国区)官方网站杏鑫平台|杏鑫娱乐-杏鑫登录-杏鑫官方平台U8国际·[官方网]有限公司官网,实现快速、稳定的测序数据分析及交付OG视讯·(中国区)官方网站QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网U8国际·[官方网]有限公司官网。交付周期<45天尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网。
  • 2. 方案设计专业尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站OG视讯·(中国区)官方网站QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网,质控严格

    诺禾lncRNA測序采用去核糖体链特异性建库方式B体育(China)中国官方网站-B SPORTSK8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长,能够满足同时对lncRNA和mRNA的差异表达水平的分析以及lncRNA靶基因预测B体育(China)中国官方网站-B SPORTS杏鑫平台|杏鑫娱乐-杏鑫登录-杏鑫官方平台。从材料選取U8国际·[官方网]有限公司官网MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长杏鑫平台|杏鑫娱乐-杏鑫登录-杏鑫官方平台,建庫測序尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站,到数据分析乐天堂fun中心(fun88) 官方网站杏鑫平台|杏鑫娱乐-杏鑫登录-杏鑫官方平台,每一步都经过科学、缜密的设计杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载, 以保障高质量研究成果乐天堂fun中心(fun88) 官方网站B体育(China)中国官方网站-B SPORTS。

    材料選取

    RNA樣本
    ≥1ug

    文庫構建
    鏈特異性文庫

    PE150測序

    信息分析

  • 3. 项目文章以及物种经验丰富

    諾禾致源已经成功完成对人、大小鼠、猴、猪、羊、果蝇、家蚕、沙棘、线虫、拟南芥、水稻、小麦、玉米、棉花等等近百个物种进行非编码RNA测序分析杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站,助力客户在Nature communications、Genome biology、 Science Advance等权威杂志发表多篇高水平文章MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长。
    • 80人

      分析團隊
    • 7年

      項目經驗
    • 2000+

      結題項目
    • 1對1

      項目服務

信息分析

諾禾致源lncRNA測序项目尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站杏鑫平台|杏鑫娱乐-杏鑫登录-杏鑫官方平台乐天堂fun中心(fun88) 官方网站,标准分析流程:主要包括质控QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载,比对OG视讯·(中国区)官方网站K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站,拼接B体育(China)中国官方网站-B SPORTSOG视讯·(中国区)官方网站,筛选QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网,定量K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口OG视讯·(中国区)官方网站,差异lncRNA分析尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口,差异mRNA分析B体育(China)中国官方网站-B SPORTSK8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网,lncRNA靶向mRNA预测杏鑫平台|杏鑫娱乐-杏鑫登录-杏鑫官方平台OG视讯·(中国区)官方网站,功能富集等环节OG视讯·(中国区)官方网站。该分析的核心是基因表达差异的显著性K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网, 比较两个或多个条件下的基因表达差异(例如尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站乐天堂fun中心(fun88) 官方网站OG视讯·(中国区)官方网站,处理与对照)QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站,从中找出与条件相关的差异基因B体育(China)中国官方网站-B SPORTS乐天堂fun中心(fun88) 官方网站U8国际·[官方网]有限公司官网,进一步分析这些差异基因的生物学意义杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载B体育(China)中国官方网站-B SPORTS杏鑫平台|杏鑫娱乐-杏鑫登录-杏鑫官方平台。

關聯分析

  • 1.LncRNA与mRNA關聯分析

    • LncRNA通过co-location或co-expression调控靶基因的表达K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口OG视讯·(中国区)官方网站杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载。针对lncRNA与mRNA的關聯分析杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载,諾禾致源采用对差异表达lncRNA的靶基因与差异表达的mRNA进行交集分析方法B体育(China)中国官方网站-B SPORTS,当样本间差异表达的lncRNA的 靶基因同时也是显著差异表达的mRNA时QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站杏鑫平台|杏鑫娱乐-杏鑫登录-杏鑫官方平台,该差异mRNA受到lncRNA直接或间接调控作用的可能性更大尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站OG视讯·(中国区)官方网站。(样品数 < 5时QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站,选取co-location作用的靶基因与差异表达的mRNA进行分析尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长U8国际·[官方网]有限公司官网。样品数 ≥5 时杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载,则选取 co-location和co-expression作用的靶基因并集与差异表达的mRNA进行分析)
  • 2.lncRNA与miRNA關聯分析

    • 当lncRNA上带有miRNA结合位点时杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载杏鑫平台|杏鑫娱乐-杏鑫登录-杏鑫官方平台B体育(China)中国官方网站-B SPORTS,miRNA可与lncRNA结合影响lncRNA的功能尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载。同时乐天堂fun中心(fun88) 官方网站,根据ceRNA理论B体育(China)中国官方网站-B SPORTSMG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口,miRNA可以通过RISC与lncRNA结合杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口,指导lncRNA的降解尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长。miRNA的靶向lncRNA预测分析MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长乐天堂fun中心(fun88) 官方网站,可通过生信分析 软件预测差异表达的miRNA的靶向lncRNA尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站乐天堂fun中心(fun88) 官方网站OG视讯·(中国区)官方网站。
  • 3.lncRNA、miRNA与mRNA關聯分析

    • LncRNA具有miRNA结合位点尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站,lncRNA通过与mRNA竞争性结合miRNA杏鑫平台|杏鑫娱乐-杏鑫登录-杏鑫官方平台,抑制miRNA对靶基因的调控作用U8国际·[官方网]有限公司官网,从而间接地调控基因表达OG视讯·(中国区)官方网站U8国际·[官方网]有限公司官网。基于ceRNA理论B体育(China)中国官方网站-B SPORTS,筛选拥有相同miRNA结合位点的lncRNA-靶基因对QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网OG视讯·(中国区)官方网站,构建以 lncRNA为decoy、miRNA为核心、mRNA为靶标的lncRNA–miRNA-mRNA调控关系B体育(China)中国官方网站-B SPORTSQY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网,构建ceRNA调控网络乐天堂fun中心(fun88) 官方网站QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网。

送樣建議

樣品類型 送樣建議 備注

新鲜動物组织干重

內髒組織、腦組織≥0.2gU8国际·[官方网]有限公司官网,脂肪、皮膚、骨頭、血管等
其他组织≥0.4 g

核酸不丰富部位OG视讯·(中国区)官方网站B体育(China)中国官方网站-B SPORTS, 例如脂肪、成熟皮肤、骨头等部位建议酌情增加送样量

新鮮植物組織幹重

叶片、花≥0.2gOG视讯·(中国区)官方网站,根、茎、种子等其他组织≥0.7 g

成熟部位MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长B体育(China)中国官方网站-B SPORTS,例如植物莖、根、種子等部位建議酌情增加送樣量

新鮮培養細胞

≥5*106?個  

新采集的全血(液氮速凍)

≥3ml

血液樣本送樣前加入EDTA抗凝管OG视讯·(中国区)官方网站,推薦使用BD管送樣

BD采血管

≥2管  

Total RNA建库起始量

總量:≥1ug

浓度:≥50ng/uL;体积:20uL ≤ V ≤120uL

常見問題

  • 1.哪些物种可以研究lncRNA測序?

    • 要做lncRNA測序分析杏鑫平台|杏鑫娱乐-杏鑫登录-杏鑫官方平台,对物种有以下要求:
      a. 物种为真核生物;
      b. 物种具有参考基因组乐天堂fun中心(fun88) 官方网站U8国际·[官方网]有限公司官网,至少拼接到scaffold水平;
      c. 具有较为完整的注释B体育(China)中国官方网站-B SPORTS杏鑫平台|杏鑫娱乐-杏鑫登录-杏鑫官方平台。
  • 2.lncRNA 是否可以与蛋白质组的数量进行關聯分析 OG视讯·(中国区)官方网站K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口杏鑫平台|杏鑫娱乐-杏鑫登录-杏鑫官方平台?

    • 可以OG视讯·(中国区)官方网站,關聯分析的思路类似于 lncRNA 和 mRNA 的關聯分析OG视讯·(中国区)官方网站,蛋白质组差异表达蛋白和差异表达 LncRNA 靶基因编码蛋白交集分析(聚类杏鑫平台|杏鑫娱乐-杏鑫登录-杏鑫官方平台乐天堂fun中心(fun88) 官方网站,功能富集)

拓展材料

更多內容杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载乐天堂fun中心(fun88) 官方网站尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站,可掃描側邊欄"一對一業務咨詢"二維碼添加科研服務經理咨詢U8国际·[官方网]有限公司官网B体育(China)中国官方网站-B SPORTSOG视讯·(中国区)官方网站。

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