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Integrative analysis reveals associations between oral microbiota dysbiosis and host genetic and epigenetic aberrations in oral cavity squamous cell carcinoma

期刊：npj Biofilms and Microbiomes
影響因子：9.2
發表單位：香港中文大學
發表年份：2024年4月

一、研究背景

據報道尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站，人類口腔微生物群的菌群失調與口腔鱗狀細胞癌（OSCC）有關PA视讯·(中国区)官方网站 - Play，而關于致病菌對宿主基因組和表觀基因組異常的潛在影響的宿主-微生物群相互作用的研究仍然很少beat·365(中国)-官方认证网站qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口PA视讯·(中国区)官方网站 - Play。

二、研究結果

1.OSCC中的口腔微生物群失調
基于加權GUniFrac矩陣的主坐標分析（PCoA）顯示腫瘤組和AN組之間有明顯的分離（p=0.012)PA视讯·(中国区)官方网站 - Play。這一發現強調了與鄰近正常組織相比意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!，與OSCC腫瘤部位相關的獨特微生物群落qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口球客岛-足球比分直播平台沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!。4a）意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!。發現7種粘膜細菌（核梭杆菌、密螺旋體、口胃鏈球菌、黑金菌、黑鏈菌、胃厭氧菌和猴胃球菌）主要定植于癌症患者的口腔beat·365(中国)-官方认证网站意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!。

2.在OSCC中差異表達的宿主基因轉錄組
对40个肿瘤和22个AN组织的一个子集进行了宿主全基因组转录组分析尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来，显示了OSCC肿瘤微环境中存在全局重构的宿主基因失调球客岛-足球比分直播平台MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网。在17225个平均转录本大于1（TPM > 1）中qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光，我們在被調查的OSCC隊列中發現了1407個上調（腫瘤相關）和1525個下調（AN相關）基因PA视讯·(中国区)官方网站 - Play意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口。
3.通過DNA甲基化解除轉錄組調控
从38例随机选择的OSCC患者的配对肿瘤和AN组织进行DNA CpG甲基化分析PA视讯·(中国区)官方网站 - Play球客岛-足球比分直播平台。高甲基化基因包括先前报道的OSCC中复发性高甲基化的靶点球客岛-足球比分直播平台尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口，如DDAH2、CCNA1、DCCMG不朽情缘·官方app网站有限公司官网，以及一些癌症相关基因qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口标题，包括HRASPA视讯·(中国区)官方网站 - Play。同样beat·365(中国)-官方认证网站，低甲基化基因的例子包括三碘化磷、AIM2、PTHLH、IFNG和CEACAM1标题beat·365(中国)-官方认证网站。考虑到宿主表观遗传修饰可能导致转录组失调qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口标题，分别指定了477个低甲基化和636个过表达的DEGs
4.OSCC中宿主基因失調的細菌相關表觀遺傳異常
对细菌甲基化和细菌转录组相关性的综合分析进一步确定了15个被抑制的DEGs沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站，其启动子区域可能被细菌相关的CpG高甲基化所沉默尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站。同时意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光球客岛-足球比分直播平台杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来，DNA CpG低甲基化与基因过表达之间的NRG1和ITGB4的负相关分别与T.培养基和C. morbi丰度相关沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来，提示富含肿瘤的细菌有可能改变DNA甲基化标题意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光，从而转化为激活的基因表达标题。NRG1作为一种致癌基因尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光，结合并激活受体酪氨酸激酶ErbB家族成员qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口PA视讯·(中国区)官方网站 - Play沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!，触发下游信号通路MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网球客岛-足球比分直播平台尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站，如PI3K/AKT和MAPK/ERK通路qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网beat·365(中国)-官方认证网站，这些通路参与细胞生长、存活和增殖PA视讯·(中国区)官方网站 - Play沐鸣2体育-科技赋能场景,让娱乐更有趣!。

5.核梭杆菌的OSCC相關致癌潛能
體外研究結果表明qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口球客岛-足球比分直播平台尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站，在核f菌感染後MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网PA视讯·(中国区)官方网站 - Play，三個EMT標志基因（LAMA3、INHBA、SNAI2）的mRNA表達水平顯著增加尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站PA视讯·(中国区)官方网站 - Playqy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口。此外PA视讯·(中国区)官方网站 - Play标题beat·365(中国)-官方认证网站，我們還將層粘連蛋白332的伽馬亞基的蛋白編碼基因LAMC2作爲補充證據MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网PA视讯·(中国区)官方网站 - Play，它與LAMA3是同一蛋白複合物的一部分beat·365(中国)-官方认证网站。還研究了蛋白層粘連蛋白332beat·365(中国)-官方认证网站球客岛-足球比分直播平台杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来，發現在HGK12和SAS細胞系中MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光标题，F.核核感染可能增加了兩個亞基的蛋白表達MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网。這一觀察結果與共培養細胞系的RNAseq分析的結果一致PA视讯·(中国区)官方网站 - PlayMG不朽情缘·官方app网站有限公司官网杏宇平台|杏宇娱乐|杏宇引领传媒未来，但這些基因參與OSCC的致癌途徑的潛在機制值得進一步研究标题。

三、研究結論

該研究結果擴展了目前對OSCC發病機制中宿主-微生物群相互作用的理解MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网，這爲遺傳和功能基礎提供了重要的潛在診斷標志物和治療靶點beat·365(中国)-官方认证网站qy千亿-千亿(国际)唯一官方网站登录入口，以制定更有效的預防和幹預策略來管理這種疾病實體尼斯人app官网下载官方版(中国)官方网站beat·365(中国)-官方认证网站。

四、參考文獻

Cai L, Zhu H, Mou Q, Wong PY, Lan L, Ng CWK, Lei P, Cheung MK, Wang D, Wong EWY, Lau EHL, Yeung ZWC, Lai R, Meehan K, Fung S, Chan KCA, Lui VWY, Cheng ASL, Yu J, Chan PKS, Chan JYK, Chen Z. Integrative analysis reveals associations between oral microbiota dysbiosis and host genetic and epigenetic aberrations in oral cavity squamous cell carcinoma. NPJ Biofilms Microbiomes. 2024 Apr 8;10(1):39. doi: 10.1038/s41522-024-00511-x. PMID: 38589501; PMCID: PMC11001959.