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轉錄調控測序

lncRNA篩選

諾禾致源通过6步的筛选获得lncRNA集进行后续分析long8·龙8(国际版)头号玩家唯一官方网站EON4-意昂4「强保障平台,更省心注册」。将各软件所识别出的noncoding转录本进行统计CQ9电子·(china)唯一官方网站B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站EON4-意昂4「强保障平台,更省心注册」,画成维恩图B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站熊猫体育【Panda】官方网站- Panda SPORTS,直观的展示各个方法 预测出的noncoding转录本共有和特有的数目long8·龙8(国际版)头号玩家唯一官方网站熊猫体育【Panda】官方网站- Panda SPORTSDB真人旗舰·(中国官方)集团有限公司官网。取几种工具预测结果的交集beat·365(中文)-唯一官方认证网站,作为本次分析预测得到的lncRNA数据集进行后续的分析CQ9电子·(china)唯一官方网站球客岛-专业体育赛事直播资讯平台九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)。经过各步筛选后beat·365(中文)-唯一官方认证网站九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)EON4-意昂4「强保障平台,更省心注册」,对最 终得到的不同种类的lncRNA占比情况进行饼图展示(我们主要针对lincRNA、anti-sense_lncRNA、intronic_lncRNA三种类型的lncRNA进行统计)beat·365(中文)-唯一官方认证网站球客岛-专业体育赛事直播资讯平台DB真人旗舰·(中国官方)集团有限公司官网。

轉錄本特征分析

將lncRNA與mRNA進行結構以及序列保守性(保守性分析針對部分物種)的比較分析CQ9电子·(china)唯一官方网站九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)DB真人旗舰·(中国官方)集团有限公司官网,觀察lncRNA與mRNA的轉錄本長度、exon個數、ORF長度的以及序列保守性的對比情況熊猫体育【Panda】官方网站- Panda SPORTSDB真人旗舰·(中国官方)集团有限公司官网,一方面得到lncRNA與mRNA分子上的差別球客岛-专业体育赛事直播资讯平台熊猫体育【Panda】官方网站- Panda SPORTSCQ9电子·(china)唯一官方网站,一方面驗證預測得到的lncRNA分子是否符合一般特征熊猫体育【Panda】官方网站- Panda SPORTSCQ9电子·(china)唯一官方网站龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOME。

差異表達分析

通過差異分析DB真人旗舰·(中国官方)集团有限公司官网CQ9电子·(china)唯一官方网站龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOME,我們能夠得到在不同處理或不同表型的樣品之間表達顯著差異的轉錄本龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOME,這些轉錄本對應的基因或者靶向的基因可能在不同處理或者不同表型中發揮功能EON4-意昂4「强保障平台,更省心注册」B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站beat·365(中文)-唯一官方认证网站。

功能富集分析

得到差異表達的lncRNA和mRNA之後EON4-意昂4「强保障平台,更省心注册」。
針對lncRNA熊猫体育【Panda】官方网站- Panda SPORTSbeat·365(中文)-唯一官方认证网站long8·龙8(国际版)头号玩家唯一官方网站,我們根據差異表達lncRNA的co-location與co-expression(樣本數≥5)靶基因信息B·体育-运动(B - Sports)体育官方网站,
對lncRNA靶基因進行GO和KEGG富集分析和蛋白網絡互作分析;
針對mRNAB·体育-运动(B - Sports)体育官方网站,我們將差異表達的mRNA對應基因進行富集分析和蛋白網絡互作分析龙8·long8(国际)唯一官方网站-HOME九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌(首页)。

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