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基因組測序>
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建庫測序>
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人类基因組測序>
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动植物基因組測序>
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微生物基因組測序>
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轉錄調控測序>
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表觀組測序>
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單細胞測序>
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空間轉錄組>
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基因分型>
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質譜分析>
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蛋白組學分析>
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代謝組學分析>
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血液蛋白質組分析>
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多組學聯合分析>
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分子育種>
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基因合成>
Stereo-seq空间轉錄組測序-超高分辨率、大视场的原位全景式技术
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Stereo-seq是国内首款高分辨率空間轉錄組技术HOME-杏鑫平台-杏鑫娱乐共创美好未来，该技术基于 DNA 纳米球 (DNA Nano Ball尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网，DNB) 开发熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站Z6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6com意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台，是具有高通量、超高分辨率、大视场的原位全景式技术CQ9电子·(中国区)官方app网站有限公司官网long8·龙8(国际版)头号玩家唯一官方网站熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站，可以实现同一样本在组织、细胞、亚细胞、分子“四尺度”同时进行空間轉錄組分析熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网。该技术通过时空芯片捕获组织中的 mRNAHOME-杏鑫平台-杏鑫娱乐共创美好未来，并通过空间条形码 (Coordinate IDlong8·龙8(国际版)头号玩家唯一官方网站， CID) 还原回空间位置意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台Z6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6com，实现组织原位测序HOME-杏鑫平台-杏鑫娱乐共创美好未来意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台Z6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6com，为深入地了解细胞的基因表达及形态与局部环境之间的关系建立强大的研究技术意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台HOME-杏鑫平台-杏鑫娱乐共创美好未来CQ9电子·(中国区)官方app网站有限公司官网。
技術路線
信息分析
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應用方向
常見問題
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1. 这个技术的优势是什么?
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Stereo-seq作为一种原位捕获（In situ capturing尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录，ISC）技术HOME-杏鑫平台-杏鑫娱乐共创美好未来CQ9电子·(中国区)官方app网站有限公司官网，相较于原位杂交（In situ hybridization意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台HOME-杏鑫平台-杏鑫娱乐共创美好未来尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口，ISH）和原位测序（In situ sequencingHOME-杏鑫平台-杏鑫娱乐共创美好未来long8·龙8(国际版)头号玩家唯一官方网站MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网，ISS）技术尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口，其一次性检测基因数有多个数量级的提升意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站，而在目前所有的原位捕获技术中PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站long8·龙8(国际版)头号玩家唯一官方网站，Stereo-seq的分辨率最高熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站long8·龙8(国际版)头号玩家唯一官方网站，捕获面积最大long8·龙8(国际版)头号玩家唯一官方网站。
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2.为什么组织的空間轉錄組基因捕获数量比单细胞组学得到的少HOME-杏鑫平台-杏鑫娱乐共创美好未来熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台？
空間轉錄組技术相对于单细胞组学需要进行组织透化、芯片mRNA探针捕获操作熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台，因此在不同的组织中会出现不同程度的mRNA信息丢失尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录long8·龙8(国际版)头号玩家唯一官方网站，导致基因捕获数偏少熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台Z6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6com，但可通过时空组学数据结合单细胞数据进行优势互补熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网CQ9电子·(中国区)官方app网站有限公司官网，系统协同阐述生物学问题PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站long8·龙8(国际版)头号玩家唯一官方网站。
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3.能否同時提供切片組織的H&E染色成像圖HOME-杏鑫平台-杏鑫娱乐共创美好未来熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录？
經過技術升級PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站CQ9电子·(中国区)官方app网站有限公司官网，stereo-seq目前已經能夠對進行stereo-seq實驗的切片同時進行H&E染色成像尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口Z6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6com，目前ssDNA染色和HE染色只能二選其一
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4.一個包埋塊中可以包含多少切片組織(是否允許多個小組織包在一個包埋塊裏）CQ9电子·(中国区)官方app网站有限公司官网HOME-杏鑫平台-杏鑫娱乐共创美好未来？
- 根据项目实际熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站long8·龙8(国际版)头号玩家唯一官方网站PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站，联系产品经理沟通需求意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台long8·龙8(国际版)头号玩家唯一官方网站，包埋时尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口，尽量保证所关注的面在同一平面熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站，同时两个组织中间需保留一定距离尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录，建议在1mm以上Z6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6com尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口。但是意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台Z6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6com尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录，为了保证实验效果CQ9电子·(中国区)官方app网站有限公司官网意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台，请您尽量不要使用过凶鹆俜酵竟偻肟�-人生搏中国官网入口PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站。ㄗ橹∮�500 μm × 500μm）或过大（组织覆盖芯片表面超过80%）的组织切片尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录。 另外意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台long8·龙8(国际版)头号玩家唯一官方网站，需要保证包埋在同一组织包埋块里的組織類型统一HOME-杏鑫平台-杏鑫娱乐共创美好未来，以保证透化效果均一Z6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6com。
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5.報告中呈現的BIN大小是如何選擇的CQ9电子·(中国区)官方app网站有限公司官网Z6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6com尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录？
- Stereo-seq芯片的最小分辨率是一个DNB（即BIN1）Z6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6comPG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站，但实际分析中受基因表达的影响long8·龙8(国际版)头号玩家唯一官方网站意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台。如果以过小BIN分析会导致特征值偏低影响聚类准确性熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站，不同物种不同组织中HOME-杏鑫平台-杏鑫娱乐共创美好未来尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台，最优bin size合并方案均有所不同意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网，因此我们一般会默认选择交付BIN200的结果尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口，如有特殊需求尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站Z6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6com，请提前沟通CQ9电子·(中国区)官方app网站有限公司官网。
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6.分析時如何選擇合適的binsize?
- 可以按照不同組織類型的细胞大小等long8·龙8(国际版)头号玩家唯一官方网站HOME-杏鑫平台-杏鑫娱乐共创美好未来，根据下游分析效果多次调试bin20尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录Z6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6comMG不朽情缘·官方app网站有限公司官网，50尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录，100意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台，200数值PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站。其中bin20一般是动物细胞大衂6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6com。琤in50和100是常用于分析的binsize大凶鹆俜酵竟偻肟�-人生搏中国官网入口HOME-杏鑫平台-杏鑫娱乐共创美好未来。琤in200一般用于快速可视化效果展示long8·龙8(国际版)头号玩家唯一官方网站尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口。
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7.一个细胞的大小和square bin size的关系是怎样的熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站Z6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6com意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台？
- 以一个细胞的直径为10 μm左右计算时HOME-杏鑫平台-杏鑫娱乐共创美好未来MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网，一个细胞约相当于bin20（1 0μm x 10 μm）或 bin14（取diagonal = 10 μm）PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站CQ9电子·(中国区)官方app网站有限公司官网意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台。
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8.爲什麽我的數據比對率不高/比對至外顯子區域的reads比例低MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口HOME-杏鑫平台-杏鑫娱乐共创美好未来？
- 在排除實驗、建庫等因素後CQ9电子·(中国区)官方app网站有限公司官网Z6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6comPG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站，比對率不佳一般較常出現在非模式物種中尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录Z6尊龙旗舰厅(中国)凯时 - 人生就是搏!z6com，這與該物種基因組組裝質量、注釋水平密切相關
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