熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站·(中国区)熊猫体育【体育中国】直播平台官方网站-eQTL-諾禾致源-表達數量性狀定位分析

基因組測序>
- 建庫測序>
  - 二代建庫測序服务
  - 三代建庫測序服务
- 人类基因組測序>
- 动植物基因組測序>
- 微生物基因組測序>
轉錄調控測序>
表觀組測序>
單細胞測序>
空間轉錄組>
基因分型>
質譜分析>
- 蛋白組學分析>
- 代謝組學分析>
- 血液蛋白質組分析>
  - Olink血液蛋白質組學
多組學聯合分析>
分子育種>
基因合成>
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eQTL

eQTL—基因組與轉錄組聯合分析九游·会-(官网)真人游戏第一品牌，揭示調控表達位點

表达数量性状基因座（expression quantitative trait lociZoty中欧·(中国)体育官方网站MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网，eQTL）是染色体上一些能特定调控mRNA和蛋白质表达水平的区域MK(体育科技有限公司)体育·官方网站熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网，其mRNA/蛋白质的表达水平与数量性状成比例关系意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!。其具体原理是把基因表达量作为一种数量性状zoty中欧·(中国集团公司)官方网站，研究遗传突变与基因表达的相关性熊猫体育【Panda】官方网站- Panda SPORTS。

應用方向

1.eQTL可以聯合GWAS等分析定位致病風險位點；
2.揭示非編碼區基因突變與基因表達之間的調控關系；
3.探索不同人群中基因差異與基因表達調控的關系；
4.發現藥物等治療前後eQTL差異熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站。

諾禾優勢

1. 分析方案成熟
諾禾致源不仅可以实现基因组与转录组的联合分析MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网，还可以根据进行pQTL、meQTL、mGWAS、EWAS等分析zoty中欧·(中国集团公司)官方网站熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站Zoty中欧·(中国)体育官方网站，以及根据GTEx/TCGA等数据库或队列样本多组学数据开展TWAS、PWAS等分析九游·会-(官网)真人游戏第一品牌MK(体育科技有限公司)体育·官方网站。
2. 周期快、稳定性高
諾禾致源高性能计算平台（High Performance ComputingZoty中欧·(中国)体育官方网站九游·会-(官网)真人游戏第一品牌MK(体育科技有限公司)体育·官方网站，HPC）采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合MK(体育科技有限公司)体育·官方网站，实现快速稳定的测序数据分析及交付澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站zoty中欧·(中国集团公司)官方网站熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站。高性能计算平台将持续更新并扩容zoty中欧·(中国集团公司)官方网站，以保证高效的数据处理和安全的数据存储Zoty中欧·(中国)体育官方网站long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站熊猫体育【Panda】官方网站- Panda SPORTS。
- 20,280個
  物理核數
- 1,727 ^{T flops}
  計算峰值速度
- 400 ^TB
  總內存
- 58.6PB
  總儲存

信息分析

1.全基因組測序分析

参照WGS分析内容MK(体育科技有限公司)体育·官方网站澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站zoty中欧·(中国集团公司)官方网站，检测编码区和非编码区的各类突变；按照遗传模式（显性/隐性/新生突变）筛选家系样本致病位点/易感位点；按照筛选共有位点/基因、關聯分析（GWAS/Burden）筛选散发样本致病位点/易感位点MK(体育科技有限公司)体育·官方网站。

關聯分析
疾病顯著性關聯位點分析（GWAS）	1.Fishe r精准检验
	2.繪制曼哈頓圖
	3.绘制 Q-Q 图
	4.绘制 Locus Zoom 图
疾病顯著性關聯基因分析（Burden）	1.SKATO 统计检验
疾病顯著性關聯基因分析（Burden）	2.绘制Heat map 图
备注：Control 的选择范围（1）客户准备control样本熊猫体育【Panda】官方网站- Panda SPORTSMK(体育科技有限公司)体育·官方网站Zoty中欧·(中国)体育官方网站，和case 样本进行测序后意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站，进行關聯分析；（2）可以免费利用诺禾内部自然人数据库Novozhonghua作为control来做關聯分析；（3）可以利用数据库gnomAD 作为control来做關聯分析澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站MK(体育科技有限公司)体育·官方网站zoty中欧·(中国集团公司)官方网站。

2.轉錄組測序分析

mRNA測序分析：對mRNA表達量定量Zoty中欧·(中国)体育官方网站long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站，獲取差異表達、可變剪切、新轉錄本等信息zoty中欧·(中国集团公司)官方网站Zoty中欧·(中国)体育官方网站。
lncRNA測序分析：對mRNA表達量定量zoty中欧·(中国集团公司)官方网站Zoty中欧·(中国)体育官方网站，獲得差異表達、可變剪切、新轉錄本等信息；
對lncRNA/circRNA鑒定、篩選和定量熊猫体育【Panda】官方网站- Panda SPORTS意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站，展開差異表達分析和靶基因分析等信息意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!。

3.eQTL分析

将WGS 获得的候选致病位点/易感位点与RNA-seq 获得表达量信息进行eQTL 分析MK(体育科技有限公司)体育·官方网站，缩小候选致病/易感位点信息zoty中欧·(中国集团公司)官方网站MK(体育科技有限公司)体育·官方网站，挖掘基因突变-表达调控之间的网络关系MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!zoty中欧·(中国集团公司)官方网站，建立疾病发生发展相关的分子机制澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站。

eQTL分析
基本eQTL分析 1.順式eQTL分析 2.反式eQTL分析 3.eQTL注釋：（ENCODE注釋、GTEx注釋等) 4.eQTL聯合GWAS分析	差異eQTL分析（需要提供兩組以上樣本） 1.差異順勢eQTL分析 2.差異反式eQTL分析	eQTL和GWAS聯合分析 1.overlap分析結果 2.繪制曼哈頓圖 3.绘制locus Zoom图 4.與表觀組數據聯合分析	eGene富集分析 1.eSNP顯著富集區域分析 2.GO功能富集 3.KEGG通路富集 4.基因-疾病表型關聯分析 5.候選基因疾病相關性排序

動植物多組學

疾病多組學

癌症多組學

微生物多組學

轉錄調控和蛋白多組學

表觀遺傳

研究策略

樣本類型	DNA樣本	total RNA样本
樣本總量	＞0.8ug DNA（提取自新鲜及冻存样本）	＞1.0ug（mRNA文庫）
樣本總量	＞1.0ug（提取自FFPE樣本）	＞2.0ug（lncRNA文庫）
測序策略	Illumina PE150	Illumina PE150
數據量	30XMG不朽情缘·官方app网站有限公司官网Zoty中欧·(中国)体育官方网站意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!，90G raw data	6G mRNA/12G lncRNA raw data
項目周期	建庫測序分析80天

常見問題

1.eQTL分析可以研究哪些疾瞶oty中欧·(中国集团公司)官方网站。�
- 近年来许多科学家运用eQTL联合GWAS分析的方法澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站，寻找致病风险位点熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站Zoty中欧·(中国)体育官方网站MK(体育科技有限公司)体育·官方网站，这些联合分析的方法已应用在类风湿性关节炎、肾病、精神分裂等疾病的研究中MK(体育科技有限公司)体育·官方网站九游·会-(官网)真人游戏第一品牌zoty中欧·(中国集团公司)官方网站。

2.eQTL對非編碼區功能怎樣進行研究long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站九游·会-(官网)真人游戏第一品牌意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!？
- 通過eQTL分析九游·会-(官网)真人游戏第一品牌Zoty中欧·(中国)体育官方网站，可以解釋非編碼區基因突變與基因表達之間的調控關系long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网。系統的了解基因轉錄的調控機制澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站，構建基因表達調控網絡Zoty中欧·(中国)体育官方网站。

3.eQTL分析怎樣進行藥物處理前後反應的研究Zoty中欧·(中国)体育官方网站？
- 对药物处理前后的机体/细胞进行eQTL的差异分析九游·会-(官网)真人游戏第一品牌，可以很好的研究药物处理前后反应的差异zoty中欧·(中国集团公司)官方网站long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!，为寻找药物作用靶点MK(体育科技有限公司)体育·官方网站long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站，以及药物作用机制提供基因层面的证据MK(体育科技有限公司)体育·官方网站九游·会-(官网)真人游戏第一品牌Zoty中欧·(中国)体育官方网站。

4.怎樣利用eQTL分析進行人群隊列研究九游·会-(官网)真人游戏第一品牌zoty中欧·(中国集团公司)官方网站熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站？
- 在进行人群队列研究中MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网Zoty中欧·(中国)体育官方网站，可以进行eQTL分析九游·会-(官网)真人游戏第一品牌熊猫体育【Panda】官方网站- Panda SPORTS熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站，通过比较不同人群中eQTL的差异意昂4凯捷体育(中国)创新平台,注册畅享文化之梦!，充实人群队列研究结果long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站，寻找不同人群中基因差异与基因表达调控的关系long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站。

拓展材料

線上課程
【疾病多組學】GWAS&TWAS關聯分析
線上課程
【疾病多組學】eQTL&TWAS關聯分析

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