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基因組測序

16S、18S、ITS等擴增子測序(二代)

16S、18S、ITS等擴增子測序(二代) 一步到位检测环境微生物多样性

擴增子測序是對特定長度的PCR産物或捕獲的片段進行測序球客岛-足球篮球赛事直播平台beat·365(中国)-官方认证网站,分析序列中的變異沐鸣娱乐II(中国)官方平台资讯站_沐鸣娱乐2球客岛-足球篮球赛事直播平台人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网。
16S/18S/ITS等擴增子測序即通過提取環境樣品的DNAU8国际·[股份]有限公司官网,選擇合適的通用引物擴增16S/18S/ITS的目標區域沐鸣娱乐II(中国)官方平台资讯站_沐鸣娱乐2球客岛-足球篮球赛事直播平台,
通過檢測目標區域的序列變異和豐度人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网beat·365(中国)-官方认证网站球客岛-足球篮球赛事直播平台,以研究環境微生物多樣性及群落組成差異熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站沐鸣娱乐II(中国)官方平台资讯站_沐鸣娱乐2。
16S/18S rDNA为编码原/真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列OG视讯·(中国区)官方网站威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站。
ITS分爲兩個區域:ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之間人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网球友直播-球友直播app下载_球友直播app熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站,ITS2位于5.8S和28S之間球友直播-球友直播app下载_球友直播app。

應用方向

醫學領域:疾病與人體微生物間關系威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站,如代謝類疾病、消化類疾病、自身免疫性疾病、腫瘤癌症、神經類疾病及其他疾病等
環境領域:某一特定環境(霧霾、沙塵等汙染環境人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网沐鸣娱乐II(中国)官方平台资讯站_沐鸣娱乐2,住宅、商場等生活環境)的微生物群落組成熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站beat·365(中国)-官方认证网站人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网,有機肥發酵處理、汙水治理、石油降解、水體及海洋等微生物群落分布和組成等
畜牧領域:腸道、瘤胃等微生物與動物繁殖、生長發育、營養健康、免疫和疾病治療等的互作關系
農業領域:根際微生物與植物互作、農業耕作/施肥處理與土壤微生物群落等
生物能源:特殊功能的菌株、工程菌的開發
特殊極端環境:極端環境條件下的微生物類群研究

諾禾優勢

  • 1.读长长, 周期短, 性价比高

    采用 NovaSeq 6000 测序平台熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站。NovaSeq 6000 测序平台通量更高球客岛-足球篮球赛事直播平台beat·365(中国)-官方认证网站威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站,速度更快beat·365(中国)-官方认证网站OG视讯·(中国区)官方网站,运行时间更短威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,周期最短可达10天
  • 2.科學方案設計

    从材料选取beat·365(中国)-官方认证网站人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,建庫測序球客岛-足球篮球赛事直播平台OG视讯·(中国区)官方网站球友直播-球友直播app下载_球友直播app,到数据分析熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站, 每一步都需要科学、缜密的设计熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站,以保障高质量研究成果
    • 60人

      分析團隊
    • 9年

      項目經驗
    • 100000+

      結題項目
    • 1對1

      項目服務

信息分析

基于目标区域的测序熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,检测序列丰度熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站,以充分研究环境微生物多样性和群落结构差异性威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台OG视讯·(中国区)官方网站。除QIIME1流程外OG视讯·(中国区)官方网站威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站球友直播-球友直播app下载_球友直播app,诺禾还实现全流程QIIME2分析U8国际·[股份]有限公司官网,QIIME2中的插件DADA2可以修正测序错误U8国际·[股份]有限公司官网球友直播-球友直播app下载_球友直播app,注释更为精准威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站,且提供了多种可交 互式图形系统展示沐鸣娱乐II(中国)官方平台资讯站_沐鸣娱乐2熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站球客岛-足球篮球赛事直播平台,详细介绍见“QIIME2爲你而來
標准分析 解決問題
物種注釋 物種注釋及各物种丰度信息
α-多樣性分析 微生物群落的豐富度和多樣性
β-多樣性分析 不同樣本間的微生物群落
及各樣本差異情況
多元統計分析 尋找組間具有顯著差異的物種beat·365(中国)-官方认证网站,
同時可以比較組內差異和組間差異
的大小熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,判斷分組是否有意義
CCA分析 研究物種組成與環境因子間的關系
環境因子關聯分析
VPA分析
功能預測 預測樣本的功能組成

高級分析 解決問題
腸型分析 腸道菌准確定位和疾病預測和治療
貝葉斯網絡圖 判斷微生物之間、微生物和環境、
代謝物間的依賴關系
Source Tracker 樣本中微生物群落來源

送樣建議

樣本類型 建議送樣量 最低送樣量
土壤/汙泥/沈積物/腐殖質 3g 0.5g
水体滤膜(孔径 0.22-0.45μm/直径 3-4cm) 2張 1張
拭子 3個 1個
瘤胃液/發酵液/組織液(離心有明顯沈澱) 3mL人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,沈澱1g 1mL球客岛-足球篮球赛事直播平台OG视讯·(中国区)官方网站沐鸣娱乐II(中国)官方平台资讯站_沐鸣娱乐2,沈澱0.5g
糞便/腸道內容物 2g(小鼠 6 粒) 0.5g(小鼠 3 粒)
動物/人組織 1g 0.5g
血漿 3mL 1mL
鮮奶 20mL 8mL

常見問題

  • 1.16S測序哪個區域比較合適熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台?

    • 諾禾致源提供的几个测序区域来自文献调研熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站球友直播-球友直播app下载_球友直播app,但是目前并没有研究表明哪个测序区域更好人生就是博·AG尊时凯龙(中国区)集团官网。有文章研究表明土壤样本OG视讯·(中国区)官方网站U8国际·[股份]有限公司官网,16S V4区(515F-806R)比较适合做扩增子研究beat·365(中国)-官方认证网站威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,可检测的物种多样性更丰富沐鸣娱乐II(中国)官方平台资讯站_沐鸣娱乐2熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站, 并且可重复性强(PNAS. 2013. 110(16): 6548-6553.)OG视讯·(中国区)官方网站球友直播-球友直播app下载_球友直播app。
  • 2.若關注環境中的真核微生物多樣性沐鸣娱乐II(中国)官方平台资讯站_沐鸣娱乐2威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,ITS測序和18S測序哪個更好?

    • ITS測序主要是針對真菌多樣性的研究威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站,注釋准確度高;18S測序針對的是真核微生物威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站沐鸣娱乐II(中国)官方平台资讯站_沐鸣娱乐2球客岛-足球篮球赛事直播平台,注釋到的範圍廣威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站,但是就真菌來說精確度相對較低;可根據研究目的合理選擇測序方案熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台。
  • 3.擴增子與宏基因組的區別熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站球客岛-足球篮球赛事直播平台beat·365(中国)-官方认证网站?

    • 擴增子主要分爲16S、18S、ITS測序U8国际·[股份]有限公司官网,關注環境樣本中的物種組成球客岛-足球篮球赛事直播平台威·尼·斯·澳·门·人游戏网站官方版(中国)官方网站,該技術物美價廉球客岛-足球篮球赛事直播平台球友直播-球友直播app下载_球友直播app熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,實用性高熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站。宏基因組關注環境樣本中的物種組成、功能組成及代謝通路等信息沐鸣娱乐II(中国)官方平台资讯站_沐鸣娱乐2,該技術深入挖掘環境樣本功能層面的信息球客岛-足球篮球赛事直播平台熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站OG视讯·(中国区)官方网站。
  • 4.樣本送到公司球友直播-球友直播app下载_球友直播app熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站U8国际·[股份]有限公司官网,什麽時候可以拿到結果熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站?

    • 自樣本檢測合格之後開始計算周期熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台beat·365(中国)-官方认证网站,包括建庫、測序、數據分析、結題OG视讯·(中国区)官方网站。擴增子周期共計20個自然日beat·365(中国)-官方认证网站熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站沐鸣娱乐II(中国)官方平台资讯站_沐鸣娱乐2。

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