諾禾致源

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科技服務

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轉錄調控測序

宏轉錄組—捕捉微生態微環境活性微生物動態變化

  • 宏轉錄組測序:

    (Metatranscriptome Sequencing/ Metatranscriptomics)从整体水平研究特定环境中所有群体基因组转录情况和调控规律fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88熊猫体育-【中国区】官方平台网站杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口,以微生态微环境中全部RNA为研究对象熊猫体育-【中国区】官方平台网站, 结合高通量测序从转录水平研究复杂微生物群落变化意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台球友会-qy球友会-(中国)千亿球友会熊猫体育-【中国区】官方平台网站,挖掘发挥功能的活性基因U8国际·[China]有限公司官网意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88。
  • 全面高效:

    高通量全面捕捉微生態環境中所有生物轉錄本意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台,剖析微生物多樣性組成及動態變化U8国际·[China]有限公司官网MG不朽情缘·(中国版区)官方网站J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌,鑒定優勢物種與活性微生物K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口MG不朽情缘·(中国版区)官方网站,篩選活性功能基因MG不朽情缘·(中国版区)官方网站杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口。
  • 分析多樣:

    針對不同研究需要研發兩套分析流程U8国际·[China]有限公司官网。一套針對微生物多樣性與功能基因表達情況的分析;一套針對于微環境中病毒鑒定與功能的研究J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌。

應用方向

  • 醫藥領域

    病毒鑒定、人體微生物與疾病/癌症關系的研究、分子標志物和藥物靶點的鑒定與篩選等
  • 生態領域

    研究脅迫環境下微生物的機體響應機制
  • 工業領域

    微生物活性物質開發、生物能源、環境汙染監控與生物修複等

諾禾優勢

  • 1. 样本起始量低

    RNA 1μg/建库
  • 2. 周期快、分析全熊猫体育-【中国区】官方平台网站意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88,稳定性高

    诺禾宏转录组采用先进的Illumina平台测序意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台,并与高性能计算平台(High Performance Computing熊猫体育-【中国区】官方平台网站,HPC)结合熊猫体育-【中国区】官方平台网站杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台,实现快速、稳定的测序数据分析及交付球友会-qy球友会-(中国)千亿球友会MG不朽情缘·(中国版区)官方网站杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口。
    • ≤30

      樣本量
    • 60天

      項目周期
    • PE150

      測序讀長
    • ≥85%

      測序質量Q30
  • 3.質控嚴格熊猫体育-【中国区】官方平台网站,分析流程多樣

    诺禾宏转录组建库要求去除核糖体的方式提高有效数据占比U8国际·[China]有限公司官网,并采用主流软件Trinity进行后续分析K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口熊猫体育-【中国区】官方平台网站,针对不同需求配置高级分析... 从材料選取fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台,建庫測序杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口MG不朽情缘·(中国版区)官方网站,到数据分析MG不朽情缘·(中国版区)官方网站球友会-qy球友会-(中国)千亿球友会, 每一步都经过科学、缜密的设计fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88,以保障高质量研究成果意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口。

    材料選取

    RNA樣品
    ≥ 1 μg

    文庫構建
    普通文庫

    PE150測序
    5~10Gb

    信息分析

  • 4. 项目文章以及物种经验丰富

    諾禾致源已经成功完成对土壤/水体富集的菌体、淤泥、沉积物等多种微环境样本杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口,腸道內容物、拭子、糞便、体液、发酵物、食品等多种类型样本的宏轉錄組測序分析J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌。涉及物种包括人、 大小鼠、绵羊、牛、鸡、鱼、蜱虫、蜜蜂、珊瑚虫、蜘蛛、西洋参、油茶、矮紫衫、地衣、海绵等近百個物种MG不朽情缘·(中国版区)官方网站,助力客户在Microbiome等权威杂志发表多篇高水平文章fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口。“科学的方案设计MG不朽情缘·(中国版区)官方网站, 严格的质控管理杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口U8国际·[China]有限公司官网MG不朽情缘·(中国版区)官方网站,专业的分析團隊U8国际·[China]有限公司官网,丰富的項目經驗U8国际·[China]有限公司官网,优质的項目服務”杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口,确保每一個环节都能出色完成J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口,助力科学研究K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88球友会-qy球友会-(中国)千亿球友会。
    • 80人

      分析團隊
    • 7年

      項目經驗
    • 1000+

      結題項目
    • 1對1

      項目服務

信息分析

諾禾致源宏轉錄組測序项目MG不朽情缘·(中国版区)官方网站杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载熊猫体育-【中国区】官方平台网站,不仅进行基因表达情况分析熊猫体育-【中国区】官方平台网站意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台球友会-qy球友会-(中国)千亿球友会,还进行物种注释及分类分析熊猫体育-【中国区】官方平台网站,多样品间的比较分析等U8国际·[China]有限公司官网杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口。此外J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88,諾禾致源提供個性化分析的服务意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载MG不朽情缘·(中国版区)官方网站,可以根据客户需求定制分析內容杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口MG不朽情缘·(中国版区)官方网站。
WGBS 分析內容 解決問題
標准分析 數據過濾與質控 過濾掉低質量數據J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载,保證數據質量
Tinity拼接 測序數據拼接成長的轉錄本
Nr數據庫比對 注釋活性物種、挖掘優勢物種或差異物種、分類鑒定
功能注釋(GO、KEGG、eggNOG、CAZy) 物種與功能注釋
基因表達水平分析 進行定量與差異分析
GO富集、KEGG富集 核心基因GO杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌,KEGG功能富集分析

關聯分析

通过宏转录组与宏基因组、16s进行比较K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口球友会-qy球友会-(中国)千亿球友会,可以帮助我们了解DNA与RNA层面的共有与差异物种U8国际·[China]有限公司官网,挖掘活性微生物;与代谢组进行關聯分析杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载,挖掘活性物种或核心基因与代谢物之间的关系MG不朽情缘·(中国版区)官方网站杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台, 寻找相关代谢通路杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口。目前J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌球友会-qy球友会-(中国)千亿球友会杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口,由于微生物的多样性与复杂性fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88,依据课题建议选取关注的物种或基因群进行后续相关的分析U8国际·[China]有限公司官网J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌,諾禾致源可以提供相应的個性化分析服务杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口。

送樣建議

樣本類型 送樣量
total RNA 浓度:≥ 50ng/μL
体积:20μL ≤ V ≤ 120μL
总量:≥ 1μg
菌體/菌絲 ≥ 1*107
≥ 0.5
新鮮植物組織幹重 ≥ 0.8
新鮮動物組織幹重 ≥ 0.5
糞便 ≥ 1g杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口,建议3g
腸道內容物 0.5-1g
活性汙泥/淤泥/沈積物類 10-15mL(約4-5g沈降物)
土壤 ≥ 2g(建议富集菌体沉淀)

常見問題

  • 1.宏轉錄組一般推薦多少數量?

    • 糞便或腸道內容物U8国际·[China]有限公司官网fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88MG不朽情缘·(中国版区)官方网站,推荐5G数据量;
      環境類樣本比如土壤、水體MG不朽情缘·(中国版区)官方网站fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88,推薦10G數據量;
      組織類等宿主占比較高的樣本J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口,推薦至少10G數據量杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌。
      建議根據研究目的來選擇數據量杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口球友会-qy球友会-(中国)千亿球友会。
  • 2.宏转录组生信分析內容中包括物种注释及差异基因分析吗J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口?

    • 包括fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88。在我们的標准分析流程中杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口,包括物种注释及差异基因的分析內容杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口MG不朽情缘·(中国版区)官方网站,以及物种与基因两個维度的功能注释杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口MG不朽情缘·(中国版区)官方网站。同时MG不朽情缘·(中国版区)官方网站K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口,根据不同的分析需求杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载,諾禾致源还推出针对于病毒的宏病毒组 分析內容熊猫体育-【中国区】官方平台网站U8国际·[China]有限公司官网,包括已知病毒的鉴定和分析U8国际·[China]有限公司官网MG不朽情缘·(中国版区)官方网站杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载。另外杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载熊猫体育-【中国区】官方平台网站,针对不同研究方向K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口,諾禾致源也提供個性化分析的服务杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载。
      諾禾致源拥有专业的设计方案、严格的质控管理杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口U8国际·[China]有限公司官网,专业的分析團隊杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载MG不朽情缘·(中国版区)官方网站U8国际·[China]有限公司官网,丰富的項目經驗杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口球友会-qy球友会-(中国)千亿球友会,优质的項目服務U8国际·[China]有限公司官网意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台MG不朽情缘·(中国版区)官方网站,确保每一個环节都能出色完成J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88,助力您的科学研究J9九游|会(中国)最新J.9官网网站-真人游戏第一品牌。

拓展材料

  • 收藏好文

    宏轉錄組揭示微環境群落優勢物種及表達圖譜
  • 線上課程

    源聚于新-宏轉錄組在微環境中的分析應用與數據挖掘

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