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分子育種

定制化液相芯片

定制化液相芯片

  • 液相芯片産品針對目標區域合成出特異性探針熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口,通過探針與基因組DNA的液相雜交意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台,實現對目標區域序列的特異性捕獲、富集尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长。對捕獲到的片段進行高通量測序MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长,可以對候選基因或候選位點進行高深度靶向檢測尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口,精准分型球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐。結合參考基因組和表型信息MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」,可實現育種性狀的高效富集澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站,優秀單株的精准篩選意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站。
    分子育種中MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台,科学家和育种家们借助简单高效的技术对优秀育种群体进行基因分型熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版,从而进行更为高效、精准的选育熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐。随着二代测序数据的积累澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台,需求逐渐由全面获得群体遗传信息转向精准高效检测靶向位点熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」。諾禾致源自主研发的商业化NGP液相芯片(Novogene Germplasm resource screening panel)紧跟育种4.0时代脚步尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」,作为生物育种前期基因分型的重要工具将为国家粮食安全根基注入新的动能球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口,作出新的贡献尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站。

設計思路

  • NGP液相芯片基于諾禾致源分子育種业务线功能基因挖掘&育种标记筛选分析体系和多因素控制探针设计方案尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」,对目标区域进行探针设计意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版。探针使用链霉素标记的NTP为合成原料意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长,制备出的特异性探针能够与目标基因组文库进行液相杂交澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台,杂交完成后使用链霉亲和素磁珠来结合探针及目标区域文库的杂交产物MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站。将捕获得到的目标区域文库富集后熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台,使用二代测序平台进行高通量测序可检测目标区域的变异尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐。

項目經驗

  • 諾禾致源以严谨的设计流程、严格的开发指标、成熟的检测技术铸就短周期、低成本、高精度的NGP育种芯片尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」,目前諾禾致源成功对覆盖畜牧、 水产、作物等三十余个物种进行探针设计合成澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」,为十余家科研单位提供了一站式液相芯片定制化服务熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台。

FAQ

  • 1 关于覆盖度与均一度的问题

    • 覆盖度表示测序数据对于目标区域的覆盖情况;均一度表示各位点的实际测序深度偏离平均测序深度的情况U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」, 一般以达到平均测序深度20%的区域占覆盖区域的比例为衡量标准球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口。影响覆盖度和均一度的因素主要包括:

    • 1)探针设计:设计报告会明确探针覆盖的目标区域(probeCov.bed)及探针未覆盖的目标区域(probeMissed.bed)U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」, 探针覆盖目标区域实际覆盖度一般可以达到99%以上意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长。探针设计方案能够充分考虑客户对于目标区域的个性化需求澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」, 实时改进算法澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站,保证为客户提供高质、高效的Panel尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐。探针设计过程中意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台,会对目标序列进行热力学稳定性评估球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站,并对 热力学稳定性低的区域进行剂量补偿意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」。GC含量会对探针的结合能力以及PCR扩增过程产生较大影响意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐,諾禾致源采用精 细的GC含量分级策略合成探针尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口。通过调整不同GC含量区域的探针比例澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站,对目标区域进行高度均一地覆盖意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口。此外尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长,诺禾 致源探针设计方案能够充分考虑重复序列区域的覆盖度熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台,按照序列在基因组中的重复程度分级尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,独立制备并实时调控 探针浓度意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」,以达到数据覆盖度、均一度与捕获效率的平衡U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长。

    • 2)样本类型与样本质量:提取得到的gDNA总量应在200ng以上尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站,浓度25ng/μL澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版,主条带完整无明显降解尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版,无蛋白或其 他杂质污染熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长。低质量gDNA(如FFPE样本提取得到的 DNA)及游离DNA通常存在总量不足、降解断裂严重等问题意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版,会影响覆盖度和均一度意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站。

    • 3)实验室环境及实验流程:实验室应保持洁净澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站,实验室所用仪器设备、耗材、所配试剂应符合PCR实验室标准球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长。实验人 员应严格按照SOP规程完成实验MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站,实验过程中各项质检数据应达到SOP所示要求MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长。样本DNA起始投入量是影响均一度的重 要指标MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长,諾禾致源建议gDNA投入量为200ng尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,cfDNA投入量为20ng以上MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口。文库构建与杂交捕获中PCR的循环数过多U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长,会因 PCR偏好性带来均一度降低的可能;文库纯化过程中乙醇残留未晾干意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」,会影响文库片段的回收效率MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台,进而影响覆盖度和 均一度;不同质量样本混合杂交同样会对数据指标有一定影响熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台。另外尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版,上机测序过程中意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站,测序仪对于重复序列区域会呈 现出所测碱基质量下降的现象熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站,这会造成分析过程中过滤到较多的数据尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,这种情况会导致重复序列区域(例如MSI区域) 覆盖深度较低或覆盖不完全意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」。

    • 4)生物信息分析:分析下机数据时首先应确定所使用的参考基因组及目标区域bed文件是否正确熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」。对于高度同源序列澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站, 受制于二代测序读长较短的原因澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站,所测序列可能无法准确比对到基因组上尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版,导致reads被过滤进而影响覆盖度和均一度尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站。

    • 5)目标区域序列及目标基因:諾禾致源对于GC含量异常区域及重复序列区域设计均进行了特殊安排并优化了设计方案尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐, 但对于目标基因的这些区域尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,仍然可能出现覆盖度低、测序深度低等情况熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台。另外球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐,目标区域基因缺失(例如GSTM1基因) 或目标区域基因区分性别(例如:SRY基因)可能会导致个体样本覆盖度降低熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台。目标区域存在插入缺失突变(Indel)、 结构变异(SV)、微卫星不稳定(MSI)位点球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长,同样可能造成捕获reads数减少意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台,测序深度较低澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口。

  • 2 关于捕获效率

    • 1)在液相探针杂交捕获测序中球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口,捕获效率用来描述探针杂交的特异性意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长,是指落在目标区域的序列占比对到基因组上的序列 的比例意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」,与脱靶率呈现相反的关系澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站。此数据指标可用reads捕获效率和bases捕获效率两种方式表示尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版。在探针序列设计过程 中澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」,諾禾致源充分考虑探针序列与非目标区域的相似程度澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长,避免探针序列与非目标区域有较多序列的匹配意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」。另外尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口,探针序 列会尽量避开基因组中的高拷贝序列意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」,避免在杂交反应中与高拷贝序列的结合意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口。对于捕获效率的影响因素尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站,除了上述提到 的样本质量、实验室环境及实验操作、分析流程、目标区域GC含量、重复序列等影响因素外球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版,我们又总结了包括实验流程 及信息分析等方面可以影响捕获效率的因素尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」,具体如下:

    • 2)实验室所用仪器、耗材有核酸酶残留U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台,会影响DNA与文库的回收效率尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,进而影响捕获效率澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站。諾禾致源所设计探针为RNA探 针熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台,应保存与-80摄氏度球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站,以免影响探针使用效果尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版。

    • 3)諾禾致源要求文库构建后片段长度为270bp-320bp意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」,如果文库插入片段过长尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台,会导致捕获效率降低意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」。

    • 4)文库浓缩时应避免过度干燥造成文库损失澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站,杂交过程中球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口,应按照SOP投入足量的探针和相应Blocker以保证捕获效率U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」。杂 交温度控制应严格按照SOP所述在PCR仪中进行MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」,杂交时间应控制在16h-24h之间熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站。捕获磁珠与杂交产物结合时意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐,应在PCR仪 上操作MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐,避免杂交产物冷却造成捕获效果不佳尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长。

    • 5)雜交後漂洗體系的嚴謹性是影響捕獲效率的又一個重要因素尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站,漂洗過程能夠去除非特異性雜交澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站,此步溫度控制仍然十分重要澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站。

    • 6)Post-PCR過程體系中帶有捕獲磁珠尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」,實驗過程中應盡量將體系混合均勻並盡快置于PCR儀上反應尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」,避免磁珠黏連或沈降導致目標區域有效文庫量減少熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长。

    • 7)在計算reads/bases捕獲效率時意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口,首先應考慮目標區域是一段連續的序列還是單個位點熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口,如果目標區域僅是單個位點尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,以bases的捕獲效率來衡量探針效果顯然不夠准確尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版。另外熊猫体育【中文官方】网站 - 最全赛事直播平台澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」,在考量捕獲效率時是否去除Duplication序列尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,也應考慮在內意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐。

    • 8)目標區域大小是決定捕獲效率的重要因素意昂凯捷4凯捷(中国)官网「强保障平台,更省心娱乐」尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版,通常情況下尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站,目標區域越大尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版意昂体育·科技赋能场景,更省心娱乐,探針能夠結合的文庫片段就會越多MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长,捕獲效率就會相應提升澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长。相反MG不朽情缘·(官网)追求健康,你我一起成长尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口,目標區域如果太幸獍禾逵た萍几衬艹【,更省心娱乐尊龙官方网站官网入口-人生搏中国官网入口。东@效率通常會一定程度降低U8国际「强保障平台,让娱乐更有趣!」尼斯人app官网版下载尼斯人app官网下载官方版(官网)下载最新版球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口。

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