DSP空間轉錄組/蛋白质测序——空间自定义区域转录组/蛋白质表达检测

• 全面

  GeoMx Digital Spatial Profiler（DSP）是NanoString Technologies推出的新一代空间多靶标分析系统星空·体育(中国集团)官方网站澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站，结合了组织影像分析和测序定量技术澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长，实现人和小鼠组织切片上18,000多种编码基因和140多种蛋白的定量分析澳·门人威·尼·斯·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台。

技術路線

• 组织样本贴片后MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站，利用DSP Oligo 标记探针/抗体和免疫熒光標記抗体对样本孵育；再通过显微扫描获取的荧光标记图像熊猫体育【Panda】官方网站- Panda SPORTS意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台星空·体育(中国集团)官方网站，用于圈选感兴趣的区域（Region of Interest ROI）；用UV光解每个ROI的DSP barcode（该barcode与基因是唯一对应关系）澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站，或对ROI内不同荧光标记区域分割后意昂体育·[官方网]有限公司官网球友(官方)App下载-球友直播熊猫体育【Panda】官方网站- Panda SPORTS，再光解 DSP barcode澳·门人威·尼·斯·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版，实现基因表达水平定量澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台918博天堂(中国区)-官方网站。

  切片

  

  質控

  

  染色成像

  

  探針雜交

  

  建庫測序

  

  數據分析

  

定量試劑

• 靶点特异性互补序列/抗体通过光可切割连接子与DSP barcode连接杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版澳·门人威·尼·斯·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版。利用UV照射ROI释放并收取探针/抗体上的DSP barcode澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站星空·体育(中国集团)官方网站。由于DSP barcode与基因是唯一对应关系MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长，对收集的barcode序列建庫測序杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版，即可获取对应基因及其表达信息星空·体育(中国集团)官方网站。

DSP 转录组探针

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  	物種	基因/通路
  Core	人	CD45、Ki-67、Beta-2-microglobulin、CD31和6个 controls
  	小鼠	CD45、Ki-67、CD31、GFP和6个 controls
  Module (14个)	Immune Cell Typing、IO Drug Target、Immune Activation Status、Pan-Tumor、Cell Death、 PI3K/AKT Signaling、MAPK Signaling、Myeloid、Neural Cell Typing、Alzheimer’s Disease Pathology、Alzheimer’s Disease Pathology Extended、Parkinson’s Disease Pathology、Glial Cell Subtyping、Autophagy
  人和小鼠

免疫熒光標記

• DSP仪器支持4种荧光标记抗体染色成像（含核DNA荧光染料syto13）熊猫体育【Panda】官方网站- Panda SPORTS杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版。諾禾致源可提供PanCK、CD45、Iba1和Beta amyloid、 Syto13 (DNA) 等荧光标记抗体杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版星空·体育(中国集团)官方网站，同时支持客户自行购买适用于免疫熒光標記的直标抗体澳·门人威·尼·斯·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版。

  Channel	Excitation (peak/bandwidth)	Emission (peak/bandwidth)	Emission (peak/bandwidth)	Suggested Fluorochromes	Alzheimer
  FITC/525 nm	480 /28 nm	516/ 23 nm	Syto13 (DNA)AF488	DNA
  Cy3/568 nm	538/ 19 nm	564/ 15 nm	AF532、PE Syto83 (DNA)	PanCK	Iba1
  Texas Red/615 nm	588/ 19 nm	623/ 30 nm	AF594	CD45	Texas Red/615 nm
  Cy5/666 nm	645/ 19 nm	583/ 30 nm	AF647 Dylight 650

圈選方式

• DSP平台根据研究目的选择任何感兴趣的组织区域（region of interesting, ROI）检测RNA或蛋白质表达水平澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站。DSP平台提供多种ROI的选择方式：几何圈选、分割圈选、散在细胞类型圈选、等高线圈选、网格圈选杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版澳·门人威·尼·斯·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版。

信息分析

• 数据经过严格質控澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站球友(官方)App下载-球友直播意昂体育·[官方网]有限公司官网，采用NanoString官方推出的分析流程MG不朽情缘·(China)追求健康,你我一起成长星空·体育(中国集团)官方网站，完成ROI 差异表达分析和功能富集分析等内容意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站，确保数据分 析准确性和可靠性杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版。

  分析內容
  數據截取與比對	樣本一致性
  样本質控	差異表達基因分析
  探针質控	GO富集分析
  數據歸一化	KEGG 富集分析
  聚類/降維	Reactome 富集分析

  

應用方向