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基因組測序

16S、18S、ITS等擴增子測序(二代)

物種豐度柱形圖

根據物種注釋結果意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAce,選取每個樣品在各分類水平(Phylum、Class、Order、Family、Genus)上最大豐度排名前10的物種OG视讯·(中国区)官方网站beat·365(中文)-唯一官方认证网站PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAce,生成物種相對豐度柱形累加圖意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAce,以便直觀查看各樣品在不同分類水平上PG·电子(中国大陆)官方直营网站U8国际·[集团]有限公司官网,相對豐度較高的物種及其比例U8国际·[集团]有限公司官网MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports。

物種豐度聚類熱圖

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主成分分析

  • ( PCAU8国际·[集团]有限公司官网PG·电子(中国大陆)官方直营网站,Principal Component Analysis )

是一種應用方差分解方法PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAceU8国际·[China]有限公司官网,對多維數據進行降維PA视讯(中文站) - 官方网站PlayAceMK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光,從而提取出數據中最主要的元素和結構OG视讯·(中国区)官方网站官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心。應用PCA分析PG·电子(中国大陆)官方直营网站意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光,能夠提取出最大程度反映樣品間差異的兩個坐標軸OG视讯·(中国区)官方网站,從而將多維數據的差異反映在二維坐標圖上PA视讯·(中国区)官方网站 - Play官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心,進而揭示複雜數據背景下的簡單規律PG·电子(中国大陆)官方直营网站MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心。如果樣品的群落組成越相似beat·365(中文)-唯一官方认证网站U8国际·[集团]有限公司官网PA视讯·(中国区)官方网站 - Play,則它們在PCA圖中的距離越接近OG视讯·(中国区)官方网站官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心。

LEfSe分析

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T-test組間物種差異分析

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針對有分組的項目U8国际·[China]有限公司官网beat·365(中文)-唯一官方认证网站,可以通過群落結構差異統計分析進行深入研究U8国际·[China]有限公司官网,爲了尋找各分類水平(Phylum、Class、Order、Family、Genus、Species)下OG视讯·(中国区)官方网站U8国际·[China]有限公司官网意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光,組間的差異物種意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心,做組間的T-test檢驗MK体育(MKsports集团)股份公司 - Mk Sports官网- 杏鑫平台 | 帐号ID注册 - 会员登陆中心,找出差異顯著(p值<0.05)的物種OG视讯·(中国区)官方网站PA视讯·(中国区)官方网站 - PlayU8国际·[China]有限公司官网。

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