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遺傳圖譜

群體SNP檢測及注釋

意昂体育app下载安装官网 SNP檢測及注釋結果統計

Category		Sub Group...
Upstream		203,062
Exonic	Stop gain	2,142
	Stop loss	564
	Synonymous	247,194
	Non-synonymous	167,809
Intronic		321,306
Splicing		1,471
Downstream		189,867
upstream/downstream		51,199
Intergenc		986,703
ts		1,256,052
tv		915,265
ts/tv		1.372
Total		2,171,317

SNP標記開發

1. 亲本间差异SNP分布
基于對2個親本檢測的SNP意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTS熊猫体育app下载安装（China）认证体育赛事直播平台，對其進行比較kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站CQ9(电子中国)在线官方网站意昂体育·(China)体育官方网站-EON SPORTS，查找2個親本間差異的SNP；差異SNP在全基因組及外顯子區域的分布如下圖所示DB娱乐官网入口(中国大陆)有限公司官网。
2. 亲本间标记开发
基于親本基因型檢測結果CQ9(电子中国)在线官方网站PA视讯(中国区)官网 - PlayAce熊猫体育app下载安装（China）认证体育赛事直播平台，進行親本間多態性標記開發long8·龙8(国际版)头号玩家唯一官方网站。過濾掉親本信息缺失的位點；根據作圖群體類型DB娱乐官网入口(中国大陆)有限公司官网杏鑫平台|杏鑫娱乐-杏鑫登录-杏鑫官方平台，篩選符合群體類型的多態性的位點澳·门人威·尼·斯·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版。
3. 子代基因分型
完成親本間標記開發後熊猫体育app下载安装（China）认证体育赛事直播平台long8·龙8(国际版)头号玩家唯一官方网站，提取所有子代在親本多態性標記位點的基因型DB娱乐官网入口(中国大陆)有限公司官网。部分子代在個別標記位點的基因分型結果如下表long8·龙8(国际版)头号玩家唯一官方网站。

子代基因分型

Chr	Position	Ref	P1	P2	R001	R002	R003	R004	R005
chr1	231,569	C	TT	CC	CC	CC	CC	CT	TT
chr1	251,190	C	GG	CC	CC	CC	CC	CC	GG
chr1	251,280	C	TT	CC	CC	--	CC	--	--
chr1	255,797	A	TT	AA	AA	AA	AA	AA	TT
chr1	256,357	C	TT	CC	--	--	CC	--	--

遺傳標記篩選

篩選高質量的遺傳標記

對分型後的子代標記進行篩選CQ9(电子中国)在线官方网站kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站意昂体育·(China)体育官方网站-EON SPORTS，通過異常堿基檢查、完整度過濾、偏分離標記過濾等步驟澳·门人威·尼·斯·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版，篩選出高質量的遺傳標記進行後續連鎖分析PA视讯(中国区)官网 - PlayAceCQ9(电子中国)在线官方网站。

遺傳圖譜构建

篩選高質量的遺傳標記

对于筛选出的高质量遗传标记进行两两位点间重组率的计算、评估遗传距离、划分连锁群澳·门人威·尼·斯·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版意昂4凯捷·(中国区)体育官方网站-EON SPORTS，对每个连锁群上的标记再进行排序long8·龙8(国际版)头号玩家唯一官方网站澳·门人威·尼·斯·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版杏鑫平台|杏鑫娱乐-杏鑫登录-杏鑫官方平台，最终得到高质量的遺傳圖譜DB娱乐官网入口(中国大陆)有限公司官网。