黃麻（Corchorus sp.）澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰，一年生草本植物熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTSlong8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2，是最重要的韌皮纖維作物PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站，全球第二大天然纖維材料long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站，占全球韌皮纖維的80％PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME，僅次于棉花（Gossypium sp.）沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2。黃麻具有許多優良的農藝性狀杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站，世界範圍內對黃麻需求也日漸增加long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS，但分子水平上對黃麻的了解確知之甚少杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME，這使黃麻的遺傳改良具有局限性澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2。

近日long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站，中國农科院麻类研究所、北京諾禾致源科技股份有限公司联合新加坡南洋理工大学以及新加坡国立大学long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME，在国际期刊 The Plant Journal 杂志上发表了题为“Multi-omics provides new insights into the domestication and improvement of dark jute （Corchorus olitorius）”文章PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2。通过基因组、转录组、表观修饰组联合分析的手段揭示了黄麻的驯化历史QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网，并通过全基因組關聯分析发现黄麻11个重要性状的候选位点杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰。该研究为黄麻未来的耐盐等抗逆性和纤维育种提供了宝贵的遗传资源澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME，而且對回顾早期作物育种的遗传基础具有重要意义沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2。

沐鸣2-科技赋能场景,让娱乐更有趣!·(中国区)沐鸣2-科技赋能场景,让娱乐更有趣!-文章亮點

1. 通过Nanopore long readsQY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网，10X Genomics sequencing以及 chromatin conformation capture （Hi-C） 多种测序技术组装了黄麻染色体版本的基因组杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站，为黄麻基因组学研究提供参考序列杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载。

2. 通过整合分析基因组、转录组、MicroRNA组和表观修饰组学数据发现C. olitorius 驯化和改良两个育种阶段的主要遗传变化QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网，并揭示土壤盐度差异介导了驯化过程中环境适应性的选择沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2。

3. 對11个重要农业性状进行GWAS分析杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰，发现一系列与黄麻纤维产量和质量性状相关的重要调控位点PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMEkg体育官网视讯(中文站) - 官方网站，并且发现在黄麻的育种改良过程中kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站，有利单倍型被选择和保留下来QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载，这将直接提高黄麻纤维的质量和产量沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站。

技術手段

Illumina PE sequencing、Oxford Nanopore Technology sequencing、10X Genomics sequencing、Hi-C sequencing、whole-genome bisulfite Sequencing、RNA Sequencing、N6-methyladenosine sequencing和MicroRNA sequencing杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰。

研究結果

1 基因組組裝和比較基因組分析

該研究聯合使用Nanopore long reads （111.02 Gb）澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰， 10X Genomics （10XG） sequencing （94.72 Gb）以及 chromatin conformation capture （Hi-C） （48.24 Gb） 多种测序技术對黄麻耐盐品种 C.olitorius 的基因组进行测序、组装以及注释long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2。获得了411.26 Mb 染色体版本的基因组QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰，Contig N50为4.13 Mb熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站， BUSCOs评估基因组完整度为99.34%杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网，LAI评估指数为14long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站，QV值40.83PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME，超过了脊椎动物基因组计划（VGP）标准的QV40 （圖1a）kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS。这些指标说明新组装的基因组具有很好的完整性和准确性杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS，可作为黄麻基因组学研究的参考序列沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站。通过构建13种植物的最大似然树對黄麻适应性进化中的基因家族扩张和收缩进行评估熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS。C. olitorius 和C. capsularis 之间的分化时间约为16.5 Mya（95%置信区间：4.7-31.0 Mya）（圖1c）杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载，共发现77个基因家族在黄麻祖先中经历了扩张PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版。在C. olitorius 中发现了228个基因家族扩张杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载，包含2351个基因澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网，主要富集于五个核苷酸修复相关途径和氧化-还原途径PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站。这些结果表明kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME，扩张的基因家族通过快速的DNA修复和清除活性氧（ROS）杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站，增强黄麻對非生物胁迫的抵抗力long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS。

圖1 C. olitorius染色體水平的基因組組裝和進化

2  種群結構、遺傳多樣性和馴化曆史

通过對中國、孟加拉、印度和非洲收集到的256个种质进行重测序分析熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版，共获得1.55 Tb高质量序列long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站，包括2,812,688高置信度双等位SNPPA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME，其中100,276 SNP导致75.8%蛋白编码基因的改变杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS，非同义突变与同义突变的比列为1.09. 该基因组变异圖谱的构建为黄麻的分子育種提供了丰富的遗传资源杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版。通过neighbor-joining tree澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2，PCA和Bayesian clustering 對黄麻的种群结构进行分析熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载。结果一致显示野生材料、地方品种和栽培品种之间存在可识别的遗传结构差异 （圖2a）QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站。野生品种、地方品种和栽培品种的平均遗传多样性（θπ）为1.6×10-3PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMElong8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰，1.3×10-3和0.8×10-3（圖2c）杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版。表明在C. olitorius 的繁殖过程中熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTSPA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰，驯化和改良导致了低的遗传多样性long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS。對连锁不平衡（LD）衰减率的估计也显示QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网，与陆生品种（47.1 kb）和野生品种（20.6 kb；圖2d）相比PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰，栽培品种的LD值（58.5 kb）更高PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站。这进一步说明在人工选择过程中发生了相對较高的近亲繁殖澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载，因此QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰，栽培品系的重组事件较少杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS，等位基因频率谱偏斜较小澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站。此外杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版， F ST 值显示long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2，栽培品种和地方品种（0.094）之间的关系更密切（圖2c）杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载，这说明在黄麻的育种改良过程中的遗传瓶颈比驯化过程中更温和熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰。为了进一步解析C. olitorius 的驯化历史QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME，应用SMC++来共同推断三个不同种群的动态历史和分化时间熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTSlong8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME。结果表明沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME，C. olitorius 的野生品种和驯化品种在2000-3000年前发生分化PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME。在经历了最初的驯化瓶颈后kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载，驯化种群的数量开始迅速增加沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME，这支持了Sarkar等人关于C. olitorius 驯化历史较短的研究结论沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME。此外PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME，作者发现C. olitoriu 栽培种具有较低的θπ和较高的F ST 值澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网，考虑到C. olitorius 的驯化期相對较短long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站，一个合理的解释是PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTSPA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰，低水平的集中育种导致没有广泛适应的品种作为主要的育种品系熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS，这不利于形成具有固定有利群体等位基因频率的栽培品系沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网。总的来说PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2，C. olitorius 可能是一个正在进行早期驯化的理想育种模式的物种杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载。

圖2 C. olitorius 種群的遺傳結構和馴化曆史

3 選擇基因的鑒定以及基因組關聯分析

作物育種通常經曆馴化和改良兩個重要階段沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2。爲了確定黃麻在這兩個育種階段的潛在選擇基因杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站，應用XP-CLR和F ST 進行分析kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站。共有2092個基因在馴化過程中被選擇（即馴化基因）熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载，3209個基因在改良過程中被選擇（即改良基因）杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2，只有160個共享基因杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站。這反映了兩個育種階段在基因組重塑方面的巨大差異杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME。對11個重要農藝性狀進行GWAS分析熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS，共鑒定到7熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS，602個與之關聯的SNPs位點熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站。

4 多組學聯合分析揭示盐胁迫适应性的遗传机制

在C. olitorius 的进化过程中杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站，扩张的基因家族在其环境适应性方面发挥重要作用PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰。其中132个驯化的基因属于扩张基因家族杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版，主要富集于三个抗逆相关的代谢通路PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载。并且发现与盐害指数相关的GWAS基因更多与扩张和驯化有关kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站，这说明土壤中盐分的差异介导了环境适应性的选择沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网。

對250 mM盐胁迫处理下的C. olitorius 两个种系 TC 和NY/252c （NY） 进行转录组和表观组分析杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载，发现38.71%（910/2kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS，351）的扩张基因和72.99%（1澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站，527/2long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站，092）的驯化基因有明显的表观修饰和/或转录水平差异杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2，142个扩张基因在C. olitorius两个品系中上调表达沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站，其中24个基因在mC-差异甲基化区域显著下调PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMEkg体育官网视讯(中文站) - 官方网站，并且这142个基因主要富集于5个植物应對非生物性胁迫的代谢通路中熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载。其中超过一半的扩张-驯化基因具有表观或者转录水平的差异杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME，例如澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站，COS01g_00440在两个材料中均表达上调、外显子m6A修饰上调同时被两个上调的miRNAs （PC-5p-3280_3996 和mtr-MIR2592ay-p5_2ss6AG17CG） 靶标杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版。这些结果表明PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME，在基因家族驯化过程中QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网，经历进化的基因具有明显的表观遗传和转录表达变化杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载，可能在植物盐胁迫适应性的形成中发挥重要作用PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站。而基因及其调控序列的表观遗传学修饰或编辑可能促进植物耐盐性的分子育種QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS。

5 抗壞血酸代謝和脫落酸信號途徑基因與黃麻的耐鹽性相關

在GWAS基因中沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2，有两个上调的基因（COS05g_02894 和COS04g_00516 ）属于L-抗坏血酸过氧化物酶（APX）基因家族和一个单脱氢抗坏血酸还原酶正交物COS04g_00816 都可参与抗坏血酸盐代谢途径杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载，来清除ROS（圖3a和3b）PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMEQY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网。并且转录组数据同样发现在TC和NY品系中上调的基因促进了抗坏血酸盐代谢通路循环：首先上调的COS05g_02894 和COS04g_00516 高表达APX催化酶加速H2O2的清除kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网，而底物抗坏血酸盐被氧化成单脱氢抗坏血酸盐沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2，m6A修饰的上调基因COS04g_00816 编码单脱氢抗坏血酸还原酶促进单脱氢抗坏血酸盐还原成抗坏血酸盐QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载，从而加速了抗坏血酸盐代谢通路循环QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网，促进了H2O2清除沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2。根据以上结果推测黄麻可通过抗坏血酸循环途径清除ROS澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME，促进渗透调节和水的有效利用PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME，从而提高了耐盐性熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTS杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2。

TC和NY品系中有31个差异表达基因在ABA合成途径显著富集（圖3c和3d）QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网，其中包括一个与AISH性状关联的基因COS01g_00888沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰，并且该基因具有m6A甲基化修饰kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站，和一个驯化基因COS02g_01244（圖3c）杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版，说明这些基因在黄麻盐胁迫适应中起到关键作用long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME。

圖3 GWAS分析黃麻耐鹽性相關基因

6黃麻育種改良過程中選擇的基因

株高（PH）和茎粗（STD）是与纤维产量相关的重要育种改良性状kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站。GWAS分析结果显示与该性状相关的基因为遗传改良的基因而非驯化的基因杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载。對于PH性状澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版，在两个环境中发现了一个150 kb的关联峰PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMEQY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站，在改良过程中杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版，它在一个选择消除区域显示了强关联性（圖4a）杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME。在该区域包括一个auxin-responsive small auxin upregulated RNA （SAUR） proteinlong8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME， COS05g_03104杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰，共检测到五个基于三个SNPs的单倍型熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTSPA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版，这三个SNPs位于其上游1kb处 （圖4b）PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网，其中hap2与生长素响应的SAUR蛋白相关kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网，在黄麻育种中可诱导茎秆伸长澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰。對于STD性状沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMElong8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站，在7号染色体处鉴定到两个与生长素相关的受选择的候选基因COS07g_00652 和COS07g_00653long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站，可通过快速响应生长素的变化参与植物茎秆增粗QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版，该候选基因可提高黄麻抗倒伏性PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版。这些结果表明QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网，在黄麻的育种改良过程中杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载，与PH和STD有关的有利单倍型被选择和保留下来杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载。这将直接提高黄麻纤维的产量澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站。

圖4 PH和STD性狀的重要關聯區域和基因

7 黃麻纖維質量和産量相關的基因鑒定

黃麻的纖維産量和品質性狀具有較高遺傳率PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME。在GWAS结果中杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站，鉴定到一个与纤维品质性状FSTR相关的基因PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰，COS06g_03266主要参与甘露糖途径和一个纤维产量性状FBT的候选基因COS07g_01200long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME，为拟南芥WRKY21的同源基因PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2。并且发现与FSTR关联的信号主要分布在6号染色体的49沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME，122PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME，756到49PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载，566澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMEPA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰，025区域QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMEPA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰，占所有关联信号的69.39%kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载，这意味着该区域可能是纤维品质育种的热点区域（圖5a）QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网。對COS07g_01200的单倍型进行表达量分析PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME熊猫体育Panda【官方网站】- Panda SPORTSPA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰，发现COS07g_01200可正调控黄麻FBT性状PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版long8·龙8·(国际版)头号玩家唯一官方网站。这些发现为黄麻纤维品质和产量的早期育种提供了分子证据kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站，为分子标记选择和黄麻遗传改良操作提供可靠的目标QY球友会·QY千亿球友会·QY球友会体育官网沐鸣娱乐II（中国）官方平台资讯站_沐鸣娱乐2，从而满足未来纤维育种的需要PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAME。

圖5 與FBT性狀顯著關聯的區域和基因

該研究由國內外多家單位研究人員共同協作完成PA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰。中國农科院麻类研究所杨泽茂kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站，戴志刚PA电子官方-游戏试玩|PLAYACE GAMEPA视讯(亚洲区)官方网站-PlayAce AG旗舰kg体育官网视讯(中文站) - 官方网站，北京諾禾致源科技股份有限公司研发与合作中心首席科学家田仕林研究员和高级生信工程师李祥孔杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载，南阳理工大学颜安为该论文的共同第一作者杏耀平台娱乐注册(全站)登录入口手机APP下载澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)官方网站。中國农科院麻类研究所粟建光研究员和北京諾禾致源科技股份有限公司研发与合作中心首席科学家田仕林研究员为论文的共同通讯作者杏鑫|杏鑫平台注册·(中国)集团娱乐官方网站登录入口全站版。