齒肋赤藓（Syntrichia caninervis）是一種“幹而不死、死而複生”的苔藓植物龙8-long8·(国际)唯一官方网站球客岛-足球比分直播平台熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站，作爲荒漠生物結皮中的重要物種熊猫体育「中国Panda」App下载官方网站，對于沙漠生態系統的維持發揮了不可或缺的作用意昂凯捷4凯捷（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站LOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」，該物種能夠耐受多種極端脅迫環境龙8-long8·(国际)唯一官方网站意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光意昂凯捷4凯捷（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」，受到廣泛的關注杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站。然而苔藓是一個共生體系統熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站熊猫体育「中国Panda」App下载官方网站龙8-long8·(国际)唯一官方网站，單克隆株系難以獲取熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站，內共生菌序列汙染等難題阻礙了科學家獲得其高質量的基因組序列LOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」熊猫体育「中国Panda」App下载官方网站球客岛-足球比分直播平台。

中國科学院新疆生地所罩Z涝堆芯吭眻F隊针对上述难题LOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站意昂凯捷4凯捷（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」，于2025年1月22日球盟会·qmh(中国区)-官方网站LOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口，在期刊Plant Biotechnology Journal上在線發表文章“Telomere-to-telomere genome of the desiccation-tolerant desert moss Syntrichia caninervis illuminates Copia-dominant centromeric architecture”报道了齿肋赤藓及其内共生菌（类芽孢杆菌）的完整基因组序列球盟会·qmh(中国区)-官方网站球客岛-足球比分直播平台LOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」，获得了该物种13条染色体的完整无gap组装PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口，识别到了所有的端粒與着丝粒序列熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站，是迄今已报道的质量最高的苔藓基因组PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站。諾禾致源爲本研究提供了二代、三代建庫測序與部分分析服務杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口意昂凯捷4凯捷（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」。

主要結論

对单克隆组培体系的古尔班通古特沙漠齿肋赤藓进行測序意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光，利用二代Illumina reads龙8-long8·(国际)唯一官方网站， HiFi reads龙8-long8·(国际)唯一官方网站熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站， ONT 超长 reads和HiC reads组装获得的基因组序列（ScGur）包含13条无缺口的染色体LOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」，总长度爲 323.44 Mbp球客岛-足球比分直播平台，比莫哈韦沙漠齿肋赤藓基因组ScMoj v1（初始版本） 的组装结果（292.19 Mbp）长 31.25 Mb熊猫体育「中国Panda」App下载官方网站。contig的N50长度从 28.46 Kbp 提升到 24.41 Mbp杏耀平台代理注册(官方)网站/网页版登录入口熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站熊猫体育「中国Panda」App下载官方网站。填补了超过2万个染色体空白区域球客岛-足球比分直播平台LOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站，并注释多出1500多个蛋白编码基因；发现了古尔班通古特沙漠和莫哈韦沙漠两个生态型的齿肋赤藓在性染色体上存在较大的结构变异意昂凯捷4凯捷（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站球客岛-足球比分直播平台。

所有13条无缺口染色体的两端都含有端粒序列意昂凯捷4凯捷（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」，最终确定的基因组Qv值爲 51.142（准确性 > 99.999%）熊猫体育「中国Panda」App下载官方网站PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站，T2T基因组的LTR组装指数（LAI）爲 18.16PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站LOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」，BUSCO完整性值爲 98.1%球盟会·qmh(中国区)-官方网站意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光LOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」。该研究还获得了S. caninervis的葉綠體（123,124 bp）和线粒体（108,309 bp）的完整环状基因组球盟会·qmh(中国区)-官方网站。在组装过程中熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站LOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」，发现了一个单环状细菌基因组LOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站，大小爲 6,933,718 bp意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光，其基因组與解纤维巨大芽孢杆菌（Paenibacillus cellulosilyticusLOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」，NCBI 登录号：GCF_013347265.1）的三个基因组片段高度同源意昂凯捷4凯捷（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」球盟会·qmh(中国区)-官方网站意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光，表明 S. caninervis 配子體內存在一種內共生細菌——巨大芽孢杆菌屬（Paenibacillus sp.）意昂凯捷4凯捷（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」球客岛-足球比分直播平台意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光。

圖1 齿肋赤藓及其共生细菌的完整基因组组装结果

利用從頭設計合成的著絲粒蛋白抗體並結合CUT&Tag測序技术龙8-long8·(国际)唯一官方网站，精准定位了齿肋赤藓13条染色体的着丝粒区位置熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站，着丝粒长度范围爲81.5 Kbp到203.5 Kbp意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站，其中第5、6和8号染色体的着丝粒爲近端着丝粒或近端粒着丝粒意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光。研究发现了齿肋赤藓不同于被子植物的由Copia转座子主导型的着丝粒结构LOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」，且其着丝粒区更爲狭小意昂凯捷4凯捷（中国）官网「强保障平台,更省心娱乐」意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光球客岛-足球比分直播平台，着丝粒区的Copia转座子比其他区域的转位插入时间更近熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站球客岛-足球比分直播平台，这爲更深入研究陆地植物着丝粒结构的演化模式提供了重要参照LOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」球盟会·qmh(中国区)-官方网站PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站。
該齒肋赤藓T2T基因组共注释到677个转录因子基因龙8-long8·(国际)唯一官方网站球盟会·qmh(中国区)-官方网站，比ScMoj v1多135个龙8-long8·(国际)唯一官方网站球盟会·qmh(中国区)-官方网站PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站，此前未注释到的多个转录因子基因如RAV, TCP, BBR-BPC和VOZ均在此T2T基因组中得到完整的结构注释球盟会·qmh(中国区)-官方网站，研究结果显著提升了齿肋赤藓转录调控基因集的完整度球客岛-足球比分直播平台意昂体育5 -Kgame〈官方认证〉意昂5登录即享,美好时光龙8-long8·(国际)唯一官方网站。研究结果在对关键的耐脱水相关基因家族如LEA和ELIPs的分析中发现了更多的串联重复模式PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方直播平台网站，齿肋赤藓的Perfect T2T基因组组装结果爲后续的群体基因组学和基因功能等研究提供了坚实的数据支撑PG电子「中国china」官方网站-PG平台门户网站球客岛-足球比分直播平台LOGIN-U8国际「强保障平台,更省心娱乐」。