2025年2月熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站，浙江大学關雪莹研究员團隊球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录在线娱乐_用户注册(中国)娱乐中心首页大厅，在國際著名期刊Advanced Science發表了題爲“GhLPF1 Associated Network Is Involved with Cotton Lint Percentage Regulation Revealed by the Integrative Analysis of Spatial Transcriptome”的研究论文熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站U8国际·[中国区]有限公司官网，该研究通過空間轉錄組技术联合全基因組關聯分析（GWAS)fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88U8国际·[中国区]有限公司官网在线娱乐_用户注册(中国)娱乐中心首页大厅，鑒定到了與棉花纖維産量相關的主效基因GhLPF1MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网球速体育(中文)官网-我的账户，並且進一步解析了GhLPF1相關的分子調控網絡MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录。本研究中棉花胚珠空間轉錄組服務由諾禾致源提供球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛。

棉花纖維産量是棉花育種中的關鍵性狀娱乐中心-大厅.在线娱乐—用户注册入口熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站，棉纖維來源于胚珠表皮細胞球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网，爲紡織工業提供可持續的天然纖維來源在线娱乐_用户注册(中国)娱乐中心首页大厅。與纖維産量相關的性狀主要由棉花胚珠外珠被（OI）區域表皮的分子調控決定U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站。

在本研究中尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录，研究團隊构建了一个工作流程用于解析与纖維産量相關的功能調控网络熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站球速体育(中文)官网-我的账户。前期研究通過柔醱基因組重测序和全基因組關聯分析（GWAS）在线娱乐_用户注册(中国)娱乐中心首页大厅，已在A06染色體上定位到与皮棉産量（LP）相關的QTL位点球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站娱乐中心-大厅.在线娱乐—用户注册入口。随後娱乐中心-大厅.在线娱乐—用户注册入口球速体育(中文)官网-我的账户U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐，利用空間轉錄組技术辅助确定该QTL位点的關键效应基因GhLPF1尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网。通過轉基因棉花表型验证娱乐中心-大厅.在线娱乐—用户注册入口，进一步证实了GhLPF1對LP的調控功能U8国际·[中国区]有限公司官网熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站。整合RNA-Seq和CUT&Tag測序技術球速体育(中文)官网-我的账户fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88U8国际·[中国区]有限公司官网，研究發現了GhLPF1的直接下遊靶基因（DDGs）U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛，揭示GhLPF1對其DDGs具有轉錄抑制作用球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛U8国际·[中国区]有限公司官网。通過空間轉錄組和常规的轉錄組分析娱乐中心-大厅.在线娱乐—用户注册入口熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛，发现GhLPF1-DDGs在棉纖維起始分化期（OI）優先表達球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88在线娱乐_用户注册(中国)娱乐中心首页大厅，且其表達變異與LP呈顯著負相關fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网。本研究鑒定出一個新的R2R3型MYB編碼基因GhLPF1及其調控网络U8国际·[中国区]有限公司官网在线娱乐_用户注册(中国)娱乐中心首页大厅尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录，为通過分子育種提升陸地棉纖維産量提供了理论依据fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录。

圖1 研究工作流程

研究結果

1.GhLPF1是ChrA06染色體上LP數量性狀基因座（QTL）相關的候選基因球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛。

研究團隊此前报道了在陸地棉栽培种中发现的一个与皮棉率（LP）相關的稳定數量性狀基因座（QTL）U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐，该QTL位于A06染色體上球速体育(中文)官网-我的账户在线娱乐_用户注册(中国)娱乐中心首页大厅娱乐中心-大厅.在线娱乐—用户注册入口，命名为QTL-LP-ChrA06尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛。棉纖維从开花後0至3天（DPA）开始由胚珠表皮细胞分化形成在线娱乐_用户注册(中国)娱乐中心首页大厅球速体育(中文)官网-我的账户，约20-30%的胚珠表皮细胞可分化为纖維细胞U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐娱乐中心-大厅.在线娱乐—用户注册入口，因此每个胚珠的纖維起始數量是决定纖維産量的重要因素娱乐中心-大厅.在线娱乐—用户注册入口熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88。傳統bulk-RNA测序技术难以精准定位胚珠表皮细胞层的候選基因MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网。为解析QTL-LP-ChrA06中的關键效应基因U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录，本研究采用10× Genomics Visium空間轉錄組技术构建了1-DPA棉花胚珠空間轉錄組圖谱球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站。每个組织切片共获得531个空間spot点尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录在线娱乐_用户注册(中国)娱乐中心首页大厅，每个点中位检出基因數为4917个U8国际·[中国区]有限公司官网在线娱乐_用户注册(中国)娱乐中心首页大厅尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录，UMI數为11004个球速体育(中文)官网-我的账户娱乐中心-大厅.在线娱乐—用户注册入口U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐。通過UMAP降維分析MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网，1-DPA棉花胚珠空間轉錄組數据被聚类为7个亚群U8国际·[中国区]有限公司官网尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录，分别對应珠孔端外珠被（OI）、珠柄、内珠被（II）和胚囊（ES）MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛娱乐中心-大厅.在线娱乐—用户注册入口。值得注意的是MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网，分布于胚珠表皮的纖維细胞在空間圖谱中呈现四类空間特征：珠孔端OI区域、合点端OI区域、OI合点区域及部分珠柄区域球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛。基于此娱乐中心-大厅.在线娱乐—用户注册入口球速体育(中文)官网-我的账户，研究成功构建并可视化1-DPA棉花胚珠纵切面的细胞类型基因表达圖谱球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛U8国际·[中国区]有限公司官网。

通過UMAP分析和空間圖谱特征显示球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛，GH_A06G0905在1-DPA胚珠表皮中特异性表达在线娱乐_用户注册(中国)娱乐中心首页大厅MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网，表明其在纖維发育中的潜在作用尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛。因此MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网球速体育(中文)官网-我的账户球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛，编码MYB轉錄因子的GH_A06G0905被選为陸地棉LP調控的候選基因娱乐中心-大厅.在线娱乐—用户注册入口fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88，命名为GhLPF1（LP調控因子1）尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录。

圖2 GhLPF1是与纖維産量性狀相關的候選基因

2.GhLPF1調控陸地棉的纖維産量性狀

爲驗證GhLPF1調控棉花纖維的功能娱乐中心-大厅.在线娱乐—用户注册入口在线娱乐_用户注册(中国)娱乐中心首页大厅尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录，本研究通過构建轉基因（35S::GhLPF1U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88，GhLPF1-OE）和基因敲除株系（GhLPF1-CR）球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛在线娱乐_用户注册(中国)娱乐中心首页大厅。選取三个GhLPF1-OE和三個GhLPF1-CR株系进行纖維性狀观测U8国际·[中国区]有限公司官网熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站。

所有轉基因株系的整體植株在生长过程中未表现明显表型差异娱乐中心-大厅.在线娱乐—用户注册入口球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛。GhLPF1-CR株系的皮棉水平降低娱乐中心-大厅.在线娱乐—用户注册入口U8国际·[中国区]有限公司官网。GhLPF1-CR株系的表型差異表明GhLPF1是皮棉率的關键調控因子在线娱乐_用户注册(中国)娱乐中心首页大厅球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛，这与QTL_LP_ChrA06位点的功能相關性一致球速体育(中文)官网-我的账户U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐。综上尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录，研究认为GhLPF1参与纖維发育的調控网络在线娱乐_用户注册(中国)娱乐中心首页大厅球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛。

圖3 GhLPF1改变了轉基因棉花的LP和SI

3.miR828調控下GhLPF1的轉錄後水平調控

爲揭示GhLPF1是否存在轉錄後調控MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网，本研究进行了小RNA靶向筛選MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网娱乐中心-大厅.在线娱乐—用户注册入口，发现GhLPF1第三個外顯子存在miR858和miR828的两个反向互补结合位点尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录。既往研究表明棉花miR828和miR858在早期胚珠中高表达在线娱乐_用户注册(中国)娱乐中心首页大厅，因此推测这些miRNA可能通過切割内源GhLPF1轉錄本来抑制其翻译球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛，而qRT-PCR检测不受影响尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐球速体育(中文)官网-我的账户。通過比對陸地棉纖維和叶片的降解組數据熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网娱乐中心-大厅.在线娱乐—用户注册入口，在miR828靶位点观察到明显的切割峰U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐娱乐中心-大厅.在线娱乐—用户注册入口球速体育(中文)官网-我的账户。降解RNA片段在5-20 DPA纖維伸长阶段逐渐积累球速体育(中文)官网-我的账户娱乐中心-大厅.在线娱乐—用户注册入口尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录，成熟期达到峰值U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐，与GhLPF1 RNA轉錄本在相同发育阶段的积累呈负相關娱乐中心-大厅.在线娱乐—用户注册入口，提示miR828對GhLPF1 mRNA的切割与纖維发育相關在线娱乐_用户注册(中国)娱乐中心首页大厅。

通過双荧光素酶报告系统验证也证实了内源GhLPF1 mRNA在轉錄後水平受miR828調控MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网在线娱乐_用户注册(中国)娱乐中心首页大厅U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐。

圖4 GhLPF1 mRNA在轉錄後水平上受miR828調控

該研究還整合RNA測序和CUT&Tag測序技術娱乐中心-大厅.在线娱乐—用户注册入口，成功解析了GhLPF1的直接調控网络娱乐中心-大厅.在线娱乐—用户注册入口MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网，证实其作为轉錄抑制因子通過结合靶标基因的启动子区域球速体育(中文)官网-我的账户fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88，实现對下游靶基因（如GhEXP2和GhXTH4）表达的负向調控作用MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛。这种分子机制的阐明为解析棉花纖維发育的表观遗传調控路径提供了新视角U8国际·[中国区]有限公司官网。

圖5  GhLPF1是胚珠表皮层中的轉錄抑制因子

此外MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网，根据空間轉錄組分析結果球速体育(中文)官网-我的账户MG不朽情缘·官方app网站有限公司官网U8国际·科技赋能场景,更省心娱乐，GhLPF1-DDGs基因在胚珠發育過程中特異性地富集于外珠被和珠柄區域球客岛_球客直播_足球直播_体育直播_nba直播_球客岛U8国际·[中国区]有限公司官网，其時空表達模式與GhLPF1基因表現出高度相似性fun88·(乐天堂)中国区官网_FUN88熊猫体育-【中国区】Panda SPORTS 官方平台网站。

圖6 GhLPF1直接抑制GhHB6的表達