楊柳科植物是具有重要商業價值的樹木熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,烏柳(Salix cheilophila) 是西藏的優勢物種球友(官方)App下载-球友直播球友直播-球友直播app下载_球友直播appK8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口,具有廣泛的生態適應性(是一種對各類極端環境條件適應性較強的樹種)尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口杏宇注册登录-平台官网,從高海拔到低海拔都有分布球友直播-球友直播app下载_球友直播app杏宇注册登录-平台官网,在沙漠綠化工作中具有關鍵作用球友(官方)App下载-球友直播K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台,對該物種進行研究有助于對環境適應的進化特征進行分析杏宇注册登录-平台官网球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台。
中國科学院新疆生地所罩Z涝堆芯吭眻F隊與南京林业大学合作完成了乌柳端粒到端粒的高质量基因组的组装和注释尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录杏宇注册登录-平台官网,获得了全部19條染色體的完整無gap組裝球友(官方)App下载-球友直播,單堿基准確度達到99.99%以上尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录,是迄今已報道的楊柳科植物第一套T2T基因組918博天堂(中国区)-官方网站。該成果發表在期刊Plant Communications上熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台球友(官方)App下载-球友直播918博天堂(中国区)-官方网站,文章題目“A telomere-to-telomere genome assembly of Salix cheilophila reveals its evolutionary signatures for environmental adaptation”球友(官方)App下载-球友直播。諾禾致源爲本研究提供了二代、三代建庫測序與部分分析服務意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台球友直播-球友直播app下载_球友直播app。
主要結論
利用PacBio HiFi reads (59×)、ONT超长reads (93×)和Illumina 短reads (125×)进行乌柳基因组的组装918博天堂(中国区)-官方网站,组装contig N50爲12.7MbK8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口杏宇注册登录-平台官网,共计获得19条染色体K8·凯发【中国区】集团旗舰厅官网登录入口意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,基因组大小343Mb球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台杏宇注册登录-平台官网,在所有19条染色体上均检測到了7碱基的端粒重复序列杏宇注册登录-平台官网,其中14条染色体的两端都有端粒重复特征918博天堂(中国区)-官方网站。除核基因组外kg体育·(中国China)官方网站918博天堂(中国区)-官方网站熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,还获得了完整的环状叶绿体 (155614 bp) 和线粒体 (640032 bp) 基因组球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,其线粒体基因组包含三条环状染色体杏宇注册登录-平台官网918博天堂(中国区)-官方网站,长度分别爲 264703、206378和168951bp熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台。基因组BUSCO值爲98.7%球速体育(中文)官方网站 - 最全赛事直播平台球友(官方)App下载-球友直播,mapping率99.04%kg体育·(中国China)官方网站球友(官方)App下载-球友直播杏宇注册登录-平台官网,coverage 99.71%球友(官方)App下载-球友直播熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,QV值42.76球友直播-球友直播app下载_球友直播appkg体育·(中国China)官方网站918博天堂(中国区)-官方网站。基因组共注释到26397个基因意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台,重复序列占基因组的 40.95%918博天堂(中国区)-官方网站杏宇注册登录-平台官网意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台,预測到 9346 个非编码 RNA熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台杏宇注册登录-平台官网意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台。
該研究還利用多個楊柳科基因組內部的共線性重構了楊柳科基因組加倍前的9條祖先染色體球友直播-球友直播app下载_球友直播app,對烏柳的著絲粒結構進行詳細的結構解析發現其存在不同類型的著絲粒重複序列單體尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录球友直播-球友直播app下载_球友直播app。
基因組分析確定了 1413 个正向选择基因、275个显著扩增的基因家族和 759 个串联复制的基因簇意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台kg体育·(中国China)官方网站。其中19个基因存在于所有三个类别中熊猫体育【中国版权】官方网站 - 最全赛事直播平台,强调了它们在适应中的潜在重要性918博天堂(中国区)-官方网站意昂4凯捷体育(中国)数字娱乐技术创新平台。
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圖1 杨属和柳属基因组祖先核型重构和演化路径球友直播-球友直播app下载_球友直播appkg体育·(中国China)官方网站尊龙时凯人生就是搏[中国]官网登录,以及乌柳高原和荒漠环境适应性演化关键靶点的靶定與功能验证
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參考文獻:
[1] Gao B, Sun PC, Song YC, Chen MX, Zhang DY, Liu YG, Dai T, Zhu FY. A telomere-to-telomere genome assembly of Salix cheilophila reveals its evolutionary signatures for environmental adaptation. Plant Commun. 2025 Feb 10;6(2):101182. doi: 10.1016/j.xplc.2024.101182.
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