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全基因組甲基化測序

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Transgenerational inheritance of acquired epigenetic signatures at CpG islands in mice

期刊：Cell
影響因子：66.85
合作單位：哈佛醫學院/麻省總醫院癌症研究中心
發表年份：2023年6月

一、研究背景

近年來意昂体育「强保障平台,让娱乐更有趣!」九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌（首页）EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」，許多研究發現EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」，DNA甲基化異常與多種癌症密切相關login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台CQ9电子·(china)唯一官方网站澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站。癌症在DNA甲基化水平上有兩個主要變化特征意昂体育「强保障平台,让娱乐更有趣!」Zoty中欧·(中国)体育官方网站乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户，CpG島(CGIs)的局部高甲基化導致基因沈默EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」，這是腫瘤抑制基因失活的一種成熟機制Zoty中欧·(中国)体育官方网站EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」，但低甲基化相關基因沈默的功能後果和形成這些結構域的潛在選擇壓力尚不明確login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌（首页）CQ9电子·(china)唯一官方网站。

二、研究結果

1.鑒定單個轉移性前列腺癌細胞中共享的核心PMD和PMI
爲了表征單個轉移性前列腺癌細胞的全基因組DNA甲基化特征九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌（首页），通過單細胞多組學測序分析發現澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站HOME-杏耀娱乐-杏耀注册登录平台Zoty中欧·(中国)体育官方网站，與單個CGIs通常在基因調控區域周圍表現出局竈性高甲基化相反杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台，前列腺腫瘤細胞中的低甲基化區域跨越了非常大的基因貧乏區域意昂体育「强保障平台,让娱乐更有趣!」杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站Zoty中欧·(中国)体育官方网站，這與之前描述的PMDs一致乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户。總的來說CQ9电子·(china)唯一官方网站九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌（首页），在前列腺癌基因組中鑒定了1496個PMDsZoty中欧·(中国)体育官方网站，平均大小爲1.2MbHOME-杏耀娱乐-杏耀注册登录平台Zoty中欧·(中国)体育官方网站，這個數字與以前基于多個晚期癌症的大規模腫瘤測序結果一致杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站Zoty中欧·(中国)体育官方网站。與大的基因貧乏PMDs相反澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌（首页），穿插在低甲基化結構域內的1412個PMIs是基因豐富的Zoty中欧·(中国)体育官方网站澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」，具有尖銳的甲基化邊界EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站HOME-杏耀娱乐-杏耀注册登录平台，包括單個基因或一小部分基因九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌（首页）login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台。正如在其他癌症中所證明的那樣Zoty中欧·(中国)体育官方网站HOME-杏耀娱乐-杏耀注册登录平台九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌（首页），PMDs是基因貧乏的CQ9电子·(china)唯一官方网站EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」，並且強烈富集一些內源性逆轉錄病毒元件(ERVs)Zoty中欧·(中国)体育官方网站，特別是長末端重複序列(LTRs)CQ9电子·(china)唯一官方网站。
2.核心pmd的低甲基化是前列腺腫瘤發生的早期事件
先前研究表明杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」，乳腺癌和結腸癌的PMDs表現出活性染色質標記(H3K4me1/3、H3K27ac和H3K36me3)的缺失和抑制性組蛋白修飾的富集Zoty中欧·(中国)体育官方网站CQ9电子·(china)唯一官方网站乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户。使用ChIP-seq分析培養細胞系染色質景觀HOME-杏耀娱乐-杏耀注册登录平台Zoty中欧·(中国)体育官方网站CQ9电子·(china)唯一官方网站，對前列腺癌細胞(LNCaP和22Rv1)的分析證實CQ9电子·(china)唯一官方网站，抑制性H3K9me3標記位于中心CQ9电子·(china)唯一官方网站九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌（首页），H3K27me3位于低甲基化結構域的邊界杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站。與惡性腫瘤相關的變化主要與H3K27me3沈積有關EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」。
3.CD1A-IFI16基因簇的PMD相關沈默
CD1A-IFI16基因表達的抑制出現在DNA低甲基化（GS6）的最早時間點CQ9电子·(china)唯一官方网站，並且隨著DNA低甲基化的進展而持續存在login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台，提示存在潛在的阈值效應EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」。因此CQ9电子·(china)唯一官方网站，CD1A-IFI16簇中的免疫相關基因是癌症低甲基化誘導的轉錄沈默的最早靶點之一login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站Zoty中欧·(中国)体育官方网站。
4.CD1A-IFI16位點的低甲基化相關沈默的功能再現
觀察結果進一步支持了染色質沈默標記在抑制CD1A-IFI16位點和其他pmd中的編碼基因中的作用EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台。
5.脂質抗原呈遞或幹擾素誘導基因的重新表達可在小鼠模型中恢複抗腫瘤免疫
在dna低甲基化诱导沉默的癌细胞中乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户HOME-杏耀娱乐-杏耀注册登录平台九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌（首页），CD1或IFI16小鼠同源物的异位恢复表达抑制了肿瘤的形成EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」Zoty中欧·(中国)体育官方网站login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台，这一发现仅在具有免疫能力的小鼠中明显乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户CQ9电子·(china)唯一官方网站澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站，并与选择性增加抗肿瘤活性的证据相关乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户。我们的研究结果表明杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台，至少有两种不同的免疫群体因CD1A-IFI16位点（受Cd1d1调节的NKT细胞和受Ifi204影响的细胞毒性CD8+ T细胞）的沉默而受损EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」CQ9电子·(china)唯一官方网站，这表明该多基因位点在肿瘤发生中具有复杂的免疫调节功能login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台。
6.利用納米孔測序技術檢測血液標本中ctc來源的DNA低甲基化
長程低甲基化結構域是前列腺癌的普遍特征九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌（首页）意昂体育「强保障平台,让娱乐更有趣!」EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」，它們可以從患者來源的血液標本中罕見的ctc中檢測到CQ9电子·(china)唯一官方网站。納米孔測序的簡單性和成本效益提高了基于低甲基化的癌症檢測的可能性HOME-杏耀娱乐-杏耀注册登录平台。

三、研究結論

該研究對于深入了解腫瘤發生機制具有重要意義澳门人威泥斯娱乐官方网站(中国)集团娱乐官方网站EON5-意昂5Kgame「强保障平台,更省心注册」九游·会(J.9)集团官网 - 真人游戏第一品牌（首页），它揭示了早期腫瘤發生中的表觀遺傳學變化以及低甲基化區域內共定位基因的重要性Zoty中欧·(中国)体育官方网站。此外CQ9电子·(china)唯一官方网站HOME-杏耀娱乐-杏耀注册登录平台意昂体育「强保障平台,让娱乐更有趣!」，該研究還發現低甲基化區域可以在富含CTC的血液樣本中進行檢測乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户Zoty中欧·(中国)体育官方网站，這爲腫瘤的早期檢測和治療提供了新的思路login_杏宇·(中国官方)代理招商直营平台杏鑫娱乐|杏鑫平台-专为杏鑫提供注册登录服务的网站乐天堂fun88·（官网）娱乐中心 -我的账户。

四、參考文獻

Guo H, Vuille JA, Wittner BS, Lachtara EM, Hou Y, Lin M, Zhao T, Raman AT, Russell HC, Reeves BA, Pleskow HM, Wu CL, Gnirke A, Meissner A, Efstathiou JA, Lee RJ, Toner M, Aryee MJ, Lawrence MS, Miyamoto DT, Maheswaran S, Haber DA. DNA hypomethylation silences anti-tumor immune genes in early prostate cancer and CTCs. Cell. 2023 Jun 22;186(13):2765-2782.e28. doi: 10.1016/j.cell.2023.05.028. Epub 2023 Jun 15. PMID: 37327786; PMCID: PMC10436379.