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分子育種

表型處理

  • 對于GS分析意昂体育·(China)体育官方网站-EON SPORTS球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口,首先對其表型進行過濾意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光官网- 杏宇注册| 一站式娱乐平台- 会员登陆中心,去掉極端值球友直播,球友体育,球友足球直播,球友体育直播官网- 杏宇注册| 一站式娱乐平台- 会员登陆中心意昂体育·(China)体育官方网站-EON SPORTS。對所有表型進行正態分布檢驗K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口球速体育(中文)官网-我的账户意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光,繪制表型分布圖澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口。

    表型直方分布彙總示例圖

育種值估算

  • 模型准确性是评价结果准确性的重要标准球速体育(中文)官网-我的账户Z6尊龙旗舰厅官网入口·凯时(中国区)官方网站官网- 杏宇注册| 一站式娱乐平台- 会员登陆中心,模型准确性和样本数目等有直接关系意昂体育·(China)体育官方网站-EON SPORTS,样本数目越大K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口熊猫体育【China】官方网站- Panda SPORTS,模型准确性越高球速体育(中文)官网-我的账户Z6尊龙旗舰厅官网入口·凯时(中国区)官方网站。目前諾禾致源已开发的育種值估算模型有gBLUP 熊猫体育【China】官方网站- Panda SPORTS官网- 杏宇注册| 一站式娱乐平台- 会员登陆中心意昂体育·(China)体育官方网站-EON SPORTS,rrBLUP意昂体育·(China)体育官方网站-EON SPORTS澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站,Bayes A(BA)澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站Z6尊龙旗舰厅官网入口·凯时(中国区)官方网站,Bayes B(BB)澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站球速体育(中文)官网-我的账户意昂体育·(China)体育官方网站-EON SPORTS,Bayes C(BC)K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光,Bayesian Lasso(BL)熊猫体育【China】官方网站- Panda SPORTS,Bayes Ridge Regression(BRR)、机器学习和深度学习模型球速体育(中文)官网-我的账户球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光。使用上述多种方法对育种值进行估算并进行模型准确性评价熊猫体育【China】官方网站- Panda SPORTS球速体育(中文)官网-我的账户意昂体育·(China)体育官方网站-EON SPORTS。

    不同模型准確性評估結果

    上述方法中球速体育(中文)官网-我的账户,除gBLUP模型外K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口Z6尊龙旗舰厅官网入口·凯时(中国区)官方网站,其余模型均是兩步法澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站Z6尊龙旗舰厅官网入口·凯时(中国区)官方网站K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口,在估算GEBV的同時Z6尊龙旗舰厅官网入口·凯时(中国区)官方网站,會對SNP位點的效應值進行估算球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口,並以表格形式呈現意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光Z6尊龙旗舰厅官网入口·凯时(中国区)官方网站意昂体育·(China)体育官方网站-EON SPORTS。同時還會繪制不同方法計算出的SNP效應值的曼哈頓圖熊猫体育【China】官方网站- Panda SPORTS球速体育(中文)官网-我的账户澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站。

    SNP效應值曼哈頓示例圖

    通過統計多個模型的結果球友直播,球友体育,球友足球直播,球友体育直播Z6尊龙旗舰厅官网入口·凯时(中国区)官方网站澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站,根據GEBV的排序(由大到幸獍禾逵4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光球友直播,球友体育,球友足球直播,球友体育直播球速体育(中文)官网-我的账户。㎏8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口,選出GEBV最高的5%做爲育種樣本澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站,多個模型選育樣本彙總結果將以表格形式呈現球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口,同時繪制多個模型共選育樣本繪制韋恩圖球速体育(中文)官网-我的账户熊猫体育【China】官方网站- Panda SPORTS意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光。

    多模型的結果韋恩示例圖

遺傳力計算

  • 遺傳力 (Heritability) 又称遗传率K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口,指遗传方差在总方差(表型方差)中所占的比值澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站Z6尊龙旗舰厅官网入口·凯时(中国区)官方网站K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口。遺傳力表明某一性状受到遗传控制的程度球友会QY(千亿中国)有限公司-会员入口。它介于0到1之间官网- 杏宇注册| 一站式娱乐平台- 会员登陆中心意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光熊猫体育【China】官方网站- Panda SPORTS,当遺傳力为1时球友直播,球友体育,球友足球直播,球友体育直播澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站,表型变异完全由遗传因素决定球友直播,球友体育,球友足球直播,球友体育直播澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口,当遺傳力为0时表型变异由环境因素决定球速体育(中文)官网-我的账户意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光K8·凯发集团【China版权】官方网站登录入口。各性状遺傳力结果将以表格进行展示球友直播,球友体育,球友足球直播,球友体育直播。
    表型 遺傳力 標准誤差
    Trait1 0.858 0.089
    Trait2 0.743 0.090
    Trait3 17322701 0.106
    Trait4 0.785 0.091
    Trait5 0.629 0.112

候選樣本育種值預測

  • 输入候选样本基因型球友直播,球友体育,球友足球直播,球友体育直播,使用训练模型对候选样本进行预测球速体育(中文)官网-我的账户意昂体育4凯捷 -〈官方认证〉意昂4凯捷登录即享,美好时光球友直播,球友体育,球友足球直播,球友体育直播,根据客户需求可选用最优模型/多模型进行预测澳·门人威·尼·斯·娱·乐·(中国)集团娱乐官方网站。对于多种表型预测官网- 杏宇注册| 一站式娱乐平台- 会员登陆中心,可根据客户需求按照Top排序或权重筛选等方式输出最优候选样本及其综合育种值意昂体育·(China)体育官方网站-EON SPORTS。候選樣本育種值預測也可搭载至諾禾致源智能育种平台中进行候选样本的育种值计算Z6尊龙旗舰厅官网入口·凯时(中国区)官方网站。

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